RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369762.6

ATP6AP1-201, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATP6AP1, Length 2,099 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1-201ENST00000369762 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
ATP6AP1-201ENST00000369762 SMC3Q9UQE7 1217 aa25.27■■□□□ 1.64
ATP6AP1-201ENST00000369762 TAF5LO75529 589 aa25.26■■□□□ 1.63
ATP6AP1-201ENST00000369762 IL15P40933 162 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
ATP6AP1-201ENST00000369762 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.26■■□□□ 1.63
ATP6AP1-201ENST00000369762 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
ATP6AP1-201ENST00000369762 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
ATP6AP1-201ENST00000369762 TICAM2Q86XR7 235 aa25.25■■□□□ 1.63
ATP6AP1-201ENST00000369762 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
ATP6AP1-201ENST00000369762 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.25■■□□□ 1.63
ATP6AP1-201ENST00000369762 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
ATP6AP1-201ENST00000369762 STX6O43752 255 aa25.24■■□□□ 1.63
ATP6AP1-201ENST00000369762 CIAO1O76071 339 aa25.24■■□□□ 1.63
ATP6AP1-201ENST00000369762 SYT1P21579 422 aa25.24■■□□□ 1.63
ATP6AP1-201ENST00000369762 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
ATP6AP1-201ENST00000369762 TMEM87AQ8NBN3 555 aa25.24■■□□□ 1.63
ATP6AP1-201ENST00000369762 TCIRG1Q13488 830 aa25.23■■□□□ 1.63
ATP6AP1-201ENST00000369762 TMEM63CQ9P1W3 806 aa25.23■■□□□ 1.63
ATP6AP1-201ENST00000369762 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
ATP6AP1-201ENST00000369762 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
ATP6AP1-201ENST00000369762 ZNF609O15014 1411 aa25.22■■□□□ 1.63
ATP6AP1-201ENST00000369762 EYA2O00167 538 aa25.22■■□□□ 1.63
ATP6AP1-201ENST00000369762 CCDC83Q8IWF9 413 aa25.22■■□□□ 1.63
ATP6AP1-201ENST00000369762 DISP2A7MBM2 1401 aa25.22■■□□□ 1.63
ATP6AP1-201ENST00000369762 PALLDQ8WX93 1383 aa25.22■■□□□ 1.63
ATP6AP1-201ENST00000369762 NASPP49321 788 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
ATP6AP1-201ENST00000369762 ANKRD1Q15327 319 aa25.22■■□□□ 1.63
ATP6AP1-201ENST00000369762 ME3Q16798 604 aa25.22■■□□□ 1.63
ATP6AP1-201ENST00000369762 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa25.22■■□□□ 1.63
ATP6AP1-201ENST00000369762 PIGBQ92521 554 aa25.22■■□□□ 1.63
ATP6AP1-201ENST00000369762 ST3GAL1Q11201 340 aa25.21■■□□□ 1.63
ATP6AP1-201ENST00000369762 KBTBD3Q8NAB2 608 aa25.21■■□□□ 1.63
ATP6AP1-201ENST00000369762 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
ATP6AP1-201ENST00000369762 RPS6KB1P23443 525 aa25.21■■□□□ 1.63
ATP6AP1-201ENST00000369762 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa25.2■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 BTG4Q9NY30 223 aa25.2■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.2■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 TPCN1Q9ULQ1 816 aa25.2■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 SH3TC1Q8TE82 1336 aa25.19■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 GJB2P29033 226 aa25.19■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 KRT32Q14532 448 aa25.19■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 F13A1P00488 732 aa25.19■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 DNAJC10Q8IXB1 793 aa25.19■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 FBXO3Q9UK99 471 aa25.19■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa25.19■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 ITGB4P16144 1822 aa25.19■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 LRP6O75581 1613 aa25.18■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 LRRC24Q50LG9 513 aa25.18■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 LRSAM1Q6UWE0 723 aa25.18■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 USP48Q86UV5 1035 aa25.18■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 PPP1R9BQ96SB3 815 aa25.18■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 PLA2G12BQ9BX93 195 aa25.18■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa25.18■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 CCDC173Q0VFZ6 552 aa25.17■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 TAF6LQ9Y6J9 622 aa25.17■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 STARD3NLO95772 234 aa25.17■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.17■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.17■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.17■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 SPEF2Q9C093 1822 aa25.16■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 PAG1Q9NWQ8 432 aa25.16■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 PLCH1Q4KWH8 1693 aa25.16■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 TIMM10P62072 90 aa25.16■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 MTMR6Q9Y217 621 aa25.16■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 RBSNQ9H1K0 784 aa25.15■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 HELLSQ9NRZ9 838 aa25.15■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 BCL9O00512 1426 aa25.14■■□□□ 1.62
ATP6AP1-201ENST00000369762 CCDC57Q2TAC2 916 aa25.14■■□□□ 1.61
ATP6AP1-201ENST00000369762 NECAB1Q8N987 351 aa25.14■■□□□ 1.61
ATP6AP1-201ENST00000369762 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
ATP6AP1-201ENST00000369762 GDPD2Q9HCC8 539 aa25.14■■□□□ 1.61
ATP6AP1-201ENST00000369762 TCHHQ07283 1943 aa25.14■■□□□ 1.61
ATP6AP1-201ENST00000369762 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa25.13■■□□□ 1.61
ATP6AP1-201ENST00000369762 A0A1B0GUL7 405 aa25.13■■□□□ 1.61
ATP6AP1-201ENST00000369762 SYCE3A1L190 88 aa25.13■■□□□ 1.61
ATP6AP1-201ENST00000369762 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
ATP6AP1-201ENST00000369762 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
ATP6AP1-201ENST00000369762 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
ATP6AP1-201ENST00000369762 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa25.13■■□□□ 1.61
ATP6AP1-201ENST00000369762 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
ATP6AP1-201ENST00000369762 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
ATP6AP1-201ENST00000369762 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
ATP6AP1-201ENST00000369762 GOLIM4O00461 696 aa25.13■■□□□ 1.61
ATP6AP1-201ENST00000369762 CSF1RP07333 972 aa25.13■■□□□ 1.61
ATP6AP1-201ENST00000369762 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
ATP6AP1-201ENST00000369762 CNPY2Q9Y2B0 182 aa25.13■■□□□ 1.61
ATP6AP1-201ENST00000369762 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
ATP6AP1-201ENST00000369762 CHGBP05060 677 aa25.12■■□□□ 1.61
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