RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586667.1

DNMT1-208, Transcript of DNA methyltransferase 1, human

TSL 2

Gene DNMT1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNMT1-208	ENST00000586667	CDH12	P55289	794 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	HSF1	Q00613	529 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	NFATC3	Q12968	1075 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	RAET1L	Q5VY80	246 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	FAR1	Q8WVX9	515 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	GPR137	Q96N19	417 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	CHID1	Q9BWS9	393 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	AURKC	Q9UQB9	309 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	MPDZ	O75970	2070 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	CHP2	O43745	196 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	NPIPB7	O75200	414 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	TRAPPC6A	O75865	159 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	GP1BB	P13224	206 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	RHCE	P18577	417 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	ADH6	P28332	368 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	LIMS1	P48059	325 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	LHX2	P50458	406 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	CLDN15	P56746	228 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	MERTK	Q12866	999 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	GGN	Q86UU5	652 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF563	Q8TA94	476 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	TMEM234	Q8WY98	164 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC38A4	Q969I6	547 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	SFXN2	Q96NB2	322 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	PIP5K1A	Q99755	562 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	C12orf10	Q9HB07	376 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	RHCG	Q9UBD6	479 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667		A0A1W2PRQ8	180 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	TMEM72	A0PK05	275 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667		H0YC42	278 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	AQP7	O14520	342 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNHIT1	O43257	154 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	HCN1	O60741	890 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	FZD7	O75084	574 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	TIPRL	O75663	272 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	KRT36	O76013	467 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	THRB	P10828	461 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	PTN	P21246	168 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	CLDN18	P56856	261 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	TAS2R41	P59536	307 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	COPZ1	P61923	177 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	EGR4	Q05215	589 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	CHRNB3	Q05901	458 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	SELENBP1	Q13228	472 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	DGCR6	Q14129	220 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC10A1	Q14973	349 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	TOMM20	Q15388	145 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	SEC23B	Q15437	767 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	ULK3	Q6PHR2	472 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	LILRA2	Q8N149	483 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	ADGRG7	Q96K78	797 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		11.35	□□□□□ -0.59

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