RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243893.10

UBE2C-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene UBE2C, Length 476 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-201ENST00000243893 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.5■■□□□ 1.67
UBE2C-201ENST00000243893 CRY2Q49AN0 593 aa25.49■■□□□ 1.67
UBE2C-201ENST00000243893 CCDC24Q8N4L8 307 aa25.49■■□□□ 1.67
UBE2C-201ENST00000243893 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
UBE2C-201ENST00000243893 HMMRO75330 724 aa25.48■■□□□ 1.67
UBE2C-201ENST00000243893 PDE6BP35913 854 aa25.48■■□□□ 1.67
UBE2C-201ENST00000243893 C3orf67Q6ZVT6 689 aa25.48■■□□□ 1.67
UBE2C-201ENST00000243893 SSH3Q8TE77 659 aa25.48■■□□□ 1.67
UBE2C-201ENST00000243893 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa25.47■■□□□ 1.67
UBE2C-201ENST00000243893 SRGAP3O43295 1099 aa25.47■■□□□ 1.67
UBE2C-201ENST00000243893 POLA2Q14181 598 aa25.47■■□□□ 1.67
UBE2C-201ENST00000243893 SIRT2Q8IXJ6 389 aa25.47■■□□□ 1.67
UBE2C-201ENST00000243893 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa25.46■■□□□ 1.67
UBE2C-201ENST00000243893 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
UBE2C-201ENST00000243893 KIF13BQ9NQT8 1826 aa25.45■■□□□ 1.66
UBE2C-201ENST00000243893 FAM161AQ3B820 660 aa25.45■■□□□ 1.66
UBE2C-201ENST00000243893 GREM2Q9H772 168 aa25.45■■□□□ 1.66
UBE2C-201ENST00000243893 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
UBE2C-201ENST00000243893 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
UBE2C-201ENST00000243893 CCDC57Q2TAC2 916 aa25.44■■□□□ 1.66
UBE2C-201ENST00000243893 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.44■■□□□ 1.66
UBE2C-201ENST00000243893 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.44■■□□□ 1.66
UBE2C-201ENST00000243893 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
UBE2C-201ENST00000243893 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.43■■□□□ 1.66
UBE2C-201ENST00000243893 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa25.42■■□□□ 1.66
UBE2C-201ENST00000243893 SRGNP10124 158 aa25.42■■□□□ 1.66
UBE2C-201ENST00000243893 ITGA6P23229 1130 aa25.42■■□□□ 1.66
UBE2C-201ENST00000243893 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
UBE2C-201ENST00000243893 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
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UBE2C-201ENST00000243893 COPRSQ9NQ92 184 aa25.41■■□□□ 1.66
UBE2C-201ENST00000243893 FBXO3Q9UK99 471 aa25.41■■□□□ 1.66
UBE2C-201ENST00000243893 NPR1P16066 1061 aa25.4■■□□□ 1.66
UBE2C-201ENST00000243893 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
UBE2C-201ENST00000243893 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
UBE2C-201ENST00000243893 CRAMP1Q96RY5 1269 aa25.4■■□□□ 1.66
UBE2C-201ENST00000243893 H0YIN7 160 aa25.39■■□□□ 1.66
UBE2C-201ENST00000243893 TGFB2P61812 414 aa25.39■■□□□ 1.66
UBE2C-201ENST00000243893 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
UBE2C-201ENST00000243893 C2CD5Q86YS7 1000 aa25.39■■□□□ 1.66
UBE2C-201ENST00000243893 MASTLQ96GX5 879 aa25.39■■□□□ 1.66
UBE2C-201ENST00000243893 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
UBE2C-201ENST00000243893 STYK1Q6J9G0 422 aa25.38■■□□□ 1.65
UBE2C-201ENST00000243893 LRP5O75197 1615 aa25.37■■□□□ 1.65
UBE2C-201ENST00000243893 GRAPQ13588 217 aa25.37■■□□□ 1.65
UBE2C-201ENST00000243893 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
UBE2C-201ENST00000243893 DCTPP1Q9H773 170 aa25.37■■□□□ 1.65
UBE2C-201ENST00000243893 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.37■■□□□ 1.65
UBE2C-201ENST00000243893 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
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UBE2C-201ENST00000243893 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.36■■□□□ 1.65
UBE2C-201ENST00000243893 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25.36■■□□□ 1.65
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UBE2C-201ENST00000243893 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.36■■□□□ 1.65
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UBE2C-201ENST00000243893 IGHDP01880 384 aa25.34■■□□□ 1.65
UBE2C-201ENST00000243893 TMC4Q7Z404 712 aa25.34■■□□□ 1.65
UBE2C-201ENST00000243893 GCC1Q96CN9 775 aa25.34■■□□□ 1.65
UBE2C-201ENST00000243893 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
UBE2C-201ENST00000243893 DLEC1Q9Y238 1755 aa25.33■■□□□ 1.65
UBE2C-201ENST00000243893 EYA2O00167 538 aa25.33■■□□□ 1.65
UBE2C-201ENST00000243893 CHRNA5P30532 468 aa25.33■■□□□ 1.65
UBE2C-201ENST00000243893 SMC5Q8IY18 1101 aa25.33■■□□□ 1.65
UBE2C-201ENST00000243893 KLHDC4Q8TBB5 520 aa25.33■■□□□ 1.65
UBE2C-201ENST00000243893 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
UBE2C-201ENST00000243893 CNKSR1Q969H4 720 aa25.33■■□□□ 1.65
UBE2C-201ENST00000243893 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
UBE2C-201ENST00000243893 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.33■■□□□ 1.65
UBE2C-201ENST00000243893 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
UBE2C-201ENST00000243893 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa25.32■■□□□ 1.64
UBE2C-201ENST00000243893 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.32■■□□□ 1.64
UBE2C-201ENST00000243893 RAB11FIP3O75154 756 aa25.31■■□□□ 1.64
UBE2C-201ENST00000243893 DPEP1P16444 411 aa25.31■■□□□ 1.64
UBE2C-201ENST00000243893 IL15P40933 162 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
UBE2C-201ENST00000243893 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.64
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UBE2C-201ENST00000243893 KCNA3P22001 575 aa25.3■■□□□ 1.64
UBE2C-201ENST00000243893 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
UBE2C-201ENST00000243893 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.3■■□□□ 1.64
UBE2C-201ENST00000243893 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP25.3■■□□□ 1.64
UBE2C-201ENST00000243893 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
UBE2C-201ENST00000243893 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa25.3■■□□□ 1.64
UBE2C-201ENST00000243893 COL4A1P02462 1669 aa25.29■■□□□ 1.64
UBE2C-201ENST00000243893 ATG9AQ7Z3C6 839 aa25.29■■□□□ 1.64
UBE2C-201ENST00000243893 SIL1Q9H173 461 aa25.29■■□□□ 1.64
UBE2C-201ENST00000243893 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa25.29■■□□□ 1.64
UBE2C-201ENST00000243893 A0A0G2JLW4 131 aa25.28■■□□□ 1.64
UBE2C-201ENST00000243893 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.28■■□□□ 1.64
UBE2C-201ENST00000243893 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
UBE2C-201ENST00000243893 CNNM1Q9NRU3 951 aa25.28■■□□□ 1.64
UBE2C-201ENST00000243893 MROH5Q6ZUA9 1318 aa25.28■■□□□ 1.64
UBE2C-201ENST00000243893 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
UBE2C-201ENST00000243893 LRRC24Q50LG9 513 aa25.27■■□□□ 1.64
UBE2C-201ENST00000243893 KLHL34Q8N239 644 aa25.27■■□□□ 1.64
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