RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 NR4A3Q92570 626 aa5□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 FAF2Q96CS3 445 aa5□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 CERS2Q96G23 380 aa5□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 MSANTD3Q96H12 275 aa5□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa5□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 SLC35A5Q9BS91 424 aa5□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa5□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 LIME1Q9H400 295 aa5□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 VPS8Q8N3P4 1428 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 MBD5Q9P267 1494 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 MLH3Q9UHC1 1453 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 IGLON5A6NGN9 336 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 PP2D1A8MPX8 630 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 C11orf98E9PRG8 122 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 KDELR3O43731 214 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 C1orf105O95561 183 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 MMP1P03956 469 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 CALML3P27482 149 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 GPR4P46093 362 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 GNPDA1P46926 289 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 UQCRFS1P47985 274 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 LIM2P55344 173 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 SLC8A3P57103 927 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 UPP1Q16831 310 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 VPS26BQ4G0F5 336 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 OR8G2PQ6IF36 304 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 APOOLQ6UXV4 268 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 C3P1Q6ZMU1 363 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 Q6ZRP5 223 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 LSMEM2Q8N112 164 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 B3GNT7Q8NFL0 401 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 OR4A15Q8NGL6 344 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 OR9A4Q8NGU2 314 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 ZNF596Q8TC21 504 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 SUN5Q8TC36 379 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 CD101Q93033 1021 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 TOMM40LQ969M1 308 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 NABP1Q96AH0 204 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 UGT1A10Q9HAW8 530 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 NUDT4Q9NZJ9 180 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 C9orf84Q5VXU9 1444 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 NCOA2Q15596 1464 aa4.99□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 ATP7AQ04656 1500 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 TTC3P53804 2025 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 PLSCR5A0PG75 271 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 CXCL13O43927 109 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 PFKFB2O60825 505 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 IGHV3-9P01782 118 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 FCGR3AP08637 254 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 CD48P09326 243 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 OPRL1P41146 370 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 CSRP3P50461 194 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 CCNG1P51959 295 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 ART1P52961 327 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 RAB10P61026 200 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 XRCC4Q13426 336 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 NECTIN1Q15223 517 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 HSDL1Q3SXM5 330 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 ACER2Q5QJU3 275 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 OR52W1Q6IF63 320 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 PRSS57Q6UWY2 283 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 LRRC31Q6UY01 552 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 UTS2BQ765I0 119 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 SPATA24Q86W54 205 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 TRIML2Q8N7C3 387 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 OR52I1Q8NGK6 324 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 OR10G7Q8NGN6 311 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 CD300LFQ8TDQ1 290 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 PAQR8Q8TEZ7 354 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 C8orf44Q96CB5 159 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 OR5B2Q96R09 309 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 CLCC1Q96S66 551 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 CABLES2Q9BTV7 478 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 RAB34Q9BZG1 259 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 PXMP2Q9NR77 195 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 DEPPQ9NTK1 212 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 THYN1Q9P016 225 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 KCNG2Q9UJ96 466 aa4.98□□□□□ -1.61
MDM2-201ENST00000258148 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.8 ms