RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC27Q9C0I9 530 aa23.32■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 FAM114A1Q8IWE2 563 aa23.32■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.32■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC40Q4G0X9 1142 aa23.32■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC178Q5BJE1 867 aa23.32■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa23.32■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 PPFIA3O75145 1194 aa23.31■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 VAMP4O75379 141 aa23.31■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 KCNG4Q8TDN1 519 aa23.31■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.31■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.31■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 CYP7A1P22680 504 aa23.31■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 TESK2Q96S53 571 aa23.31■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 SYKP43405 635 aa23.3■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 NLRP3Q96P20 1036 aa23.3■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 WDR78Q5VTH9 848 aa23.3■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 TCERG1LQ5VWI1 586 aa23.3■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 DCTPP1Q9H773 170 aa23.3■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.3■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 GNAQP50148 359 aa23.29■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 TCEANC2Q96MN5 208 aa23.29■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 ALG1Q9BT22 464 aa23.29■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 TTC41PQ6P2S7 1318 aa23.29■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 ASXL2Q76L83 1435 aa23.29■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 ST5P78524 1137 aa23.28■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa23.28■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC150Q8NCX0 1101 aa23.28■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 SNX21Q969T3 373 aa23.28■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.28■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 TRAF1Q13077 416 aa23.28■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 SETDB2Q96T68 719 aa23.28■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa23.27■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 RTN1Q16799 776 aa23.27■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 ALS2CR12Q96Q35 445 aa23.27■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC2Q9BYS8 371 aa23.27■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 RMND1Q9NWS8 449 aa23.27■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 USP8P40818 1118 aa23.26■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa23.26■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 GIMAP6Q6P9H5 292 aa23.26■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 LRSAM1Q6UWE0 723 aa23.26■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 ZRANB1Q9UGI0 708 aa23.26■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa23.26■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.26■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 N4BP3O15049 544 aa23.26■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 NPATQ14207 1427 aa23.26■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa23.26■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 ATP6V1AP38606 617 aa23.25■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 CEP85Q6P2H3 762 aa23.25■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.25■■□□□ 1.312e-6■□□□□ 10.7
CCSAP-203ENST00000366687 TSPY3P0CV98 308 aa23.25■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 TSPY8P0CW00 308 aa23.25■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 DNA2P51530 1060 aa23.25■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 ISM2Q6H9L7 571 aa23.25■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.24■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 PAG1Q9NWQ8 432 aa23.24■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 SMC5Q8IY18 1101 aa23.24■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 TSPYL6Q8N831 410 aa23.24■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 DYDC1Q8WWB3 177 aa23.24■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM47Q96LD4 638 aa23.24■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 PIK3C2GO75747 1445 aa23.24■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 Q6ZUG5 572 aa23.24■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.24■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.23■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 POTEB2H3BUK9 544 aa23.23■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 CHMP4BP1P59074 171 aa23.23■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 SPAG1Q07617 926 aa23.23■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 ERMNQ8TAM6 284 aa23.23■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.23■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 IL2RBP14784 551 aa23.23■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 MAPKBP1O60336 1514 aa23.23■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 IFFO1Q0D2I5 559 aa23.23■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 DDB1Q16531 1140 aa23.22■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 EYA1Q99502 592 aa23.22■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.22■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 FAM200AQ8TCP9 573 aa23.22■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 SHTN1A0MZ66 631 aa23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.7 ms