RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 SERPINF2P08697 491 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 CCNCP24863 283 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 HLA-FP30511 346 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 RRM2P31350 389 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 SLC1A2P43004 574 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 GNPDA1P46926 289 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 GZMMP51124 257 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 CTAG1AP78358 180 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 GALK2Q01415 458 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 LGALS3BPQ08380 585 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 POU6F1Q14863 301 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 NPTX1Q15818 432 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 CDO1Q16878 200 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 PARP15Q460N3 678 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 VPS26BQ4G0F5 336 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 PAGE2BQ5JRK9 111 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 PAGE3Q5JUK9 113 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 STPG1Q5TH74 334 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 KDM4DQ6B0I6 523 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 GLYATQ6IB77 296 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 SCYL2Q6P3W7 929 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 SLC27A1Q6PCB7 646 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
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TRDN-204ENST00000542443 PID1Q7Z2X4 250 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 SLC51BQ86UW2 128 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 CALHM3Q86XJ0 350 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 HIPK1Q86Z02 1210 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 CFAP206Q8IYR0 622 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 TCTE3Q8IZS6 198 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 METTL4Q8N3J2 472 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 CARNMT1Q8N4J0 409 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 ZNF555Q8NEP9 628 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 NDNFQ8TB73 568 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 UBA3Q8TBC4 463 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 TWIST2Q8WVJ9 160 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 RORBQ92753 470 aa4.51□□□□□ -1.69
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TRDN-204ENST00000542443 HPDLQ96IR7 371 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 ZNF599Q96NL3 588 aa4.51□□□□□ -1.69
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TRDN-204ENST00000542443 ATOH8Q96SQ7 321 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 SLC39A3Q9BRY0 314 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 ING2Q9H160 280 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 MFSD1Q9H3U5 465 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 NIPAL2Q9H841 368 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 C3orf14Q9HBI5 128 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 ACOT13Q9NPJ3 140 aa4.51□□□□□ -1.69
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TRDN-204ENST00000542443 GTSE1Q9NYZ3 720 aa4.51□□□□□ -1.69
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TRDN-204ENST00000542443 AURKCQ9UQB9 309 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 TPRKBQ9Y3C4 175 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 LIPGQ9Y5X9 500 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 PEX16Q9Y5Y5 336 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 MICAL3Q7RTP6 2002 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 A0A1W2PN81 502 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 ASB14A6NK59 587 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 FAM25AB3EWG3 89 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 FAM25CB3EWG5 89 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 FAM25GB3EWG6 89 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 G3V2T6 193 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 H0Y626 953 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 PSMD11O00231 422 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 NR5A2O00482 541 aa4.5□□□□□ -1.69
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TRDN-204ENST00000542443 TIMP3P35625 211 aa4.5□□□□□ -1.69
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TRDN-204ENST00000542443 PDX1P52945 283 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 MAPK12P53778 367 aa4.5□□□□□ -1.69
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