RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000408919.7

SH3BP5-203, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP5, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-203ENST00000408919 FAM161AQ3B820 660 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP5-203ENST00000408919 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP5-203ENST00000408919 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP5-203ENST00000408919 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SH3BP5-203ENST00000408919 GREM2Q9H772 168 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP5-203ENST00000408919 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP5-203ENST00000408919 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SH3BP5-203ENST00000408919 COL4A1P02462 1669 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP5-203ENST00000408919 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SH3BP5-203ENST00000408919 HMMRO75330 724 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP5-203ENST00000408919 ST5P78524 1137 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP5-203ENST00000408919 MTFR1LQ9H019 292 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP5-203ENST00000408919 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SH3BP5-203ENST00000408919 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP5-203ENST00000408919 SPEF2Q9C093 1822 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5-203ENST00000408919 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5-203ENST00000408919 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5-203ENST00000408919 NLRP3Q96P20 1036 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5-203ENST00000408919 ITGA6P23229 1130 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-203ENST00000408919 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-203ENST00000408919 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-203ENST00000408919 DCTPP1Q9H773 170 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-203ENST00000408919 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-203ENST00000408919 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-203ENST00000408919 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-203ENST00000408919 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5-203ENST00000408919 SMC5Q8IY18 1101 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5-203ENST00000408919 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP5-203ENST00000408919 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SH3BP5-203ENST00000408919 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP5-203ENST00000408919 RTL9Q8NET4 1388 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP5-203ENST00000408919 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP5-203ENST00000408919 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP5-203ENST00000408919 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP5-203ENST00000408919 SIL1Q9H173 461 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP5-203ENST00000408919 COPRSQ9NQ92 184 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP5-203ENST00000408919 SOCS7O14512 581 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP5-203ENST00000408919 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SH3BP5-203ENST00000408919 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP5-203ENST00000408919 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SH3BP5-203ENST00000408919 CRY2Q49AN0 593 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP5-203ENST00000408919 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SH3BP5-203ENST00000408919 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP5-203ENST00000408919 LRP5O75197 1615 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP5-203ENST00000408919 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP5-203ENST00000408919 APBB1O00213 710 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP5-203ENST00000408919 PTGER2P43116 358 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP5-203ENST00000408919 GCC1Q96CN9 775 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP5-203ENST00000408919 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SH3BP5-203ENST00000408919 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP5-203ENST00000408919 CACNA1SQ13698 1873 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP5-203ENST00000408919 POLD1P28340 1107 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5-203ENST00000408919 LRRC24Q50LG9 513 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5-203ENST00000408919 SKAP1Q86WV1 359 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5-203ENST00000408919 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5-203ENST00000408919 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5-203ENST00000408919 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-203ENST00000408919 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-203ENST00000408919 A0A1B0GUL6 1792 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP5-203ENST00000408919 EYA2O00167 538 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP5-203ENST00000408919 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SH3BP5-203ENST00000408919 SASH1O94885 1247 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP5-203ENST00000408919 SRGNP10124 158 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP5-203ENST00000408919 PDE6BP35913 854 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP5-203ENST00000408919 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SH3BP5-203ENST00000408919 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SH3BP5-203ENST00000408919 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP5-203ENST00000408919 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP5-203ENST00000408919 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP5-203ENST00000408919 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP5-203ENST00000408919 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP5-203ENST00000408919 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP5-203ENST00000408919 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP5-203ENST00000408919 SLC51AQ86UW1 340 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP5-203ENST00000408919 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SH3BP5-203ENST00000408919 CHRNA5P30532 468 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP5-203ENST00000408919 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SH3BP5-203ENST00000408919 NUCB1Q02818 461 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP5-203ENST00000408919 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP5-203ENST00000408919 BCL11AQ9H165 835 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP5-203ENST00000408919 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP5-203ENST00000408919 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP5-203ENST00000408919 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP5-203ENST00000408919 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP5-203ENST00000408919 LNPKQ9C0E8 428 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP5-203ENST00000408919 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP5-203ENST00000408919 RAB11FIP3O75154 756 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5-203ENST00000408919 CIAO1O76071 339 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5-203ENST00000408919 RPS8P62241 208 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5-203ENST00000408919 GRAPQ13588 217 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5-203ENST00000408919 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5-203ENST00000408919 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5-203ENST00000408919 SPON1Q9HCB6 807 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5-203ENST00000408919 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5-203ENST00000408919 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5-203ENST00000408919 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5-203ENST00000408919 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5-203ENST00000408919 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5-203ENST00000408919 NPR1P16066 1061 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP5-203ENST00000408919 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
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