RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384139.1

RNU6-187P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 187, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-187P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-187P-201ENST00000384139 ATG3Q9NT62 314 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-187P-201ENST00000384139 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RNU6-187P-201ENST00000384139 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP5.04□□□□□ -1.6
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RNU6-187P-201ENST00000384139 MYRFLQ96LU7 910 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-187P-201ENST00000384139 TOX2Q96NM4 488 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-187P-201ENST00000384139 GSX2Q9BZM3 304 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-187P-201ENST00000384139 PAPLNO95428 1278 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-187P-201ENST00000384139 MSMPQ1L6U9 139 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RNU6-187P-201ENST00000384139 SUSD3Q96L08 255 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-187P-201ENST00000384139 CSRNP1Q96S65 589 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-187P-201ENST00000384139 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RNU6-187P-201ENST00000384139 CHIC2Q9UKJ5 165 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-187P-201ENST00000384139 JAG2Q9Y219 1238 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-187P-201ENST00000384139 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-187P-201ENST00000384139 APBB1O00213 710 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 MAP3K6O95382 1288 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 FOSL1P15407 271 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 GRNP28799 593 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 GPLD1P80108 840 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 BTLAQ7Z6A9 289 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC9A9Q8IVB4 645 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 MUC3BQ9H195 1237 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 KCNF1Q9H3M0 494 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 PLAURQ03405 335 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 SETDB1Q15047 1291 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 BEND4Q6ZU67 534 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 ACAD11Q709F0 780 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM20CQ8IXL6 584 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 FLCNQ8NFG4 579 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRPM4Q8TD43 1214 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 SART1O43290 800 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 EPB42P16452 691 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 IL22RA1Q8N6P7 574 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF280CQ8ND82 737 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 RTN1Q16799 776 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 SIAH1Q8IUQ4 282 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 PHACTR1Q9C0D0 580 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 HIF3AQ9Y2N7 669 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 BMP3P12645 472 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMEM132AQ24JP5 1023 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 PLPP7Q8NBV4 271 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM84AQ96KN4 292 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 MFSD14AQ96MC6 490 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZBTB42B2RXF5 422 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 PSME1Q06323 249 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 COL19A1Q14993 1142 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 RBSNQ9H1K0 784 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-187P-201ENST00000384139 CD68P34810 354 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-187P-201ENST00000384139 NRLP54845 237 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-187P-201ENST00000384139 TBCELQ5QJ74 424 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-187P-201ENST00000384139 NFXL1Q6ZNB6 911 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMEM40Q8WWA1 233 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-187P-201ENST00000384139 PLD4Q96BZ4 506 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF358Q9NW07 568 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-187P-201ENST00000384139 GPR37L1O60883 481 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-187P-201ENST00000384139 GHRHP01286 108 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-187P-201ENST00000384139 RAP1GAPP47736 663 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-187P-201ENST00000384139 EPHA4P54764 986 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-187P-201ENST00000384139 IER5Q5VY09 327 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-187P-201ENST00000384139 TTLL10Q6ZVT0 673 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-187P-201ENST00000384139 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM168AQ92567 244 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-187P-201ENST00000384139 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-187P-201ENST00000384139 PPME1Q9Y570 386 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-187P-201ENST00000384139 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-187P-201ENST00000384139 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-187P-201ENST00000384139 CYP26A1O43174 497 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-187P-201ENST00000384139 WISP1O95388 367 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-187P-201ENST00000384139 RARAP10276 462 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-187P-201ENST00000384139 DUOXA2Q1HG44 320 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-187P-201ENST00000384139 ANKRD34AQ69YU3 496 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-187P-201ENST00000384139 HFE2Q6ZVN8 426 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-187P-201ENST00000384139 FBXL6Q8N531 539 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-187P-201ENST00000384139 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-187P-201ENST00000384139 LMCD1Q9NZU5 365 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-187P-201ENST00000384139 F13BP05160 661 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-187P-201ENST00000384139 CFPP27918 469 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-187P-201ENST00000384139 DBX2Q6ZNG2 339 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-187P-201ENST00000384139 KRT25Q7Z3Z0 450 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-187P-201ENST00000384139 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-187P-201ENST00000384139 TNS4Q8IZW8 715 aa4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.7 ms