RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440016.6

HOXD-AS2-202, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 999 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa34.43■■■■□ 3.1
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TAOK3Q9H2K8 898 aa34.43■■■■□ 3.1
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RNF181Q9P0P0 153 aa34.43■■■■□ 3.1
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LTBP3Q9NS15 1303 aa34.43■■■■□ 3.1
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SNED1Q8TER0 1413 aa34.43■■■■□ 3.1
HOXD-AS2-202ENST00000440016 COL4A1P02462 1669 aa34.43■■■■□ 3.1
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ALDH1L1O75891 902 aa34.42■■■■□ 3.1
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SLC51AQ86UW1 340 aa34.42■■■■□ 3.1
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP34.42■■■■□ 3.1
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP34.42■■■■□ 3.1
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BBOX1O75936 387 aa34.41■■■■□ 3.1
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LMNB1P20700 586 aa34.41■■■■□ 3.1
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa34.41■■■■□ 3.1
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CCDC152Q4G0S7 254 aa34.4■■■■□ 3.1
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RTKN2Q8IZC4 609 aa34.4■■■■□ 3.1
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa34.4■■■■□ 3.1
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TIAM2Q8IVF5 1701 aa34.39■■■■□ 3.1
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CTSWP56202 376 aa34.39■■■■□ 3.1
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP34.38■■■■□ 3.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PLA2G12BQ9BX93 195 aa34.38■■■■□ 3.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LRRC37AA6NMS7 1700 aa34.38■■■■□ 3.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KIF16BQ96L93 1317 aa34.37■■■■□ 3.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GRM8O00222 908 aa34.37■■■■□ 3.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SEC31BQ9NQW1 1179 aa34.37■■■■□ 3.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SP8Q8IXZ3 490 aa34.36■■■■□ 3.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TTLL11Q8NHH1 800 aa34.36■■■■□ 3.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TMC4Q7Z404 712 aa34.35■■■■□ 3.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BCAR3O75815 825 aa34.34■■■■□ 3.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GRIPAP1Q4V328 841 aa34.34■■■■□ 3.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP34.34■■■■□ 3.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PSMD1Q99460 953 aa34.33■■■■□ 3.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RPS8P62241 208 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.08
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ARHGAP45Q92619 1136 aa34.31■■■■□ 3.08
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GREM2Q9H772 168 aa34.31■■■■□ 3.08
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SPEF2Q9C093 1822 aa34.31■■■■□ 3.08
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RTL9Q8NET4 1388 aa34.31■■■■□ 3.08
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CSF1RP07333 972 aa34.29■■■■□ 3.08
HOXD-AS2-202ENST00000440016 UTYO14607 1347 aa34.29■■■■□ 3.08
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FOXO4P98177 505 aa34.28■■■■□ 3.08
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IARSP41252 1262 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.08
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CCT4P50991 539 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.08
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa34.26■■■■□ 3.08
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MPNDQ8N594 471 aa34.26■■■■□ 3.08
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.08
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.08
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.08
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FAM161AQ3B820 660 aa34.25■■■■□ 3.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 EPHA10Q5JZY3 1008 aa34.25■■■■□ 3.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP34.25■■■■□ 3.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LTBP1Q14766 1721 aa34.24■■■■□ 3.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DUOX1Q9NRD9 1551 aa34.24■■■■□ 3.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SUCLG2Q96I99 432 aa34.24■■■■□ 3.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ITGA6P23229 1130 aa34.23■■■■□ 3.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 USP44Q9H0E7 712 aa34.23■■■■□ 3.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRIM27P14373 513 aa34.22■■■■□ 3.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa34.22■■■■□ 3.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KAZALD1Q96I82 304 aa34.22■■■■□ 3.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LMBR1LQ6UX01 489 aa34.21■■■■□ 3.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SUPT20HQ8NEM7 779 aa34.21■■■■□ 3.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TNNQ9UQP3 1299 aa34.21■■■■□ 3.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 COL4A5P29400 1685 aa34.2■■■■□ 3.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GPSM2P81274 684 aa34.2■■■■□ 3.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CHMP3Q9Y3E7 222 aa34.2■■■■□ 3.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa34.19■■■■□ 3.06
HOXD-AS2-202ENST00000440016 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa34.17■■■■□ 3.06
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP34.17■■■■□ 3.06
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PPIP5K2O43314 1243 aa34.16■■■■□ 3.06
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LARGE2Q8N3Y3 721 aa34.16■■■■□ 3.06
HOXD-AS2-202ENST00000440016 VPS33BQ9H267 617 aa34.16■■■■□ 3.06
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP34.16■■■■□ 3.06
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KDM2BQ8NHM5 1336 aa34.15■■■■□ 3.06
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GLTPD2A6NH11 291 aa34.15■■■■□ 3.06
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
HOXD-AS2-202ENST00000440016 AOC3Q16853 763 aa34.15■■■■□ 3.06
HOXD-AS2-202ENST00000440016 JDP2Q8WYK2 163 aa34.15■■■■□ 3.06
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CLUAP1Q96AJ1 413 aa34.15■■■■□ 3.06
HOXD-AS2-202ENST00000440016 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PODXL2Q9NZ53 605 aa34.15■■■■□ 3.06
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa34.13■■■■□ 3.05
HOXD-AS2-202ENST00000440016 POLLQ9UGP5 575 aa34.13■■■■□ 3.05
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KIAA2012Q0VF49 1180 aa34.12■■■■□ 3.05
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CCDC57Q2TAC2 916 aa34.12■■■■□ 3.05
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DPY19L2Q6NUT2 758 aa34.12■■■■□ 3.05
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ANKRD44Q8N8A2 993 aa34.12■■■■□ 3.05
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TBC1D16Q8TBP0 767 aa34.12■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.1 ms