RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416651.5

NIF3L1-206, Transcript of NGG1 interacting factor 3 like 1, human

TSL 2 BASIC

Gene NIF3L1, Length 967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NIF3L1-206	ENST00000416651	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	UPB1	Q9UBR1	384 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A0G2JMP0	313 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A0X1KG70	313 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	GNG14	A0A1W2PPG7	69 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	GJE1	A6NN92	205 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGLV1-44	P01699	117 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	CRYAA	P02489	173 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	NAT2	P11245	290 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCNA2	P20248	432 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	ACHE	P22303	614 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	FPR2	P25090	351 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	P2RX1	P51575	399 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF75D	P51815	510 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	C2orf80	Q0P641	193 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	HSPB3	Q12988	150 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF385B	Q569K4	471 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	HDX	Q7Z353	690 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	PDIK1L	Q8N165	341 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	MRAP	Q8TCY5	172 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	RDH5	Q92781	318 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	ACPT	Q9BZG2	426 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	PLXNB1	O43157	2135 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A1W2PQD3	144 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCDC151	A5D8V7	595 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651		M0QZ24	198 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	MANBA	O00462	879 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	SCD	O00767	359 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGHV2-5	P01817	119 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	C2	P06681	752 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	TFPI	P10646	304 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRPS2	P11908	318 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	SELE	P16581	610 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	MPG	P29372	298 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCR4	P51679	360 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC16A1	P53985	500 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	SESN3	P58005	492 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	PDK3	Q15120	406 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	KLHL26	Q53HC5	615 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	CDC73	Q6P1J9	531 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	MFSD4A	Q8N468	514 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	NUP37	Q8NFH4	326 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	CDS1	Q92903	461 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	EGLN2	Q96KS0	407 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	NOX3	Q9HBY0	568 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	C1RL	Q9NZP8	487 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	EMC3	Q9P0I2	261 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM159B	A6NKW6	160 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651		E7ESA3	106 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651		H0YL77	283 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24

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