RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216420.11

CGRRF1-201, Transcript of cell growth regulator with ring finger domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CGRRF1, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1-201ENST00000216420 RESTQ13127 1097 aa21.58■■□□□ 1.05
CGRRF1-201ENST00000216420 RGS22Q8NE09 1264 aa21.58■■□□□ 1.05
CGRRF1-201ENST00000216420 ETF1P62495 437 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 GGT6Q6P531 493 aa21.57■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 USP44Q9H0E7 712 aa21.57■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 CPS1P31327 1500 aa21.57■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 SULT6B1Q6IMI4 303 aa21.57■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa21.57■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 EXOC4Q96A65 974 aa21.57■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 SNRKQ9NRH2 765 aa21.57■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 CFAP45Q9UL16 551 aa21.57■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 LRRC37A3O60309 1634 aa21.56■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 TBC1D8O95759 1140 aa21.56■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 ST5P78524 1137 aa21.56■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 TEX2Q8IWB9 1127 aa21.56■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.56■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 OAS2P29728 719 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.55■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 CEP57L1Q8IYX8 460 aa21.55■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 NRDCO43847 1150 aa21.54■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 SURF6O75683 361 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 CCDC30Q5VVM6 783 aa21.54■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 SRLQ86TD4 932 aa21.54■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.54■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 AK7Q96M32 723 aa21.54■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 BPIFA3Q9BQP9 254 aa21.54■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 DNAI1Q9UI46 699 aa21.54■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.54■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa21.54■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 MAP4K1Q92918 833 aa21.54■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.54■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.53■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.53■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.53■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 DTNBO60941 627 aa21.53■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 ARMCX5Q6P1M9 558 aa21.53■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 REXO1L1PQ8IX06 675 aa21.53■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.53■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa21.52■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 BRMS1Q9HCU9 246 aa21.52■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 RCOR1Q9UKL0 485 aa21.52■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 SASH3O75995 380 aa21.52■■□□□ 1.04
CGRRF1-201ENST00000216420 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 TRIM65Q6PJ69 517 aa21.51■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 MNS1Q8NEH6 495 aa21.51■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 ENGASEQ8NFI3 743 aa21.51■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa21.51■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 RPS6KB1P23443 525 aa21.51■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 ICE2Q659A1 982 aa21.51■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 ATL3Q6DD88 541 aa21.51■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 SLC27A2O14975 620 aa21.5■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 PSME1Q06323 249 aa21.5■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 TSGA10IPQ3SY00 556 aa21.5■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa21.5■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 AOPEPQ8N6M6 819 aa21.5■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 LCMT1Q9UIC8 334 aa21.5■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 HIP1O00291 1037 aa21.49■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 RPS6KA5O75582 802 aa21.49■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 ADD1P35611 737 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 FAM160A1Q05DH4 1040 aa21.49■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 FCHSD1Q86WN1 690 aa21.49■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 C10orf67Q8IYJ2 551 aa21.49■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa21.49■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 JCADQ9P266 1359 aa21.49■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 TRIM66O15016 1216 aa21.48■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 ACTN2P35609 894 aa21.48■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa21.48■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 EVI5LQ96CN4 794 aa21.48■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 NALCNQ8IZF0 1738 aa21.48■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 IVLP07476 585 aa21.48■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa21.48■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.48■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 PARP3Q9Y6F1 533 aa21.48■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 PEAK1Q9H792 1746 aa21.47■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 KINO60870 393 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 EVCP57679 992 aa21.46■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa21.46■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 HOMER1Q86YM7 354 aa21.46■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 CERS3Q8IU89 383 aa21.46■■□□□ 1.03
CGRRF1-201ENST00000216420 FUT8Q9BYC5 575 aa21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 162.1 ms