RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494956.1

NELFE-213, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-213ENST00000494956 KCNN3Q9UGI6 736 aa9.58□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 OTOGQ6ZRI0 2925 aa9.58□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 HEATR5AQ86XA9 2040 aa9.57□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 ALG1L2C9J202 215 aa9.57□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 C9JVG2 144 aa9.57□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 HCRTR2O43614 444 aa9.57□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 NDUFB5O43674 189 aa9.57□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 RCBTB2O95199 551 aa9.57□□□□□ -0.88
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NELFE-213ENST00000494956 IL11P20809 199 aa9.57□□□□□ -0.88
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NELFE-213ENST00000494956 HBA1P69905 142 aa9.57□□□□□ -0.88
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NELFE-213ENST00000494956 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 JKAMPQ9P055 326 aa9.57□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa9.56□□□□□ -0.88
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NELFE-213ENST00000494956 TM9SF1O15321 606 aa9.56□□□□□ -0.88
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NELFE-213ENST00000494956 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP9.56□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 PPP4R4Q6NUP7 873 aa9.56□□□□□ -0.88
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NELFE-213ENST00000494956 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa9.56□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 FNDC9Q8TBE3 224 aa9.56□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 POC1BQ8TC44 478 aa9.56□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 OR5P2Q8WZ92 322 aa9.56□□□□□ -0.88
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NELFE-213ENST00000494956 UCN2Q96RP3 112 aa9.56□□□□□ -0.88
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NELFE-213ENST00000494956 TMEM185BQ9H7F4 350 aa9.56□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 PTGES2Q9H7Z7 377 aa9.56□□□□□ -0.88
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NELFE-213ENST00000494956 RAP2CQ9Y3L5 183 aa9.56□□□□□ -0.88
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NELFE-213ENST00000494956 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa9.55□□□□□ -0.88
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NELFE-213ENST00000494956 SLC22A20A6NK97 555 aa9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 A6NNC1 897 aa9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP9.55□□□□□ -0.88
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NELFE-213ENST00000494956 IL18BPO95998 194 aa9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 MYZAPP0CAP1 466 aa9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 KITP10721 976 aa9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 SHC1P29353 583 aa9.55□□□□□ -0.88
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