RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340766.9

PPP1CC-202, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PPP1CC, Length 1,472 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-202ENST00000340766 SPON1Q9HCB6 807 aa35.73■■■■□ 3.31
PPP1CC-202ENST00000340766 CHMP3Q9Y3E7 222 aa35.73■■■■□ 3.31
PPP1CC-202ENST00000340766 PTGER2P43116 358 aa35.73■■■■□ 3.31
PPP1CC-202ENST00000340766 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
PPP1CC-202ENST00000340766 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa35.72■■■■□ 3.31
PPP1CC-202ENST00000340766 SRGAP3O43295 1099 aa35.72■■■■□ 3.31
PPP1CC-202ENST00000340766 CCDC152Q4G0S7 254 aa35.72■■■■□ 3.31
PPP1CC-202ENST00000340766 SIRT2Q8IXJ6 389 aa35.72■■■■□ 3.31
PPP1CC-202ENST00000340766 RTL9Q8NET4 1388 aa35.72■■■■□ 3.31
PPP1CC-202ENST00000340766 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP35.71■■■■□ 3.31
PPP1CC-202ENST00000340766 HMMRO75330 724 aa35.7■■■■□ 3.31
PPP1CC-202ENST00000340766 FAM161AQ3B820 660 aa35.7■■■■□ 3.31
PPP1CC-202ENST00000340766 SPEF2Q9C093 1822 aa35.7■■■■□ 3.3
PPP1CC-202ENST00000340766 DLEC1Q9Y238 1755 aa35.7■■■■□ 3.3
PPP1CC-202ENST00000340766 GREM2Q9H772 168 aa35.69■■■■□ 3.3
PPP1CC-202ENST00000340766 TAF1P21675 1872 aa35.69■■■■□ 3.3
PPP1CC-202ENST00000340766 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
PPP1CC-202ENST00000340766 PDE6BP35913 854 aa35.68■■■■□ 3.3
PPP1CC-202ENST00000340766 CRY2Q49AN0 593 aa35.68■■■■□ 3.3
PPP1CC-202ENST00000340766 SSH3Q8TE77 659 aa35.68■■■■□ 3.3
PPP1CC-202ENST00000340766 POLA2Q14181 598 aa35.67■■■■□ 3.3
PPP1CC-202ENST00000340766 PPP4R2Q9NY27 417 aa35.67■■■■□ 3.3
PPP1CC-202ENST00000340766 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa35.67■■■■□ 3.3
PPP1CC-202ENST00000340766 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
PPP1CC-202ENST00000340766 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
PPP1CC-202ENST00000340766 CCDC57Q2TAC2 916 aa35.66■■■■□ 3.3
PPP1CC-202ENST00000340766 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa35.65■■■■□ 3.3
PPP1CC-202ENST00000340766 ITGA6P23229 1130 aa35.65■■■■□ 3.3
PPP1CC-202ENST00000340766 LRP5O75197 1615 aa35.65■■■■□ 3.3
PPP1CC-202ENST00000340766 CACNA1SQ13698 1873 aa35.63■■■■□ 3.29
PPP1CC-202ENST00000340766 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa35.63■■■■□ 3.29
PPP1CC-202ENST00000340766 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
PPP1CC-202ENST00000340766 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
PPP1CC-202ENST00000340766 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
PPP1CC-202ENST00000340766 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa35.62■■■■□ 3.29
PPP1CC-202ENST00000340766 COL4A1P02462 1669 aa35.62■■■■□ 3.29
PPP1CC-202ENST00000340766 CCDC136Q96JN2 1154 aa35.61■■■■□ 3.29
PPP1CC-202ENST00000340766 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
PPP1CC-202ENST00000340766 SEC31BQ9NQW1 1179 aa35.6■■■■□ 3.29
PPP1CC-202ENST00000340766 SRGNP10124 158 aa35.6■■■■□ 3.29
PPP1CC-202ENST00000340766 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
PPP1CC-202ENST00000340766 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
PPP1CC-202ENST00000340766 C2CD5Q86YS7 1000 aa35.59■■■■□ 3.29
PPP1CC-202ENST00000340766 COPRSQ9NQ92 184 aa35.59■■■■□ 3.29
PPP1CC-202ENST00000340766 TAF7LQ5H9L4 462 aa35.58■■■■□ 3.29
PPP1CC-202ENST00000340766 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
PPP1CC-202ENST00000340766 H0YIN7 160 aa35.57■■■■□ 3.28
PPP1CC-202ENST00000340766 IGHDP01880 384 aa35.57■■■■□ 3.28
PPP1CC-202ENST00000340766 NPR1P16066 1061 aa35.57■■■■□ 3.28
PPP1CC-202ENST00000340766 KLHDC4Q8TBB5 520 aa35.57■■■■□ 3.28
PPP1CC-202ENST00000340766 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.28
PPP1CC-202ENST00000340766 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.28
PPP1CC-202ENST00000340766 MASTLQ96GX5 879 aa35.55■■■■□ 3.28
PPP1CC-202ENST00000340766 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
PPP1CC-202ENST00000340766 CD2APQ9Y5K6 639 aa35.55■■■■□ 3.28
PPP1CC-202ENST00000340766 GRAPQ13588 217 aa35.54■■■■□ 3.28
PPP1CC-202ENST00000340766 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa35.54■■■■□ 3.28
PPP1CC-202ENST00000340766 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP35.54■■■■□ 3.28
PPP1CC-202ENST00000340766 CRAMP1Q96RY5 1269 aa35.54■■■■□ 3.28
PPP1CC-202ENST00000340766 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
PPP1CC-202ENST00000340766 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa35.54■■■■□ 3.28
PPP1CC-202ENST00000340766 DCTPP1Q9H773 170 aa35.54■■■■□ 3.28
PPP1CC-202ENST00000340766 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
PPP1CC-202ENST00000340766 A0A1B0GUL6 1792 aa35.53■■■■□ 3.28
PPP1CC-202ENST00000340766 SURF6O75683 361 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
PPP1CC-202ENST00000340766 CHRNA5P30532 468 aa35.53■■■■□ 3.28
PPP1CC-202ENST00000340766 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
PPP1CC-202ENST00000340766 STYK1Q6J9G0 422 aa35.53■■■■□ 3.28
PPP1CC-202ENST00000340766 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
PPP1CC-202ENST00000340766 SIL1Q9H173 461 aa35.53■■■■□ 3.28
PPP1CC-202ENST00000340766 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP35.53■■■■□ 3.28
PPP1CC-202ENST00000340766 TGFB2P61812 414 aa35.52■■■■□ 3.28
PPP1CC-202ENST00000340766 KLHL34Q8N239 644 aa35.52■■■■□ 3.28
PPP1CC-202ENST00000340766 FBXO3Q9UK99 471 aa35.51■■■■□ 3.28
PPP1CC-202ENST00000340766 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa35.51■■■■□ 3.28
PPP1CC-202ENST00000340766 RPS8P62241 208 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
PPP1CC-202ENST00000340766 MPHOSPH8Q99549 860 aa35.5■■■■□ 3.27
PPP1CC-202ENST00000340766 LRRC37AA6NMS7 1700 aa35.5■■■■□ 3.27
PPP1CC-202ENST00000340766 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa35.49■■■■□ 3.27
PPP1CC-202ENST00000340766 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa35.49■■■■□ 3.27
PPP1CC-202ENST00000340766 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP35.49■■■■□ 3.27
PPP1CC-202ENST00000340766 GCC1Q96CN9 775 aa35.49■■■■□ 3.27
PPP1CC-202ENST00000340766 KDM2BQ8NHM5 1336 aa35.48■■■■□ 3.27
PPP1CC-202ENST00000340766 EYA2O00167 538 aa35.48■■■■□ 3.27
PPP1CC-202ENST00000340766 CIAO1O76071 339 aa35.48■■■■□ 3.27
PPP1CC-202ENST00000340766 ALDH1B1P30837 517 aa35.48■■■■□ 3.27
PPP1CC-202ENST00000340766 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP35.48■■■■□ 3.272e-7■□□□□ 8.3
PPP1CC-202ENST00000340766 DPEP1P16444 411 aa35.48■■■■□ 3.27
PPP1CC-202ENST00000340766 CNNM1Q9NRU3 951 aa35.48■■■■□ 3.27
PPP1CC-202ENST00000340766 SLX4Q8IY92 1834 aa35.47■■■■□ 3.27
PPP1CC-202ENST00000340766 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP35.47■■■■□ 3.27
PPP1CC-202ENST00000340766 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP35.47■■■■□ 3.27
PPP1CC-202ENST00000340766 SMC5Q8IY18 1101 aa35.47■■■■□ 3.27
PPP1CC-202ENST00000340766 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
PPP1CC-202ENST00000340766 A0A0G2JLW4 131 aa35.46■■■■□ 3.27
PPP1CC-202ENST00000340766 LRRC24Q50LG9 513 aa35.46■■■■□ 3.27
PPP1CC-202ENST00000340766 CNKSR1Q969H4 720 aa35.46■■■■□ 3.27
PPP1CC-202ENST00000340766 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
PPP1CC-202ENST00000340766 RAB11FIP3O75154 756 aa35.44■■■■□ 3.26
PPP1CC-202ENST00000340766 BBOX1O75936 387 aa35.44■■■■□ 3.26
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