RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440447.2

PTX4-202, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTX4, Length 1,117 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-202ENST00000440447 USP44Q9H0E7 712 aa23.02■■□□□ 1.28
PTX4-202ENST00000440447 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PTX4-202ENST00000440447 C21orf2O43822 256 aa23.01■■□□□ 1.27
PTX4-202ENST00000440447 GRAPQ13588 217 aa23.01■■□□□ 1.27
PTX4-202ENST00000440447 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.01■■□□□ 1.27
PTX4-202ENST00000440447 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
PTX4-202ENST00000440447 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
PTX4-202ENST00000440447 LAMB2P55268 1798 aa23■■□□□ 1.27
PTX4-202ENST00000440447 BBOX1O75936 387 aa23■■□□□ 1.27
PTX4-202ENST00000440447 MS4A1P11836 297 aa23■■□□□ 1.27
PTX4-202ENST00000440447 SOGA3Q5TF21 947 aa23■■□□□ 1.27
PTX4-202ENST00000440447 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa23■■□□□ 1.27
PTX4-202ENST00000440447 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PTX4-202ENST00000440447 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PTX4-202ENST00000440447 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.99■■□□□ 1.27
PTX4-202ENST00000440447 SUCLG2Q96I99 432 aa22.99■■□□□ 1.27
PTX4-202ENST00000440447 CSF1RP07333 972 aa22.98■■□□□ 1.27
PTX4-202ENST00000440447 FOXO4P98177 505 aa22.98■■□□□ 1.27
PTX4-202ENST00000440447 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.98■■□□□ 1.27
PTX4-202ENST00000440447 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PTX4-202ENST00000440447 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.98■■□□□ 1.27
PTX4-202ENST00000440447 PLIN1O60240 522 aa22.97■■□□□ 1.27
PTX4-202ENST00000440447 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PTX4-202ENST00000440447 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PTX4-202ENST00000440447 GREM2Q9H772 168 aa22.97■■□□□ 1.27
PTX4-202ENST00000440447 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.97■■□□□ 1.27
PTX4-202ENST00000440447 RPS8P62241 208 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PTX4-202ENST00000440447 CCDC93Q567U6 631 aa22.96■■□□□ 1.27
PTX4-202ENST00000440447 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.96■■□□□ 1.27
PTX4-202ENST00000440447 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.96■■□□□ 1.27
PTX4-202ENST00000440447 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.96■■□□□ 1.27
PTX4-202ENST00000440447 TMC4Q7Z404 712 aa22.96■■□□□ 1.27
PTX4-202ENST00000440447 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PTX4-202ENST00000440447 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.96■■□□□ 1.27
PTX4-202ENST00000440447 RTL9Q8NET4 1388 aa22.96■■□□□ 1.27
PTX4-202ENST00000440447 SLX4Q8IY92 1834 aa22.96■■□□□ 1.27
PTX4-202ENST00000440447 GNAI3P08754 354 aa22.95■■□□□ 1.26
PTX4-202ENST00000440447 RLBP1P12271 317 aa22.95■■□□□ 1.26
PTX4-202ENST00000440447 KAZALD1Q96I82 304 aa22.95■■□□□ 1.26
PTX4-202ENST00000440447 MEIS3Q99687 375 aa22.95■■□□□ 1.26
PTX4-202ENST00000440447 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.95■■□□□ 1.26
PTX4-202ENST00000440447 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.95■■□□□ 1.26
PTX4-202ENST00000440447 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PTX4-202ENST00000440447 FAM161AQ3B820 660 aa22.94■■□□□ 1.26
PTX4-202ENST00000440447 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.94■■□□□ 1.26
PTX4-202ENST00000440447 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.94■■□□□ 1.26
PTX4-202ENST00000440447 PANK1Q8TE04 598 aa22.94■■□□□ 1.26
PTX4-202ENST00000440447 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PTX4-202ENST00000440447 ITGA6P23229 1130 aa22.93■■□□□ 1.26
PTX4-202ENST00000440447 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.93■■□□□ 1.26
PTX4-202ENST00000440447 OLFM4Q6UX06 510 aa22.93■■□□□ 1.26
PTX4-202ENST00000440447 SP8Q8IXZ3 490 aa22.93■■□□□ 1.26
PTX4-202ENST00000440447 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.93■■□□□ 1.26
PTX4-202ENST00000440447 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX4-202ENST00000440447 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PTX4-202ENST00000440447 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PTX4-202ENST00000440447 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.91■■□□□ 1.26
PTX4-202ENST00000440447 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PTX4-202ENST00000440447 CACNA1SQ13698 1873 aa22.91■■□□□ 1.26
PTX4-202ENST00000440447 NFKBIEO00221 500 aa22.9■■□□□ 1.26
PTX4-202ENST00000440447 PDE3AQ14432 1141 aa22.9■■□□□ 1.26
PTX4-202ENST00000440447 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.9■■□□□ 1.26
PTX4-202ENST00000440447 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PTX4-202ENST00000440447 MYH3P11055 1940 aa22.89■■□□□ 1.25
PTX4-202ENST00000440447 RASSF7Q02833 373 aa22.89■■□□□ 1.25
PTX4-202ENST00000440447 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.89■■□□□ 1.25
PTX4-202ENST00000440447 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.89■■□□□ 1.25
PTX4-202ENST00000440447 UTRNP46939 3433 aa22.89■■□□□ 1.25
PTX4-202ENST00000440447 GNAI2P04899 355 aa22.88■■□□□ 1.25
PTX4-202ENST00000440447 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
PTX4-202ENST00000440447 SLC51AQ86UW1 340 aa22.88■■□□□ 1.25
PTX4-202ENST00000440447 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.88■■□□□ 1.25
PTX4-202ENST00000440447 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PTX4-202ENST00000440447 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.87■■□□□ 1.25
PTX4-202ENST00000440447 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PTX4-202ENST00000440447 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PTX4-202ENST00000440447 MPNDQ8N594 471 aa22.87■■□□□ 1.25
PTX4-202ENST00000440447 COG6Q9Y2V7 657 aa22.87■■□□□ 1.25
PTX4-202ENST00000440447 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PTX4-202ENST00000440447 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PTX4-202ENST00000440447 PSMD1Q99460 953 aa22.86■■□□□ 1.25
PTX4-202ENST00000440447 COL4A1P02462 1669 aa22.86■■□□□ 1.25
PTX4-202ENST00000440447 LMNB1P20700 586 aa22.85■■□□□ 1.25
PTX4-202ENST00000440447 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.85■■□□□ 1.25
PTX4-202ENST00000440447 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.85■■□□□ 1.25
PTX4-202ENST00000440447 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PTX4-202ENST00000440447 TAF1P21675 1872 aa22.85■■□□□ 1.25
PTX4-202ENST00000440447 SNED1Q8TER0 1413 aa22.84■■□□□ 1.25
PTX4-202ENST00000440447 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.84■■□□□ 1.25
PTX4-202ENST00000440447 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.84■■□□□ 1.25
PTX4-202ENST00000440447 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PTX4-202ENST00000440447 RNF181Q9P0P0 153 aa22.84■■□□□ 1.25
PTX4-202ENST00000440447 GPSM2P81274 684 aa22.83■■□□□ 1.25
PTX4-202ENST00000440447 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.83■■□□□ 1.25
PTX4-202ENST00000440447 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PTX4-202ENST00000440447 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
PTX4-202ENST00000440447 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.83■■□□□ 1.25
PTX4-202ENST00000440447 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.83■■□□□ 1.25
PTX4-202ENST00000440447 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PTX4-202ENST00000440447 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.82■■□□□ 1.24
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