RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392991.8

OLFM1-208, Transcript of olfactomedin 1, human

TSL 2 BASIC

Gene OLFM1, Length 1,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
OLFM1-208	ENST00000392991	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	40.38	■■■■■ 4.05
OLFM1-208	ENST00000392991	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		40.38	■■■■■ 4.05
OLFM1-208	ENST00000392991	RNF181	Q9P0P0	153 aa		40.37	■■■■■ 4.05
OLFM1-208	ENST00000392991	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		40.36	■■■■■ 4.05
OLFM1-208	ENST00000392991	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		40.36	■■■■■ 4.05
OLFM1-208	ENST00000392991	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	40.36	■■■■■ 4.05
OLFM1-208	ENST00000392991	ALDH1L1	O75891	902 aa		40.35	■■■■■ 4.05
OLFM1-208	ENST00000392991	LMNB1	P20700	586 aa		40.35	■■■■■ 4.05
OLFM1-208	ENST00000392991	BBOX1	O75936	387 aa		40.34	■■■■■ 4.05
OLFM1-208	ENST00000392991	CTSW	P56202	376 aa		40.34	■■■■■ 4.05
OLFM1-208	ENST00000392991	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	40.34	■■■■■ 4.05
OLFM1-208	ENST00000392991	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		40.33	■■■■■ 4.05
OLFM1-208	ENST00000392991	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	40.33	■■■■■ 4.05
OLFM1-208	ENST00000392991	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		40.33	■■■■■ 4.05
OLFM1-208	ENST00000392991	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		40.32	■■■■■ 4.05
OLFM1-208	ENST00000392991	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		40.32	■■■■■ 4.05
OLFM1-208	ENST00000392991	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	40.32	■■■■■ 4.05
OLFM1-208	ENST00000392991	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		40.32	■■■■■ 4.05
OLFM1-208	ENST00000392991	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	40.31	■■■■■ 4.04
OLFM1-208	ENST00000392991	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		40.31	■■■■■ 4.04
OLFM1-208	ENST00000392991	MYH3	P11055	1940 aa		40.31	■■■■■ 4.04
OLFM1-208	ENST00000392991	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		40.3	■■■■■ 4.04
OLFM1-208	ENST00000392991	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		40.3	■■■■■ 4.04
OLFM1-208	ENST00000392991	GRM8	O00222	908 aa		40.29	■■■■■ 4.04
OLFM1-208	ENST00000392991	BCAR3	O75815	825 aa		40.29	■■■■■ 4.04
OLFM1-208	ENST00000392991	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		40.28	■■■■■ 4.04
OLFM1-208	ENST00000392991	KIF16B	Q96L93	1317 aa		40.28	■■■■■ 4.04
OLFM1-208	ENST00000392991	SP8	Q8IXZ3	490 aa		40.27	■■■■■ 4.04
OLFM1-208	ENST00000392991	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		40.27	■■■■■ 4.04
OLFM1-208	ENST00000392991	PSMD1	Q99460	953 aa		40.26	■■■■■ 4.04
OLFM1-208	ENST00000392991	RTL9	Q8NET4	1388 aa		40.25	■■■■■ 4.03
OLFM1-208	ENST00000392991	TMC4	Q7Z404	712 aa		40.25	■■■■■ 4.03
OLFM1-208	ENST00000392991	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	40.25	■■■■■ 4.03
OLFM1-208	ENST00000392991	GREM2	Q9H772	168 aa		40.25	■■■■■ 4.03
OLFM1-208	ENST00000392991	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	40.25	■■■■■ 4.03
OLFM1-208	ENST00000392991	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		40.24	■■■■■ 4.03
OLFM1-208	ENST00000392991	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	40.24	■■■■■ 4.03
OLFM1-208	ENST00000392991	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	40.23	■■■■■ 4.03
OLFM1-208	ENST00000392991	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		40.23	■■■■■ 4.03
OLFM1-208	ENST00000392991	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	40.22	■■■■■ 4.03
OLFM1-208	ENST00000392991	UTY	O14607	1347 aa		40.22	■■■■■ 4.03
OLFM1-208	ENST00000392991	FOXO4	P98177	505 aa		40.22	■■■■■ 4.03
OLFM1-208	ENST00000392991	CSF1R	P07333	972 aa		40.21	■■■■■ 4.03
OLFM1-208	ENST00000392991	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	40.21	■■■■■ 4.03
OLFM1-208	ENST00000392991	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	40.2	■■■■■ 4.03
OLFM1-208	ENST00000392991	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	40.2	■■■■■ 4.03
OLFM1-208	ENST00000392991	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		40.2	■■■■■ 4.03
OLFM1-208	ENST00000392991	FAM161A	Q3B820	660 aa		40.18	■■■■■ 4.02
OLFM1-208	ENST00000392991	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		40.18	■■■■■ 4.02
OLFM1-208	ENST00000392991	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	40.17	■■■■■ 4.02
OLFM1-208	ENST00000392991	SUCLG2	Q96I99	432 aa		40.17	■■■■■ 4.02
OLFM1-208	ENST00000392991	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	40.16	■■■■■ 4.02
OLFM1-208	ENST00000392991	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	40.16	■■■■■ 4.02
OLFM1-208	ENST00000392991	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		40.16	■■■■■ 4.02
OLFM1-208	ENST00000392991	MPND	Q8N594	471 aa		40.16	■■■■■ 4.02
OLFM1-208	ENST00000392991	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	40.16	■■■■■ 4.02
OLFM1-208	ENST00000392991	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	40.16	■■■■■ 4.02
OLFM1-208	ENST00000392991	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	40.16	■■■■■ 4.02
OLFM1-208	ENST00000392991	USP44	Q9H0E7	712 aa		40.16	■■■■■ 4.02
OLFM1-208	ENST00000392991	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	40.15	■■■■■ 4.02
OLFM1-208	ENST00000392991	KAZALD1	Q96I82	304 aa		40.15	■■■■■ 4.02
OLFM1-208	ENST00000392991	TNN	Q9UQP3	1299 aa		40.15	■■■■■ 4.02
OLFM1-208	ENST00000392991	LTBP1	Q14766	1721 aa		40.15	■■■■■ 4.02
OLFM1-208	ENST00000392991	COL4A5	P29400	1685 aa		40.15	■■■■■ 4.02
OLFM1-208	ENST00000392991	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	40.14	■■■■■ 4.02
OLFM1-208	ENST00000392991	TRIM27	P14373	513 aa		40.14	■■■■■ 4.02
OLFM1-208	ENST00000392991	ITGA6	P23229	1130 aa		40.13	■■■■■ 4.01
OLFM1-208	ENST00000392991	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		40.13	■■■■■ 4.01
OLFM1-208	ENST00000392991	GPSM2	P81274	684 aa		40.12	■■■■■ 4.01
OLFM1-208	ENST00000392991	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		40.12	■■■■■ 4.01
OLFM1-208	ENST00000392991	SPEF2	Q9C093	1822 aa		40.12	■■■■■ 4.01
OLFM1-208	ENST00000392991	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	40.1	■■■■■ 4.01
OLFM1-208	ENST00000392991	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	40.09	■■■■■ 4.01
OLFM1-208	ENST00000392991	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	40.09	■■■■■ 4.01
OLFM1-208	ENST00000392991	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		40.08	■■■■■ 4.01
OLFM1-208	ENST00000392991	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		40.07	■■■■■ 4.01
OLFM1-208	ENST00000392991	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	40.07	■■■■■ 4.01
OLFM1-208	ENST00000392991	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		40.07	■■■■■ 4.01
OLFM1-208	ENST00000392991	AOC3	Q16853	763 aa		40.06	■■■■■ 4
OLFM1-208	ENST00000392991	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	40.06	■■■■■ 4
OLFM1-208	ENST00000392991	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		40.05	■■■■■ 4
OLFM1-208	ENST00000392991	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		40.05	■■■■■ 4
OLFM1-208	ENST00000392991	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		40.05	■■■■■ 4
OLFM1-208	ENST00000392991	POLL	Q9UGP5	575 aa		40.05	■■■■■ 4
OLFM1-208	ENST00000392991	GLTPD2	A6NH11	291 aa		40.04	■■■■■ 4
OLFM1-208	ENST00000392991	PPIP5K2	O43314	1243 aa		40.04	■■■■■ 4
OLFM1-208	ENST00000392991	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	40.04	■■■■■ 4
OLFM1-208	ENST00000392991	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	40.04	■■■■■ 4
OLFM1-208	ENST00000392991	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		40.04	■■■■■ 4
OLFM1-208	ENST00000392991	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		40.04	■■■■■ 4
OLFM1-208	ENST00000392991	VPS33B	Q9H267	617 aa		40.04	■■■■■ 4
OLFM1-208	ENST00000392991	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	40.03	■■■■■ 4
OLFM1-208	ENST00000392991	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	40.03	■■■■■ 4
OLFM1-208	ENST00000392991	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		40.02	■■■■■ 4
OLFM1-208	ENST00000392991	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		40.02	■■■■■ 4
OLFM1-208	ENST00000392991	FZD9	O00144	591 aa		40.01	■■■■■ 4
OLFM1-208	ENST00000392991	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		40.01	■■■■■ 4
OLFM1-208	ENST00000392991	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		40.01	■■■■■ 4
OLFM1-208	ENST00000392991	JDP2	Q8WYK2	163 aa		40.01	■■■■■ 4
OLFM1-208	ENST00000392991	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		40.01	■■■■■ 4

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