RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428457.1

TNS3-204, Transcript of tensin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TNS3, Length 5,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3-204ENST00000428457 OGFRQ9NZT2 677 aa11.53□□□□□ -0.56
TNS3-204ENST00000428457 ABCF2Q9UG63 623 aa11.53□□□□□ -0.56
TNS3-204ENST00000428457 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa11.53□□□□□ -0.56
TNS3-204ENST00000428457 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa11.52□□□□□ -0.56
TNS3-204ENST00000428457 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa11.52□□□□□ -0.56
TNS3-204ENST00000428457 BAG3O95817 575 aa11.52□□□□□ -0.56
TNS3-204ENST00000428457 CCDC113Q9H0I3 377 aa11.52□□□□□ -0.56
TNS3-204ENST00000428457 JDP2Q8WYK2 163 aa11.52□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP11.52□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 HLA-DOAP06340 250 aa11.52□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 TAF4BQ92750 862 aa11.52□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 NLRP3Q96P20 1036 aa11.52□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 EYA3Q99504 573 aa11.52□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 ANKRD62A6NC57 917 aa11.51□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 IDH1O75874 414 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 AKAP4Q5JQC9 854 aa11.51□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 CCDC150Q8NCX0 1101 aa11.51□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 CABP5Q9NP86 173 aa11.51□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 CNNM3Q8NE01 707 aa11.51□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 CAPN2P17655 700 aa11.51□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 DYDC1Q8WWB3 177 aa11.51□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 ZNF76P36508 570 aa11.51□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 TRAF1Q13077 416 aa11.51□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 OGFOD1Q8N543 542 aa11.51□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 CLEC11AQ9Y240 323 aa11.51□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 ATP7AQ04656 1500 aa11.5□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 SPA17Q15506 151 aa11.5□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 TPTE2Q6XPS3 522 aa11.5□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 CCDC82Q8N4S0 544 aa11.5□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 ATP2C2O75185 946 aa11.5□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP11.5□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 FEZ1Q99689 392 aa11.5□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 MKNK2Q9HBH9 465 aa11.5□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 PHACTR2O75167 634 aa11.5□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP11.5□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 TYRO3Q06418 890 aa11.5□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 PTPRCP08575 1304 aa11.5□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 MAGI2Q86UL8 1455 aa11.5□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 FLT4P35916 1363 aa11.5□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 POTEB2H3BUK9 544 aa11.5□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 SYCP1Q15431 976 aa11.5□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 LUZP1Q86V48 1076 aa11.5□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 AOPEPQ8N6M6 819 aa11.5□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 DISP1Q96F81 1524 aa11.5□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 MCM3P25205 808 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 F13A1P00488 732 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 SLAIN2Q9P270 581 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 KIF20AO95235 890 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 MICALCLQ6ZW33 695 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 MICALL1Q8N3F8 863 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 USP21Q9UK80 565 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 PIK3R4Q99570 1358 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 PPP4R3AQ6IN85 833 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 FLAD1Q8NFF5 587 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 CUL5Q93034 780 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 ACSBG1Q96GR2 724 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 INCENPQ9NQS7 918 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 SYT10Q6XYQ8 523 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 BTG4Q9NY30 223 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 MYRIPQ8NFW9 859 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 DCAF5Q96JK2 942 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 VPS18Q9P253 973 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 FAM83GA6ND36 823 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 CAVIN2O95810 425 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 UBASH3AP57075 661 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 KDM2BQ8NHM5 1336 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 IVLP07476 585 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 TRAPPC3LQ5T215 181 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 ZBTB3Q9H5J0 574 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 MBIPQ9NS73 344 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 CFAP43Q8NDM7 1665 aa11.47□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP11.47□□□□□ -0.57
TNS3-204ENST00000428457 MEIS3Q99687 375 aa11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72 ms