RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327347.9

SEPHS1-201, Transcript of selenophosphate synthetase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEPHS1, Length 3,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPHS1-201ENST00000327347 PSMA5P28066 241 aa20.38■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 NR1I2O75469 434 aa20.38■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 FAM200AQ8TCP9 573 aa20.38■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 TRIM5Q9C035 493 aa20.38■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 ALDH1L1O75891 902 aa20.38■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 RPS6KB1P23443 525 aa20.38■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 FGD1P98174 961 aa20.38■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 PRIMPOLQ96LW4 560 aa20.38■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 DNAJC25Q9H1X3 360 aa20.38■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 CBX8Q9HC52 389 aa20.38■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 HOXB7P09629 217 aa20.37■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 MYD88Q99836 296 aa20.37■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 PXDNQ92626 1479 aa20.37■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 RNF20Q5VTR2 975 aa20.37■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 LINS1Q8NG48 757 aa20.37■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 IGKV5-2P06315 115 aa20.37■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 PDCL2Q8N4E4 241 aa20.36■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 SPTLC3Q9NUV7 552 aa20.36■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 H3BQV1 296 aa20.35■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 IFFO2Q5TF58 517 aa20.35■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 BRF1Q92994 677 aa20.35■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 ANKRD24Q8TF21 1146 aa20.35■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 KCNB2Q92953 911 aa20.35■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa20.34■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.34■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 PDCP20941 246 aa20.34■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.34■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 PGBD1Q96JS3 809 aa20.34■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 ARID5BQ14865 1188 aa20.34■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 ORAI2Q96SN7 254 aa20.34■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 AXIN2Q9Y2T1 843 aa20.34■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 Q6ZUG5 572 aa20.33■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 COPS6Q7L5N1 327 aa20.33■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 GUCY1B3Q02153 619 aa20.33■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 TFCP2Q12800 502 aa20.33■□□□□ 0.85
SEPHS1-201ENST00000327347 HIP1O00291 1037 aa20.32■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 ZBTB22O15209 634 aa20.32■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 TAF5LO75529 589 aa20.32■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 GCP02774 474 aa20.32■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 ZNF165P49910 485 aa20.31■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa20.31■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 COL15A1P39059 1388 aa20.31■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 CCT2P78371 535 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 NEXNQ0ZGT2 675 aa20.31■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 ANKRD1Q15327 319 aa20.31■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 CHST3Q7LGC8 479 aa20.31■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 RGPD2P0DJD1 1756 aa20.31■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 PDIA6Q15084 440 aa20.3■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 NEK1Q96PY6 1258 aa20.3■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 DBNDD2Q9BQY9 259 aa20.3■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.3■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa20.3■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 A0A0G2JLW4 131 aa20.29■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 NEURL1BA8MQ27 555 aa20.29■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 AMOTQ4VCS5 1084 aa20.29■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 NPHP3Q7Z494 1330 aa20.29■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 LTN1O94822 1766 aa20.29■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 GCKRQ14397 625 aa20.28■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 CLSTN2Q9H4D0 955 aa20.28■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 CYP21A2P08686 494 aa20.28■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.28■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 TRERF1Q96PN7 1200 aa20.28■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 CLIP2Q9UDT6 1046 aa20.28■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.28■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 ZNF75DP51815 510 aa20.28■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 CCDC144BQ3MJ40 725 aa20.28■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa20.28■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 KCNH5Q8NCM2 988 aa20.28■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 MED23Q9ULK4 1368 aa20.27■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa20.27■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 GTF3C6Q969F1 213 aa20.27■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 NLRP2Q9NX02 1062 aa20.27■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 USP16Q9Y5T5 823 aa20.27■□□□□ 0.84
SEPHS1-201ENST00000327347 ELP1O95163 1332 aa20.27■□□□□ 0.83
SEPHS1-201ENST00000327347 ANKARQ7Z5J8 1434 aa20.27■□□□□ 0.83
SEPHS1-201ENST00000327347 APOBRQ0VD83 1088 aa20.26■□□□□ 0.83
SEPHS1-201ENST00000327347 SCRN1Q12765 414 aa20.26■□□□□ 0.83
SEPHS1-201ENST00000327347 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SEPHS1-201ENST00000327347 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms