RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468310.5

PRKCZ-208, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 5

Gene PRKCZ, Length 690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-208	ENST00000468310	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
PRKCZ-208	ENST00000468310	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
PRKCZ-208	ENST00000468310	PASK	Q96RG2	1323 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PRKCZ-208	ENST00000468310	TMC4	Q7Z404	712 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PRKCZ-208	ENST00000468310	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PRKCZ-208	ENST00000468310	LTBP1	Q14766	1721 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PRKCZ-208	ENST00000468310	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
PRKCZ-208	ENST00000468310	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PRKCZ-208	ENST00000468310	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PRKCZ-208	ENST00000468310	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
PRKCZ-208	ENST00000468310	MYD88	Q99836	296 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PRKCZ-208	ENST00000468310	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
PRKCZ-208	ENST00000468310	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PRKCZ-208	ENST00000468310	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
PRKCZ-208	ENST00000468310	SCNN1D	P51172	638 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PRKCZ-208	ENST00000468310	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
PRKCZ-208	ENST00000468310	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
PRKCZ-208	ENST00000468310	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
PRKCZ-208	ENST00000468310	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
PRKCZ-208	ENST00000468310	EPS15	P42566	896 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PRKCZ-208	ENST00000468310	CNTROB	Q8N137	903 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PRKCZ-208	ENST00000468310	MRS2	Q9HD23	443 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PRKCZ-208	ENST00000468310	ANP32C	O43423	234 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PRKCZ-208	ENST00000468310	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PRKCZ-208	ENST00000468310	TSPYL6	Q8N831	410 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PRKCZ-208	ENST00000468310	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
PRKCZ-208	ENST00000468310	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
PRKCZ-208	ENST00000468310	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
PRKCZ-208	ENST00000468310	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PRKCZ-208	ENST00000468310	CXCL9	Q07325	125 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PRKCZ-208	ENST00000468310	CCDC27	Q2M243	656 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PRKCZ-208	ENST00000468310	WWC1	Q8IX03	1113 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PRKCZ-208	ENST00000468310	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
PRKCZ-208	ENST00000468310	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PRKCZ-208	ENST00000468310	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PRKCZ-208	ENST00000468310	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
PRKCZ-208	ENST00000468310	COL4A1	P02462	1669 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PRKCZ-208	ENST00000468310	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PRKCZ-208	ENST00000468310	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
PRKCZ-208	ENST00000468310	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
PRKCZ-208	ENST00000468310	STK31	Q9BXU1	1019 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PRKCZ-208	ENST00000468310	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
PRKCZ-208	ENST00000468310	RAD17	O75943	681 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PRKCZ-208	ENST00000468310	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
PRKCZ-208	ENST00000468310	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
PRKCZ-208	ENST00000468310	TNIP1	Q15025	636 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PRKCZ-208	ENST00000468310	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PRKCZ-208	ENST00000468310	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PRKCZ-208	ENST00000468310	CNTNAP1	P78357	1384 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PRKCZ-208	ENST00000468310	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
PRKCZ-208	ENST00000468310	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
PRKCZ-208	ENST00000468310	C6orf229	H3BNL8	230 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PRKCZ-208	ENST00000468310	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
PRKCZ-208	ENST00000468310	GPSM2	P81274	684 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PRKCZ-208	ENST00000468310	WASHC4	Q2M389	1173 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PRKCZ-208	ENST00000468310	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
PRKCZ-208	ENST00000468310	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
PRKCZ-208	ENST00000468310	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PRKCZ-208	ENST00000468310	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
PRKCZ-208	ENST00000468310	KSR2	Q6VAB6	950 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PRKCZ-208	ENST00000468310	IL16	Q14005	1332 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PRKCZ-208	ENST00000468310	RIMBP2	O15034	1052 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PRKCZ-208	ENST00000468310	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PRKCZ-208	ENST00000468310	PCNT	O95613	3336 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PRKCZ-208	ENST00000468310	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PRKCZ-208	ENST00000468310	PDE8A	O60658	829 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PRKCZ-208	ENST00000468310	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
PRKCZ-208	ENST00000468310	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PRKCZ-208	ENST00000468310	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PRKCZ-208	ENST00000468310	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
PRKCZ-208	ENST00000468310	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PRKCZ-208	ENST00000468310	YDJC	A8MPS7	323 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PRKCZ-208	ENST00000468310	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PRKCZ-208	ENST00000468310	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
PRKCZ-208	ENST00000468310	EYA3	Q99504	573 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PRKCZ-208	ENST00000468310	POLL	Q9UGP5	575 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PRKCZ-208	ENST00000468310	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
PRKCZ-208	ENST00000468310	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
PRKCZ-208	ENST00000468310	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PRKCZ-208	ENST00000468310	SLC4A2	P04920	1241 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PRKCZ-208	ENST00000468310	VEGFB	P49765	207 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PRKCZ-208	ENST00000468310	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PRKCZ-208	ENST00000468310	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PRKCZ-208	ENST00000468310	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PRKCZ-208	ENST00000468310	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PRKCZ-208	ENST00000468310	IGKV5-2	P06315	115 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PRKCZ-208	ENST00000468310	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	27.58	■■■□□ 2.01
PRKCZ-208	ENST00000468310	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PRKCZ-208	ENST00000468310	G2E3	Q7L622	706 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PRKCZ-208	ENST00000468310	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
PRKCZ-208	ENST00000468310	MYH3	P11055	1940 aa		27.57	■■■□□ 2
PRKCZ-208	ENST00000468310	TRAF5	O00463	557 aa		27.57	■■■□□ 2
PRKCZ-208	ENST00000468310	ECE2	O60344	883 aa		27.57	■■■□□ 2
PRKCZ-208	ENST00000468310	DOK7	Q18PE1	504 aa		27.57	■■■□□ 2
PRKCZ-208	ENST00000468310	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
PRKCZ-208	ENST00000468310	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
PRKCZ-208	ENST00000468310	RASSF10	A6NK89	507 aa		27.56	■■■□□ 2
PRKCZ-208	ENST00000468310		G3V3G9	751 aa		27.56	■■■□□ 2
PRKCZ-208	ENST00000468310	PSMD14	O00487	310 aa		27.56	■■■□□ 2
PRKCZ-208	ENST00000468310	UFL1	O94874	794 aa		27.56	■■■□□ 2

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