RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424733.1

TTC3-AS1-201, TTC3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC3-AS1, Length 1,097 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-AS1-201ENST00000424733 ERCC6Q03468 1493 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 EPB42P16452 691 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 ZFATQ9P243 1243 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 MAP3K6O95382 1288 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 H2AFB2P0C5Z0 115 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 CPB1P15086 417 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 DGKZQ13574 1117 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 KRT25Q7Z3Z0 450 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 ARXQ96QS3 562 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 LPIN3Q9BQK8 851 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 VRTNQ9H8Y1 702 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 ZBTB42B2RXF5 422 aa8.61□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 TARSP26639 723 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 PLAURQ03405 335 aa8.61□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 GRIK5Q16478 980 aa8.61□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 MSL1Q68DK7 614 aa8.61□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.61□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 WEE1P30291 646 aa8.6□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 ARSDP51689 593 aa8.6□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 PCSK7Q16549 785 aa8.6□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 PERM1Q5SV97 790 aa8.6□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 ARTNQ5T4W7 220 aa8.6□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 IFT43Q96FT9 208 aa8.6□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 FRRS1LQ9P0K9 344 aa8.6□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 USP21Q9UK80 565 aa8.6□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 FOXO3O43524 673 aa8.59□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 MICAL2O94851 1124 aa8.59□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 TRPM4Q8TD43 1214 aa8.59□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 TP53INP1Q96A56 240 aa8.59□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
TTC3-AS1-201ENST00000424733 A6NJR5 290 aa8.58□□□□□ -1.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 SASH3O75995 380 aa8.58□□□□□ -1.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 RARAP10276 462 aa8.58□□□□□ -1.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 MYO19Q96H55 970 aa8.58□□□□□ -1.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 ZFP64Q9NPA5 681 aa8.58□□□□□ -1.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 GPLD1P80108 840 aa8.57□□□□□ -1.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 C11orf91Q3C1V1 193 aa8.57□□□□□ -1.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa8.57□□□□□ -1.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 FBXO11Q86XK2 927 aa8.57□□□□□ -1.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 DTWD1Q8N5C7 304 aa8.57□□□□□ -1.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 VTI1AQ96AJ9 217 aa8.57□□□□□ -1.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 C11orf16Q9NQ32 467 aa8.57□□□□□ -1.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 OPLAHO14841 1288 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 WFDC8Q8IUA0 241 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 LRFN2Q9ULH4 789 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 USP20Q9Y2K6 914 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 TMEM132AQ24JP5 1023 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 CFAP70Q5T0N1 1121 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 HFE2Q6ZVN8 426 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 TTC9Q92623 222 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 NCAPD3P42695 1498 aa8.54□□□□□ -1.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 WFDC12Q8WWY7 111 aa8.54□□□□□ -1.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 NOS3P29474 1203 aa8.53□□□□□ -1.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 IREB2P48200 963 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 NRLP54845 237 aa8.53□□□□□ -1.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 FAM200AQ8TCP9 573 aa8.53□□□□□ -1.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.53□□□□□ -1.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
TTC3-AS1-201ENST00000424733 EGFRP00533 1210 aa8.52□□□□□ -1.05
TTC3-AS1-201ENST00000424733 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
TTC3-AS1-201ENST00000424733 LRP8Q14114 963 aa8.52□□□□□ -1.05
TTC3-AS1-201ENST00000424733 CDCA8Q53HL2 280 aa8.52□□□□□ -1.05
TTC3-AS1-201ENST00000424733 TREML1Q86YW5 311 aa8.52□□□□□ -1.05
TTC3-AS1-201ENST00000424733 RGL4Q8IZJ4 473 aa8.52□□□□□ -1.05
TTC3-AS1-201ENST00000424733 XYLBO75191 536 aa8.51□□□□□ -1.05
TTC3-AS1-201ENST00000424733 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
TTC3-AS1-201ENST00000424733 IGF2-ASQ6U949 168 aa8.51□□□□□ -1.05
TTC3-AS1-201ENST00000424733 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
TTC3-AS1-201ENST00000424733 J3QW42 95 aa8.5□□□□□ -1.05
TTC3-AS1-201ENST00000424733 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
TTC3-AS1-201ENST00000424733 COX20Q5RI15 118 aa8.5□□□□□ -1.05
TTC3-AS1-201ENST00000424733 MEGF10Q96KG7 1140 aa8.5□□□□□ -1.05
TTC3-AS1-201ENST00000424733 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
TTC3-AS1-201ENST00000424733 KCNMB2Q9Y691 235 aa8.5□□□□□ -1.05
TTC3-AS1-201ENST00000424733 DLL1O00548 723 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC3-AS1-201ENST00000424733 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TTC3-AS1-201ENST00000424733 MMP20O60882 483 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC3-AS1-201ENST00000424733 NBPF11Q86T75 865 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC3-AS1-201ENST00000424733 PLD4Q96BZ4 506 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC3-AS1-201ENST00000424733 PRIMPOLQ96LW4 560 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC3-AS1-201ENST00000424733 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
TTC3-AS1-201ENST00000424733 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC3-AS1-201ENST00000424733 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC3-AS1-201ENST00000424733 RFX1P22670 979 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC3-AS1-201ENST00000424733 SIK1P57059 783 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC3-AS1-201ENST00000424733 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
TTC3-AS1-201ENST00000424733 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
TTC3-AS1-201ENST00000424733 NESP48681 1621 aa8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms