RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380956.8

IRF4-201, Transcript of interferon regulatory factor 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IRF4, Length 5,331 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4-201ENST00000380956 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa16.62■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 SELENOSQ9BQE4 189 aa16.62■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 UBAC1Q9BSL1 405 aa16.62■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 MIS18AQ9NYP9 233 aa16.62■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 GNGT1P63211 74 aa16.62■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 NEDD9Q14511 834 aa16.62■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 SULT6B1Q6IMI4 303 aa16.62■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 NCAPD3P42695 1498 aa16.62■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 CPA1P15085 419 aa16.62■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa16.62■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 ABCC11Q96J66 1382 aa16.61■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 PTPN23Q9H3S7 1636 aa16.61■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 CCDC96Q2M329 555 aa16.61■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 FYB1O15117 783 aa16.61■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 LMNTD2Q8IXW0 634 aa16.61■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 FAM212AQ96EL1 285 aa16.61■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa16.61■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 CABS1Q96KC9 395 aa16.61■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP16.6■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 MLECQ14165 292 aa16.6■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 TRIM66O15016 1216 aa16.6■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa16.6■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 FAM204AQ9H8W3 233 aa16.6■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 ST7Q9NRC1 585 aa16.6■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 EXOC4Q96A65 974 aa16.6■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 FAN1Q9Y2M0 1017 aa16.6■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 VAV2P52735 878 aa16.6■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 E2F5Q15329 346 aa16.6■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 LRRC2Q9BYS8 371 aa16.6■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 HDGFP51858 240 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 KMT5BQ4FZB7 885 aa16.59■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 IMPACTQ9P2X3 320 aa16.59■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 PDLIM2Q96JY6 352 aa16.59■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 DAPK1P53355 1430 aa16.59■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 USP19O94966 1318 aa16.59■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 ETF1P62495 437 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 SUFUQ9UMX1 484 aa16.59■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 CEP131Q9UPN4 1083 aa16.59■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 ATP2B2Q01814 1243 aa16.59■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP16.59■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 SAMD15Q9P1V8 674 aa16.59■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa16.58■□□□□ 0.25
IRF4-201ENST00000380956 SMARCA4P51532 1647 aa16.58■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 FANCCQ00597 558 aa16.58■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 MEIS3Q99687 375 aa16.58■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 MYO1BO43795 1136 aa16.58■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 TBC1D31Q96DN5 1066 aa16.57■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 A0A1B0GVL5 298 aa16.57■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 E7EVH7 732 aa16.57■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 ATP11AP98196 1134 aa16.57■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 ANKRD44Q8N8A2 993 aa16.57■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 FAM71BQ8TC56 605 aa16.57■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 NEK1Q96PY6 1258 aa16.57■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 SNCBQ16143 134 aa16.57■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 KCNG4Q8TDN1 519 aa16.57■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 SMIM23A6NLE4 172 aa16.57■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 DMRT2Q9Y5R5 561 aa16.57■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa16.56■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 LONRF2Q1L5Z9 754 aa16.56■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 ZHX3Q9H4I2 956 aa16.56■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa16.56■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 PEG3Q9GZU2 1588 aa16.56■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 GOLGA8BA8MQT2 603 aa16.56■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 AKR1B10O60218 316 aa16.56■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 CAPS2Q9BXY5 557 aa16.56■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 DCTPP1Q9H773 170 aa16.56■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 ATP8B1O43520 1251 aa16.56■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 RAD21O60216 631 aa16.56■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 CXorf56Q9H5V9 222 aa16.56■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 SPTLC3Q9NUV7 552 aa16.56■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 SERPINA10Q9UK55 444 aa16.56■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa16.56■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 MCM10Q7L590 875 aa16.56■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa16.56■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 SWAP70Q9UH65 585 aa16.56■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 SAMM50Q9Y512 469 aa16.56■□□□□ 0.24
IRF4-201ENST00000380956 KRT86O43790 486 aa16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.8 ms