RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMCC2O75069 709 aa23.26■■□□□ 1.31
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADAP00813 363 aa23.26■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PAX1P15863 534 aa23.26■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CASP9P55211 416 aa23.26■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 P2RY6Q15077 328 aa23.26■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATAD3BQ5T9A4 648 aa23.26■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANXA8L1Q5VT79 327 aa23.26■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa23.26■■□□□ 1.31
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MIPOL1Q8TD10 442 aa23.26■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.31
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PSD2Q9BQI7 771 aa23.26■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BCO1Q9HAY6 547 aa23.26■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NGBQ9NPG2 151 aa23.26■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SERINC1Q9NRX5 453 aa23.26■■□□□ 1.31
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 H6PDO95479 791 aa23.25■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PGCP20142 388 aa23.25■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UQCRC2P22695 453 aa23.25■■□□□ 1.31
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SESN3P58005 492 aa23.25■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAB1Q15750 504 aa23.25■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa23.25■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM234Q8WY98 164 aa23.25■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSD17B8Q92506 261 aa23.25■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C20orf27Q9GZN8 174 aa23.25■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP23.25■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF115Q9Y4L5 304 aa23.25■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 V9GYY5 206 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZANQ9Y493 2812 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FREM1Q5H8C1 2179 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF814B7Z6K7 855 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TM9SF1O15321 606 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCN2BO60939 215 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR12D1P0DN82 309 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC1A6P48664 564 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MERTKQ12866 999 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITGADQ13349 1161 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF619Q8N2I2 560 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 XAGE5Q8WWM1 108 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TESCQ96BS2 214 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACER3Q9NUN7 267 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDR45Q9Y484 360 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIAA0513O60268 411 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYTIPO60759 359 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GUSBP08236 651 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR3A2P47893 321 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHC1P78364 1004 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAPK14Q16539 360 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NCMAPQ5T1S8 102 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADAM5Q6NVV9 412 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q6ZT83 130 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIRREL3Q8IZU9 778 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OIT3Q8WWZ8 545 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB8BQ92930 207 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SORT1Q99523 831 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POTEKPQ9BYX7 375 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POLE3Q9NRF9 147 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C9JVG2 144 aa23.22■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLOCKO15516 846 aa23.22■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD3EP07766 207 aa23.22■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DHRS4L1P0CG22 281 aa23.22■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DIO1P49895 249 aa23.22■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SAXO2Q658L1 398 aa23.22■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ROPN1LQ96C74 230 aa23.22■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUF2Q9BZD4 464 aa23.22■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRSS50Q9UI38 385 aa23.22■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LAMP3Q9UQV4 416 aa23.22■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa23.22■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USF3Q68DE3 2245 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FN1P02751 2386 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TLN2Q9Y4G6 2542 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKRD28O15084 1053 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LBPP18428 481 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BGNP21810 368 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PGM1P36871 562 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KHKP50053 298 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
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