RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466037.6

HOXB-AS3-204, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 522 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TIAM2Q8IVF5 1701 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SP8Q8IXZ3 490 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LINS1Q8NG48 757 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-204ENST00000466037 JDP2Q8WYK2 163 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CDHR2Q9BYE9 1310 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LAMB2P55268 1798 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KIF3CO14782 793 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GCKRQ14397 625 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-204ENST00000466037 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SUPT20HQ8NEM7 779 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RRAGCQ9HB90 399 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-204ENST00000466037 F6X3S4 739 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MPNDQ8N594 471 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LARGE2Q8N3Y3 721 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CTSWP56202 376 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RPS8P62241 208 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SNED1Q8TER0 1413 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 H7C1W4 665 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TOMM70O94826 608 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC51AQ86UW1 340 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PPIP5K2O43314 1243 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 VPS33BQ9H267 617 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BEND3Q5T5X7 828 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NIM1KQ8IY84 436 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SSH1Q8WYL5 1049 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PTPRCP08575 1304 aa25.08■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DDNO94850 711 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EIF6P56537 245 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AOC3Q16853 763 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TTLL11Q8NHH1 800 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FZD9O00144 591 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ALDH1L1O75891 902 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PLA2G12BQ9BX93 195 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF541Q9H0D2 1346 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IQCA1LA6NCM1 817 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C6orf229H3BNL8 230 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HSPA6P17066 643 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GREM2Q9H772 168 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TAF1P21675 1872 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GRM8O00222 908 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EYA3Q99504 573 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CASP7P55210 303 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GPSM2P81274 684 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GPC2Q8N158 579 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GJA3Q9Y6H8 435 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RTL9Q8NET4 1388 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-204ENST00000466037 WASHC4Q2M389 1173 aa25■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-204ENST00000466037 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CEP350Q5VT06 3117 aa25■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-204ENST00000466037 WDR90Q96KV7 1748 aa25■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SMC1BQ8NDV3 1235 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GGA1Q9UJY5 639 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNRF3Q9ULT6 936 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LRRC37AA6NMS7 1700 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ITGA6P23229 1130 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FSTL1Q12841 308 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM161AQ3B820 660 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MYH3P11055 1940 aa24.97■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-204ENST00000466037 UFL1O94874 794 aa24.97■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TBC1D16Q8TBP0 767 aa24.97■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MPHOSPH8Q99549 860 aa24.97■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.97■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-204ENST00000466037 POLLQ9UGP5 575 aa24.97■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HACL1Q9UJ83 578 aa24.97■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-204ENST00000466037 XDHP47989 1333 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-204ENST00000466037 POTECB2RU33 542 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-204ENST00000466037 G3V3G9 751 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RIMBP2O15034 1052 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CSF1RP07333 972 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DCAF8Q5TAQ9 597 aa24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms