RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272638.13

UBXN4-201, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN4, Length 4,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-201ENST00000272638 ARHGAP40Q5TG30 622 aa11.66□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 ABCA7Q8IZY2 2146 aa11.66□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 SHISA5Q8N114 240 aa11.66□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 MEIOCA2RUB1 952 aa11.66□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 ORC5O43913 435 aa11.66□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 OR2B3O76000 313 aa11.66□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 CXCR1P25024 350 aa11.66□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 FABP5Q01469 135 aa11.66□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 DECR1Q16698 335 aa11.66□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 OR5W2Q8NH69 310 aa11.66□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 SLC6A18Q96N87 628 aa11.66□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 TCF7L1Q9HCS4 588 aa11.66□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 FBXO8Q9NRD0 319 aa11.66□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 C20orf141Q9NUB4 165 aa11.66□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa11.66□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 CEP250Q9BV73 2442 aa11.66□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 A0A0B4J203 849 aa11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 A0A1B0GWA3 101 aa11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 SMLR1H3BR10 107 aa11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 CHRNB1P11230 501 aa11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 LEG1Q6P5S2 330 aa11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 TOMM5Q8N4H5 51 aa11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 SMPDL3BQ92485 455 aa11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 FAM210AQ96ND0 272 aa11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 NANSQ9NR45 359 aa11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 A0A0J9YY10 115 aa11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 PROS1P07225 676 aa11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 ADAM15Q13444 863 aa11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.545e-7■■■■□ 24.1
UBXN4-201ENST00000272638 SGTBQ96EQ0 304 aa11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 WDR34Q96EX3 536 aa11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 FCRL1Q96LA6 429 aa11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 CDCA4Q9BXL8 241 aa11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 NOTCH4Q99466 2003 aa11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 GAS6Q14393 721 aa11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 BCL2L15Q5TBC7 163 aa11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 C1orf53Q5VUE5 145 aa11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 TMEM92Q6UXU6 159 aa11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 GID4Q8IVV7 300 aa11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 NMNAT3Q96T66 252 aa11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 CFHR5Q9BXR6 569 aa11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 MCOLN1Q9GZU1 580 aa11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 LOC100509620A0A075B734 347 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 C2orf72A6NCS6 295 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 ACOD1A6NK06 481 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 CDC42EP2O14613 210 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 CASP3P42574 277 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 CTXN1P60606 82 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 NSDHLQ15738 373 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 CCDC80Q76M96 950 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF511Q8NB15 262 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 OR4Q3Q8NH05 313 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 ASB15Q8WXK1 588 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 TSSK2Q96PF2 358 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 LMAN1LQ9HAT1 526 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 SLC22A31A6NKX4 558 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 ANXA2P2A6NMY6 339 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 C17orf105B2RV13 164 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 GPR89AB7ZAQ6 455 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 MAS1P04201 325 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 GPR89BP0CG08 455 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 HYAL1Q12794 435 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 RAB30Q15771 203 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 ACSM3Q53FZ2 586 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 NXNL2Q5VZ03 156 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 SCAIQ8N9R8 606 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 SFXN5Q8TD22 340 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 BABAM2Q9NXR7 383 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 FKBP7Q9Y680 259 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 HYKKA2RU49 373 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN4-201ENST00000272638 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms