RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GOLGA8NF8WBI6 632 aa23.09■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HDAC3O15379 428 aa23.09■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAD51DO75771 328 aa23.09■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NR2F1P10589 423 aa23.09■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EPHA3P29320 983 aa23.09■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAGEA8P43361 318 aa23.09■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PMM1Q92871 262 aa23.09■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DDIT4LQ96D03 193 aa23.09■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALG2Q9H553 416 aa23.09■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAIMQ9NVQ4 179 aa23.09■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASB6Q9NWX5 421 aa23.09■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OSGIN1Q9UJX0 560 aa23.09■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRPC5OSA6NMA1 111 aa23.08■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SHISA9B4DS77 424 aa23.08■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABCD4O14678 606 aa23.08■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL7RP16871 459 aa23.08■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDH11P55287 796 aa23.08■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COX20Q5RI15 118 aa23.08■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 THAP1Q9NVV9 213 aa23.08■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF223E7ERA6 249 aa23.07■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF208O43345 1280 aa23.07■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRT75O95678 551 aa23.07■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DBIP07108 87 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UQCRBP14927 111 aa23.07■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TACR3P29371 465 aa23.07■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NTF4P34130 210 aa23.07■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC1A3P43003 542 aa23.07■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDR4P57081 412 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC35A1P78382 337 aa23.07■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 H3F3AP84243 136 aa23.07■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM108Q6UXF1 575 aa23.07■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRIMA1Q86XR5 153 aa23.07■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR52N5Q8NH56 324 aa23.07■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RADILQ96JH8 1075 aa23.07■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa23.07■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAS2R16Q9NYV7 291 aa23.07■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MALT1Q9UDY8 824 aa23.07■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM120BA0PK00 339 aa23.06■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM72A0PK05 275 aa23.06■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CFAP73A6NFT4 308 aa23.06■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAAHO00519 579 aa23.06■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RFXANKO14593 260 aa23.06■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNNO75324 88 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD8AP01732 235 aa23.06■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KITP10721 976 aa23.06■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACVR1BP36896 505 aa23.06■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAP2K6P52564 334 aa23.06■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NXNQ6DKJ4 435 aa23.06■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CASP12Q6UXS9 341 aa23.06■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DTX2Q86UW9 622 aa23.06■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MGARPQ8TDB4 240 aa23.06■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRIP2Q9C0E4 1043 aa23.06■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MGAT4BQ9UQ53 548 aa23.06■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGHV4-39P01824 125 aa23.05■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IMPDH2P12268 514 aa23.05■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IDO1P14902 403 aa23.05■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF83P51522 516 aa23.05■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EPS8Q12929 822 aa23.05■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLHL17Q6TDP4 642 aa23.05■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PEX5LQ8IYB4 626 aa23.05■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa23.05■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HS6ST2Q96MM7 605 aa23.05■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 REG4Q9BYZ8 158 aa23.05■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PARPBPQ9NWS1 579 aa23.05■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa23.05■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC25A15Q9Y619 301 aa23.05■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLCO1B7G3V0H7 640 aa23.04■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC22A3O75751 556 aa23.04■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL6P05231 212 aa23.04■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 THBS1P07996 1170 aa23.04■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTAFRP25105 342 aa23.04■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GABRA6Q16445 453 aa23.04■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AGAP6Q5VW22 663 aa23.04■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATG16L1Q676U5 607 aa23.04■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR7E24Q6IFN5 339 aa23.04■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF440Q8IYI8 595 aa23.04■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MUS81Q96NY9 551 aa23.04■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 P2RX2Q9UBL9 471 aa23.04■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa23.04■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1W2PR80 420 aa23.03■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NDUFS7O75251 213 aa23.03■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP1-1Q07627 177 aa23.03■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GSTA3Q16772 222 aa23.03■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC22A25Q6T423 547 aa23.03■■□□□ 1.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms