RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 MMP28Q9H239 520 aa4.56□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 GORASP2Q9H8Y8 452 aa4.56□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 FANCEQ9HB96 536 aa4.56□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 BFARQ9NZS9 450 aa4.56□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 TXNDC16Q9P2K2 825 aa4.56□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 VANGL2Q9ULK5 521 aa4.56□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 TRAPPC4Q9Y296 219 aa4.56□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 ACOT9Q9Y305 439 aa4.56□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 UTRNP46939 3433 aa4.56□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 SBF1O95248 1867 aa4.56□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 TRIP11Q15643 1979 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 A0A1W2PP18 115 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 FAM92AA1XBS5 289 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 METTL15A6NJ78 407 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 A8MT66 165 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 EVPLLA8MZ36 301 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 E9PI62 339 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 M0QYV0 167 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 P2RY10O00398 339 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 MFSD11O43934 449 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 DPM1O60762 260 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 KCNK2O95069 426 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 SNAP29O95721 258 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 KRT6AP02538 564 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 TNNC2P02585 160 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 CHRNA1P02708 482 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 KRT6BP04259 564 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 ASNSP08243 561 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 RBP1P09455 135 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 RAB40ALP0C0E4 278 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 THRBP10828 461 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 FGF5P12034 268 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 PAX1P15863 534 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 NELFEP18615 380 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 PTPN3P26045 913 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 PSMB4P28070 264 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 OXTRP30559 389 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 SLC6A6P31641 620 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 DDOSTP39656 456 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 DCTP40126 519 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 MAGEA11P43364 429 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 CCR10P46092 362 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 GSK3BP49841 420 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 STX1BP61266 288 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 SLC35A2P78381 396 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 ZNF45Q02386 682 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 PRKCZQ05513 592 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 NME3Q13232 169 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 RCAN2Q14206 197 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 ADPRMQ3LIE5 342 aa4.55□□□□□ -1.68
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TRDN-204ENST00000542443 ZNF691Q5VV52 312 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 UBE2UQ5VVX9 321 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 AGAP6Q5VW22 663 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 PNCKQ6P2M8 343 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 C19orf48Q6RUI8 117 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 TBPL2Q6SJ96 375 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 CATSPER4Q7RTX7 472 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 SPATA19Q7Z5L4 167 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 AKAP14Q86UN6 197 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 UNC93AQ86WB7 457 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 COMMD2Q86X83 199 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 MFSD6LQ8IWD5 586 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 PEX5LQ8IYB4 626 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 CLYBLQ8N0X4 340 aa4.55□□□□□ -1.68
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TRDN-204ENST00000542443 Q8NFD4 153 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 OR6F1Q8NGZ6 308 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 FGFBP3Q8TAT2 258 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 SETD6Q8TBK2 473 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 FAM110BQ8TC76 370 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 KCTD4Q8WVF5 259 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 LRRC58Q96CX6 371 aa4.55□□□□□ -1.68
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TRDN-204ENST00000542443 C12orf42Q96LP6 360 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 SFXN2Q96NB2 322 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 MUS81Q96NY9 551 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 AGAP4Q96P64 663 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 LRRC3BQ96PB8 259 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 UGT2B28Q9BY64 529 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 DSN1Q9H410 356 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 SIAEQ9HAT2 523 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 C12orf10Q9HB07 376 aa4.55□□□□□ -1.68
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