RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429299.2

LTB-210, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-210ENST00000429299 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
LTB-210ENST00000429299 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.6■■□□□ 1.69
LTB-210ENST00000429299 PCDH10Q9P2E7 1040 aa25.6■■□□□ 1.69
LTB-210ENST00000429299 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa25.6■■□□□ 1.69
LTB-210ENST00000429299 NOGQ13253 232 aa25.59■■□□□ 1.69
LTB-210ENST00000429299 CFAP44Q96MT7 982 aa25.59■■□□□ 1.69
LTB-210ENST00000429299 RAD17O75943 681 aa25.58■■□□□ 1.69
LTB-210ENST00000429299 ZNF408Q9H9D4 720 aa25.58■■□□□ 1.69
LTB-210ENST00000429299 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
LTB-210ENST00000429299 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.58■■□□□ 1.69
LTB-210ENST00000429299 H7C1D1 291 aa25.57■■□□□ 1.68
LTB-210ENST00000429299 DGKZQ13574 1117 aa25.57■■□□□ 1.68
LTB-210ENST00000429299 NFE2L2Q16236 605 aa25.56■■□□□ 1.68
LTB-210ENST00000429299 LRP10Q7Z4F1 713 aa25.56■■□□□ 1.68
LTB-210ENST00000429299 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa25.55■■□□□ 1.68
LTB-210ENST00000429299 PDIA6Q15084 440 aa25.55■■□□□ 1.68
LTB-210ENST00000429299 PLEKHF1Q96S99 279 aa25.55■■□□□ 1.68
LTB-210ENST00000429299 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
LTB-210ENST00000429299 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
LTB-210ENST00000429299 TRPM4Q8TD43 1214 aa25.54■■□□□ 1.68
LTB-210ENST00000429299 HUNKP57058 714 aa25.53■■□□□ 1.68
LTB-210ENST00000429299 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.53■■□□□ 1.68
LTB-210ENST00000429299 USP48Q86UV5 1035 aa25.53■■□□□ 1.68
LTB-210ENST00000429299 DPF2Q92785 391 aa25.53■■□□□ 1.68
LTB-210ENST00000429299 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
LTB-210ENST00000429299 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
LTB-210ENST00000429299 GRAPQ13588 217 aa25.52■■□□□ 1.68
LTB-210ENST00000429299 TMC4Q7Z404 712 aa25.52■■□□□ 1.68
LTB-210ENST00000429299 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
LTB-210ENST00000429299 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.52■■□□□ 1.68
LTB-210ENST00000429299 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
LTB-210ENST00000429299 ZIC5Q96T25 663 aa25.51■■□□□ 1.67
LTB-210ENST00000429299 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
LTB-210ENST00000429299 YDJCA8MPS7 323 aa25.5■■□□□ 1.67
LTB-210ENST00000429299 NLRP10Q86W26 655 aa25.5■■□□□ 1.67
LTB-210ENST00000429299 MICALL2Q8IY33 904 aa25.5■■□□□ 1.67
LTB-210ENST00000429299 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.5■■□□□ 1.67
LTB-210ENST00000429299 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
LTB-210ENST00000429299 SHTN1A0MZ66 631 aa25.48■■□□□ 1.67
LTB-210ENST00000429299 RGMBQ6NW40 437 aa25.48■■□□□ 1.67
LTB-210ENST00000429299 CCDC102AQ96A19 550 aa25.48■■□□□ 1.67
LTB-210ENST00000429299 SAGE1Q9NXZ1 904 aa25.48■■□□□ 1.67
LTB-210ENST00000429299 SH3TC1Q8TE82 1336 aa25.47■■□□□ 1.67
LTB-210ENST00000429299 TCIRG1Q13488 830 aa25.47■■□□□ 1.67
LTB-210ENST00000429299 WASHC4Q2M389 1173 aa25.47■■□□□ 1.67
LTB-210ENST00000429299 PROSER3Q2NL68 480 aa25.47■■□□□ 1.67
LTB-210ENST00000429299 COPS6Q7L5N1 327 aa25.47■■□□□ 1.67
LTB-210ENST00000429299 KRT26Q7Z3Y9 468 aa25.47■■□□□ 1.67
LTB-210ENST00000429299 C2orf69Q8N8R5 385 aa25.47■■□□□ 1.67
LTB-210ENST00000429299 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.47■■□□□ 1.67
LTB-210ENST00000429299 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
LTB-210ENST00000429299 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.46■■□□□ 1.67
LTB-210ENST00000429299 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
LTB-210ENST00000429299 SAMD7Q7Z3H4 446 aa25.46■■□□□ 1.67
LTB-210ENST00000429299 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
LTB-210ENST00000429299 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa25.46■■□□□ 1.67
LTB-210ENST00000429299 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
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LTB-210ENST00000429299 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
LTB-210ENST00000429299 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
LTB-210ENST00000429299 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
LTB-210ENST00000429299 XAGE3Q8WTP9 111 aa25.43■■□□□ 1.66
LTB-210ENST00000429299 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
LTB-210ENST00000429299 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
LTB-210ENST00000429299 DBNDD1Q9H9R9 158 aa25.41■■□□□ 1.66
LTB-210ENST00000429299 LAMB2P55268 1798 aa25.41■■□□□ 1.66
LTB-210ENST00000429299 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
LTB-210ENST00000429299 RNF186Q9NXI6 227 aa25.4■■□□□ 1.66
LTB-210ENST00000429299 C6orf229H3BNL8 230 aa25.39■■□□□ 1.66
LTB-210ENST00000429299 TRPA1O75762 1119 aa25.39■■□□□ 1.66
LTB-210ENST00000429299 EGFRP00533 1210 aa25.39■■□□□ 1.66
LTB-210ENST00000429299 RIPK4P57078 832 aa25.39■■□□□ 1.66
LTB-210ENST00000429299 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
LTB-210ENST00000429299 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
LTB-210ENST00000429299 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
LTB-210ENST00000429299 DUOX1Q9NRD9 1551 aa25.39■■□□□ 1.65
LTB-210ENST00000429299 RIMBP2O15034 1052 aa25.38■■□□□ 1.65
LTB-210ENST00000429299 NECTIN2Q92692 538 aa25.38■■□□□ 1.65
LTB-210ENST00000429299 EYA3Q99504 573 aa25.38■■□□□ 1.65
LTB-210ENST00000429299 POLLQ9UGP5 575 aa25.38■■□□□ 1.65
LTB-210ENST00000429299 TAF1P21675 1872 aa25.37■■□□□ 1.65
LTB-210ENST00000429299 ADM5C9JUS6 153 aa25.37■■□□□ 1.65
LTB-210ENST00000429299 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
LTB-210ENST00000429299 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
LTB-210ENST00000429299 ECE2O60344 883 aa25.36■■□□□ 1.65
LTB-210ENST00000429299 SULF1Q8IWU6 871 aa25.36■■□□□ 1.65
LTB-210ENST00000429299 CSRNP1Q96S65 589 aa25.36■■□□□ 1.65
LTB-210ENST00000429299 KCNQ5Q9NR82 932 aa25.36■■□□□ 1.65
LTB-210ENST00000429299 SLC10A3P09131 477 aa25.35■■□□□ 1.65
LTB-210ENST00000429299 GPSM2P81274 684 aa25.35■■□□□ 1.65
LTB-210ENST00000429299 LRRC37AA6NMS7 1700 aa25.34■■□□□ 1.65
LTB-210ENST00000429299 VIL1P09327 827 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
LTB-210ENST00000429299 SOX10P56693 466 aa25.34■■□□□ 1.65
LTB-210ENST00000429299 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.34■■□□□ 1.65
LTB-210ENST00000429299 DOK7Q18PE1 504 aa25.34■■□□□ 1.65
LTB-210ENST00000429299 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa25.34■■□□□ 1.65
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