RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375150.6

PRRT1-202, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,726 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-202ENST00000375150 FAM161AQ3B820 660 aa23.42■■□□□ 1.34
PRRT1-202ENST00000375150 SLC10A5Q5PT55 438 aa23.42■■□□□ 1.34
PRRT1-202ENST00000375150 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PRRT1-202ENST00000375150 ABCC12Q96J65 1359 aa23.42■■□□□ 1.34
PRRT1-202ENST00000375150 APBB1O00213 710 aa23.42■■□□□ 1.34
PRRT1-202ENST00000375150 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PRRT1-202ENST00000375150 ERC1Q8IUD2 1116 aa23.42■■□□□ 1.34
PRRT1-202ENST00000375150 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PRRT1-202ENST00000375150 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
PRRT1-202ENST00000375150 CCDC152Q4G0S7 254 aa23.41■■□□□ 1.34
PRRT1-202ENST00000375150 LRRCC1Q9C099 1032 aa23.41■■□□□ 1.34
PRRT1-202ENST00000375150 CASZ1Q86V15 1759 aa23.4■■□□□ 1.34
PRRT1-202ENST00000375150 SERPINB2P05120 415 aa23.4■■□□□ 1.34
PRRT1-202ENST00000375150 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PRRT1-202ENST00000375150 LNPKQ9C0E8 428 aa23.4■■□□□ 1.34
PRRT1-202ENST00000375150 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
PRRT1-202ENST00000375150 DDR1Q08345 913 aa23.39■■□□□ 1.34
PRRT1-202ENST00000375150 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
PRRT1-202ENST00000375150 GREM2Q9H772 168 aa23.39■■□□□ 1.34
PRRT1-202ENST00000375150 RTL9Q8NET4 1388 aa23.39■■□□□ 1.34
PRRT1-202ENST00000375150 RIC1Q4ADV7 1423 aa23.39■■□□□ 1.34
PRRT1-202ENST00000375150 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.39■■□□□ 1.33
PRRT1-202ENST00000375150 ST5P78524 1137 aa23.39■■□□□ 1.33
PRRT1-202ENST00000375150 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.39■■□□□ 1.33
PRRT1-202ENST00000375150 KLHDC4Q8TBB5 520 aa23.39■■□□□ 1.33
PRRT1-202ENST00000375150 KIF1BPQ96EK5 621 aa23.39■■□□□ 1.33
PRRT1-202ENST00000375150 SIL1Q9H173 461 aa23.39■■□□□ 1.33
PRRT1-202ENST00000375150 ITGA6P23229 1130 aa23.38■■□□□ 1.33
PRRT1-202ENST00000375150 PRR5LQ6MZQ0 368 aa23.38■■□□□ 1.33
PRRT1-202ENST00000375150 NLRP3Q96P20 1036 aa23.38■■□□□ 1.33
PRRT1-202ENST00000375150 NRXN2Q9P2S2 1712 aa23.37■■□□□ 1.33
PRRT1-202ENST00000375150 MMP10P09238 476 aa23.36■■□□□ 1.33
PRRT1-202ENST00000375150 RGS3P49796 1198 aa23.36■■□□□ 1.33
PRRT1-202ENST00000375150 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PRRT1-202ENST00000375150 MSL1Q68DK7 614 aa23.36■■□□□ 1.33
PRRT1-202ENST00000375150 SKAP1Q86WV1 359 aa23.36■■□□□ 1.33
PRRT1-202ENST00000375150 RHPN1Q8TCX5 695 aa23.36■■□□□ 1.33
PRRT1-202ENST00000375150 FBXO3Q9UK99 471 aa23.36■■□□□ 1.33
PRRT1-202ENST00000375150 PARP3Q9Y6F1 533 aa23.36■■□□□ 1.33
PRRT1-202ENST00000375150 SLC16A10Q8TF71 515 aa23.36■■□□□ 1.33
PRRT1-202ENST00000375150 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
PRRT1-202ENST00000375150 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
PRRT1-202ENST00000375150 CIAO1O76071 339 aa23.34■■□□□ 1.33
PRRT1-202ENST00000375150 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
PRRT1-202ENST00000375150 EYA2O00167 538 aa23.33■■□□□ 1.33
PRRT1-202ENST00000375150 CCDC24Q8N4L8 307 aa23.33■■□□□ 1.33
PRRT1-202ENST00000375150 PDE4AP27815 886 aa23.33■■□□□ 1.32
PRRT1-202ENST00000375150 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
PRRT1-202ENST00000375150 C3orf67Q6ZVT6 689 aa23.33■■□□□ 1.32
PRRT1-202ENST00000375150 LRP5O75197 1615 aa23.32■■□□□ 1.32
PRRT1-202ENST00000375150 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
PRRT1-202ENST00000375150 BCL11AQ9H165 835 aa23.32■■□□□ 1.32
PRRT1-202ENST00000375150 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PRRT1-202ENST00000375150 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa23.31■■□□□ 1.32
PRRT1-202ENST00000375150 SASH1O94885 1247 aa23.3■■□□□ 1.32
PRRT1-202ENST00000375150 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.3■■□□□ 1.32
PRRT1-202ENST00000375150 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PRRT1-202ENST00000375150 ATG9AQ7Z3C6 839 aa23.3■■□□□ 1.32
PRRT1-202ENST00000375150 SEC31BQ9NQW1 1179 aa23.3■■□□□ 1.32
PRRT1-202ENST00000375150 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PRRT1-202ENST00000375150 LRRC24Q50LG9 513 aa23.29■■□□□ 1.32
PRRT1-202ENST00000375150 MPHOSPH8Q99549 860 aa23.29■■□□□ 1.32
PRRT1-202ENST00000375150 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.29■■□□□ 1.32
PRRT1-202ENST00000375150 SPEF2Q9C093 1822 aa23.29■■□□□ 1.32
PRRT1-202ENST00000375150 ILDR2Q71H61 639 aa23.28■■□□□ 1.32
PRRT1-202ENST00000375150 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
PRRT1-202ENST00000375150 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa23.28■■□□□ 1.32
PRRT1-202ENST00000375150 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
PRRT1-202ENST00000375150 BRIP1Q9BX63 1249 aa23.28■■□□□ 1.32
PRRT1-202ENST00000375150 TFCP2Q12800 502 aa23.27■■□□□ 1.32
PRRT1-202ENST00000375150 CRY2Q49AN0 593 aa23.27■■□□□ 1.32
PRRT1-202ENST00000375150 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa23.27■■□□□ 1.32
PRRT1-202ENST00000375150 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
PRRT1-202ENST00000375150 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
PRRT1-202ENST00000375150 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
PRRT1-202ENST00000375150 CEP126Q9P2H0 1117 aa23.26■■□□□ 1.31
PRRT1-202ENST00000375150 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.26■■□□□ 1.31
PRRT1-202ENST00000375150 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa23.25■■□□□ 1.31
PRRT1-202ENST00000375150 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
PRRT1-202ENST00000375150 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PRRT1-202ENST00000375150 TAF1P21675 1872 aa23.25■■□□□ 1.31
PRRT1-202ENST00000375150 METTL24Q5JXM2 366 aa23.25■■□□□ 1.31
PRRT1-202ENST00000375150 AACSQ86V21 672 aa23.25■■□□□ 1.31
PRRT1-202ENST00000375150 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
PRRT1-202ENST00000375150 GPR108Q9NPR9 543 aa23.25■■□□□ 1.31
PRRT1-202ENST00000375150 MROH5Q6ZUA9 1318 aa23.24■■□□□ 1.31
PRRT1-202ENST00000375150 MX1P20591 662 aa23.24■■□□□ 1.31
PRRT1-202ENST00000375150 PDE6BP35913 854 aa23.24■■□□□ 1.31
PRRT1-202ENST00000375150 TNNI3KQ59H18 835 aa23.23■■□□□ 1.31
PRRT1-202ENST00000375150 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa23.23■■□□□ 1.31
PRRT1-202ENST00000375150 SALL3Q9BXA9 1300 aa23.23■■□□□ 1.31
PRRT1-202ENST00000375150 RPS8P62241 208 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
PRRT1-202ENST00000375150 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
PRRT1-202ENST00000375150 GPATCH3Q96I76 525 aa23.22■■□□□ 1.31
PRRT1-202ENST00000375150 MTFR1LQ9H019 292 aa23.22■■□□□ 1.31
PRRT1-202ENST00000375150 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
PRRT1-202ENST00000375150 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.22■■□□□ 1.31
PRRT1-202ENST00000375150 PDE1AP54750 535 aa23.22■■□□□ 1.31
PRRT1-202ENST00000375150 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
PRRT1-202ENST00000375150 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
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