RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	SPAG7	O75391	227 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	OR12D1	P0DN82	309 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	IMPDH2	P12268	514 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	OR2B6	P58173	313 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKRD46	Q86W74	232 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF563	Q8TA94	476 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	PROX1	Q92786	737 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	PRR14	Q9BWN1	585 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	PPCS	Q9HAB8	311 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	WDR45	Q9Y484	360 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM72	A0PK05	275 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKRD28	O15084	1053 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	C8B	P07358	591 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	CSF3	P09919	207 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	SRD5A1	P18405	259 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	MAGEA8	P43361	318 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	CLDN8	P56748	225 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	PHC1	P78364	1004 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	GGTLC2	Q14390	218 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	ROPN1L	Q96C74	230 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXO17	Q96EF6	278 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	EXD2	Q9NVH0	621 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	ASIC5	Q9NY37	505 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	MOK	Q9UQ07	419 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	GUSB	P08236	651 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	CREB1	P16220	341 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	NR4A2	P43354	598 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	GZMK	P49863	264 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	EMX2	Q04743	252 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	CHRNB3	Q05901	458 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC17A1	Q14916	467 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	SAXO2	Q658L1	398 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM166A	Q6J272	317 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	C3orf49	Q96BT1	292 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	SOX7	Q9BT81	388 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	FKRP	Q9H9S5	495 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	TLDC2	A0PJX2	215 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	HMGN4	O00479	90 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	KLF11	O14901	512 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	TACR3	P29371	465 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	MPG	P29372	298 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	THBS2	P35442	1172 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	SERPINB5	P36952	375 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	KHK	P50053	298 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	PDLIM4	P50479	330 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC35A1	P78382	337 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNJ10	P78508	379 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	LGALS3BP	Q08380	585 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		10.41	□□□□□ -0.74

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