RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
SYF2-201ENST00000236273 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
SYF2-201ENST00000236273 BBOX1O75936 387 aa28.28■■■□□ 2.12
SYF2-201ENST00000236273 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
SYF2-201ENST00000236273 CCDC93Q567U6 631 aa28.28■■■□□ 2.12
SYF2-201ENST00000236273 SOGA3Q5TF21 947 aa28.28■■■□□ 2.12
SYF2-201ENST00000236273 C9orf131Q5VYM1 1079 aa28.28■■■□□ 2.12
SYF2-201ENST00000236273 TTLL11Q8NHH1 800 aa28.28■■■□□ 2.12
SYF2-201ENST00000236273 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
SYF2-201ENST00000236273 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa28.27■■■□□ 2.12
SYF2-201ENST00000236273 SEC31BQ9NQW1 1179 aa28.27■■■□□ 2.12
SYF2-201ENST00000236273 LTBP3Q9NS15 1303 aa28.27■■■□□ 2.12
SYF2-201ENST00000236273 CTSWP56202 376 aa28.26■■■□□ 2.11
SYF2-201ENST00000236273 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa28.26■■■□□ 2.11
SYF2-201ENST00000236273 MYH3P11055 1940 aa28.26■■■□□ 2.11
SYF2-201ENST00000236273 GRM8O00222 908 aa28.25■■■□□ 2.11
SYF2-201ENST00000236273 ARHGAP45Q92619 1136 aa28.25■■■□□ 2.11
SYF2-201ENST00000236273 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
SYF2-201ENST00000236273 CSF1RP07333 972 aa28.24■■■□□ 2.11
SYF2-201ENST00000236273 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa28.24■■■□□ 2.11
SYF2-201ENST00000236273 RTKN2Q8IZC4 609 aa28.24■■■□□ 2.11
SYF2-201ENST00000236273 UTYO14607 1347 aa28.24■■■□□ 2.11
SYF2-201ENST00000236273 LMNB1P20700 586 aa28.23■■■□□ 2.11
SYF2-201ENST00000236273 FOXO4P98177 505 aa28.23■■■□□ 2.11
SYF2-201ENST00000236273 CCDC152Q4G0S7 254 aa28.23■■■□□ 2.11
SYF2-201ENST00000236273 SP8Q8IXZ3 490 aa28.23■■■□□ 2.11
SYF2-201ENST00000236273 TAOK3Q9H2K8 898 aa28.23■■■□□ 2.11
SYF2-201ENST00000236273 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP28.22■■■□□ 2.11
SYF2-201ENST00000236273 EPHA10Q5JZY3 1008 aa28.22■■■□□ 2.11
SYF2-201ENST00000236273 KAZALD1Q96I82 304 aa28.22■■■□□ 2.11
SYF2-201ENST00000236273 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
SYF2-201ENST00000236273 GREM2Q9H772 168 aa28.22■■■□□ 2.11
SYF2-201ENST00000236273 RNF181Q9P0P0 153 aa28.22■■■□□ 2.11
SYF2-201ENST00000236273 KIF16BQ96L93 1317 aa28.21■■■□□ 2.11
SYF2-201ENST00000236273 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
SYF2-201ENST00000236273 RPS8P62241 208 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
SYF2-201ENST00000236273 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
SYF2-201ENST00000236273 TNNQ9UQP3 1299 aa28.21■■■□□ 2.11
SYF2-201ENST00000236273 RTL9Q8NET4 1388 aa28.21■■■□□ 2.11
SYF2-201ENST00000236273 PSMD1Q99460 953 aa28.2■■■□□ 2.11
SYF2-201ENST00000236273 USP44Q9H0E7 712 aa28.2■■■□□ 2.11
SYF2-201ENST00000236273 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.11
SYF2-201ENST00000236273 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
SYF2-201ENST00000236273 LRRC37AA6NMS7 1700 aa28.19■■■□□ 2.1
SYF2-201ENST00000236273 TMC4Q7Z404 712 aa28.18■■■□□ 2.1
SYF2-201ENST00000236273 SUCLG2Q96I99 432 aa28.18■■■□□ 2.1
SYF2-201ENST00000236273 TRIM27P14373 513 aa28.18■■■□□ 2.1
SYF2-201ENST00000236273 GRIPAP1Q4V328 841 aa28.18■■■□□ 2.1
SYF2-201ENST00000236273 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
SYF2-201ENST00000236273 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa28.17■■■□□ 2.1
SYF2-201ENST00000236273 CCT4P50991 539 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
SYF2-201ENST00000236273 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
SYF2-201ENST00000236273 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
SYF2-201ENST00000236273 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
SYF2-201ENST00000236273 FAM161AQ3B820 660 aa28.15■■■□□ 2.1
SYF2-201ENST00000236273 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
SYF2-201ENST00000236273 ITGA6P23229 1130 aa28.14■■■□□ 2.09
SYF2-201ENST00000236273 LMBR1LQ6UX01 489 aa28.14■■■□□ 2.09
SYF2-201ENST00000236273 DUOX1Q9NRD9 1551 aa28.13■■■□□ 2.09
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa28.13■■■□□ 2.09
SYF2-201ENST00000236273 MPNDQ8N594 471 aa28.13■■■□□ 2.09
SYF2-201ENST00000236273 COL4A5P29400 1685 aa28.13■■■□□ 2.09
SYF2-201ENST00000236273 LTBP1Q14766 1721 aa28.12■■■□□ 2.09
SYF2-201ENST00000236273 IARSP41252 1262 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
SYF2-201ENST00000236273 GPSM2P81274 684 aa28.12■■■□□ 2.09
SYF2-201ENST00000236273 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
SYF2-201ENST00000236273 TIAM2Q8IVF5 1701 aa28.11■■■□□ 2.09
SYF2-201ENST00000236273 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa28.11■■■□□ 2.09
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD44Q8N8A2 993 aa28.11■■■□□ 2.09
SYF2-201ENST00000236273 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
SYF2-201ENST00000236273 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
SYF2-201ENST00000236273 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
SYF2-201ENST00000236273 CLUAP1Q96AJ1 413 aa28.1■■■□□ 2.09
SYF2-201ENST00000236273 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
SYF2-201ENST00000236273 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
SYF2-201ENST00000236273 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
SYF2-201ENST00000236273 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
SYF2-201ENST00000236273 POLLQ9UGP5 575 aa28.09■■■□□ 2.09
SYF2-201ENST00000236273 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
SYF2-201ENST00000236273 PODXL2Q9NZ53 605 aa28.08■■■□□ 2.09
SYF2-201ENST00000236273 SPEF2Q9C093 1822 aa28.07■■■□□ 2.08
SYF2-201ENST00000236273 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
SYF2-201ENST00000236273 MINPP1Q9UNW1 487 aa28.07■■■□□ 2.08
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa28.06■■■□□ 2.08
SYF2-201ENST00000236273 RLBP1P12271 317 aa28.06■■■□□ 2.08
SYF2-201ENST00000236273 MEIS3Q99687 375 aa28.06■■■□□ 2.08
SYF2-201ENST00000236273 VPS33BQ9H267 617 aa28.06■■■□□ 2.08
SYF2-201ENST00000236273 FZD9O00144 591 aa28.05■■■□□ 2.08
SYF2-201ENST00000236273 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
SYF2-201ENST00000236273 AOC3Q16853 763 aa28.05■■■□□ 2.08
SYF2-201ENST00000236273 TMEM57Q8N5G2 664 aa28.05■■■□□ 2.08
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D16Q8TBP0 767 aa28.05■■■□□ 2.08
SYF2-201ENST00000236273 RCAN3Q9UKA8 241 aa28.05■■■□□ 2.08
SYF2-201ENST00000236273 GLTPD2A6NH11 291 aa28.04■■■□□ 2.08
SYF2-201ENST00000236273 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
SYF2-201ENST00000236273 SUPT20HQ8NEM7 779 aa28.04■■■□□ 2.08
SYF2-201ENST00000236273 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
SYF2-201ENST00000236273 CHMP3Q9Y3E7 222 aa28.04■■■□□ 2.08
SYF2-201ENST00000236273 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
SYF2-201ENST00000236273 KIAA2012Q0VF49 1180 aa28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms