RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330334.7

HDDC3-201, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HDDC3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-201ENST00000330334 PPP3CBP16298 524 aa15.88■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 CD53P19397 219 aa15.88■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 KLK2P20151 261 aa15.88■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 MATN1P21941 496 aa15.88■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 CCKARP32238 428 aa15.88■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 KCNJ5P48544 419 aa15.88■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 CTBP2P56545 445 aa15.88■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 PPP2R2AP63151 447 aa15.88■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF141Q15928 474 aa15.88■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 SLC25A53Q5H9E4 307 aa15.88■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 ANXA8L1Q5VT79 327 aa15.88■□□□□ 0.13
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HDDC3-201ENST00000330334 OR5AK3PQ8NH89 298 aa15.88■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 MARK4Q96L34 752 aa15.88■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 MRGPRX4Q96LA9 322 aa15.88■□□□□ 0.13
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HDDC3-201ENST00000330334 FANCFQ9NPI8 374 aa15.88■□□□□ 0.13
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HDDC3-201ENST00000330334 KLHL28Q9NXS3 571 aa15.88■□□□□ 0.13
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HDDC3-201ENST00000330334 ANKRD28O15084 1053 aa15.87■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 EFNA2O43921 213 aa15.87■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 STX11O75558 287 aa15.87■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 AGR2O95994 175 aa15.87■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 FOSL1P15407 271 aa15.87■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 ADAM8P78325 824 aa15.87■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 STX3Q13277 289 aa15.87■□□□□ 0.13
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HDDC3-201ENST00000330334 DPY19L1Q2PZI1 675 aa15.87■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa15.87■□□□□ 0.13
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HDDC3-201ENST00000330334 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa15.87■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 OGFOD2Q6N063 350 aa15.87■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 CLECL1Q8IZS7 167 aa15.87■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 OR5D16Q8NGK9 328 aa15.87■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 OR5W2Q8NH69 310 aa15.87■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 OR10A4Q9H209 315 aa15.87■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 MEAF6Q9HAF1 191 aa15.87■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP15.87■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa15.86■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 SERINC4A6NH21 518 aa15.86■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 NPIPA7E9PJI5 369 aa15.86■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 SIAH2O43255 324 aa15.86■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF264O43296 627 aa15.86■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 OIP5O43482 229 aa15.86■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 NUDT14O95848 222 aa15.86■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 OPN1LWP04000 364 aa15.86■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 NPIPA8P0DM63 369 aa15.86■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 PRKCAP17252 672 aa15.86■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 LBPP18428 481 aa15.86■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 UQCRC2P22695 453 aa15.86■□□□□ 0.13
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HDDC3-201ENST00000330334 BEND4Q6ZU67 534 aa15.86■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 STK32CQ86UX6 486 aa15.86■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 FBXO27Q8NI29 283 aa15.86■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 PIP5K1AQ99755 562 aa15.86■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF350Q9GZX5 532 aa15.86■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 LAT2Q9GZY6 243 aa15.86■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 SERHL2Q9H4I8 314 aa15.86■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 TMEM185BQ9H7F4 350 aa15.86■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 KCNK9Q9NPC2 374 aa15.86■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 POLE3Q9NRF9 147 aa15.86■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 EXD2Q9NVH0 621 aa15.86■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 VPS13CQ709C8 3753 aa15.85■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa15.85■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 ESPNB1AK53 854 aa15.85■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 FCMRO60667 390 aa15.85■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 UBL4AP11441 157 aa15.85■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 BGNP21810 368 aa15.85■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 HOXC12P31275 282 aa15.85■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 SLC18A1P54219 525 aa15.85■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 RPS26P62854 115 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 PHC1P78364 1004 aa15.85■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 CBFBQ13951 182 aa15.85■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 CASP8Q14790 479 aa15.85■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 PPP4R4Q6NUP7 873 aa15.85■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 STAC2Q6ZMT1 411 aa15.85■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 OR4A15Q8NGL6 344 aa15.85■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 RNF128Q8TEB7 428 aa15.85■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 ARL8AQ96BM9 186 aa15.85■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 SLC35G5Q96KT7 338 aa15.85■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 PPP1R36Q96LQ0 422 aa15.85■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 NUF2Q9BZD4 464 aa15.85■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 KLHL4Q9C0H6 718 aa15.85■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 CENPHQ9H3R5 247 aa15.85■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 DLL4Q9NR61 685 aa15.85■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 CLEC4AQ9UMR7 237 aa15.85■□□□□ 0.13
HDDC3-201ENST00000330334 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
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