RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		9.56	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		9.56	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	APOOL	Q6UXV4	268 aa		9.56	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	SSX8	Q7RTT4	187 aa		9.56	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	SZRD1	Q7Z422	152 aa		9.56	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	TDRP	Q86YL5	185 aa		9.56	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		9.56	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	PIK3R3	Q92569	461 aa		9.56	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		9.56	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		9.56	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		9.56	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	9.56	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	9.56	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		9.56	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		9.56	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	C7orf72	A4D263	438 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	ALG1L2	C9J202	215 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511		E7EQL1	145 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	UPK1A	O00322	258 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	MANBA	O00462	879 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP6C	O00743	305 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	SCD	O00767	359 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	ULK1	O75385	1050 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	COL6A2	P12110	1019 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	CHN1	P15882	459 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	DDC	P20711	480 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC7A1	P30825	629 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	MAGEA4	P43358	317 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF83	P51522	516 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	EFNA4	P52798	201 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	PLTP	P55058	493 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6ZSR9	355 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6ZT83	130 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	TRABD2A	Q86V40	505 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC43A2	Q8N370	569 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR78	Q96P69	363 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	NPAS1	Q99742	590 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	ERP44	Q9BS26	406 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	PRSS50	Q9UI38	385 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		9.55	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	CIB4	A0PJX0	185 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC36	A6NLP5	189 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511		C9JVG2	144 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511		M0R1B8	84 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	TGFA	P01135	160 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	GSTM5	P46439	218 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	PDLIM4	P50479	330 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	PRKAG1	P54619	331 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXF1	Q12946	379 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC29A2	Q14542	456 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	RASA2	Q15283	850 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	TEX35	Q5T0J7	233 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	MISP	Q8IVT2	679 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2L13	Q8N349	312 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4C3	Q8NH37	302 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	OR52N5	Q8NH56	324 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXO30	Q8TB52	745 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	METTL6	Q8TCB7	284 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	ELP4	Q96EB1	424 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	APIP	Q96GX9	242 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC140	Q96MF4	163 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	TRMO	Q9BU70	441 aa		9.54	□□□□□ -0.88

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