RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MKS1Q9NXB0 559 aa23.55■■□□□ 1.36
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A087WZY1 265 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNK2O95069 426 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CGAP01215 116 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHRNGP07510 517 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FGF4P08620 206 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD8BP10966 210 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BCKDHAP12694 445 aa23.54■■□□□ 1.36
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBXA2RP21731 343 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UGT2B10P36537 528 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNJ5P48544 419 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DUSP5Q16690 384 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MFSD12Q6NUT3 480 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FIGNL1Q6PIW4 674 aa23.54■■□□□ 1.36
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GGNQ86UU5 652 aa23.54■■□□□ 1.36
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TWIST2Q8WVJ9 160 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PROCRQ9UNN8 238 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRAF6Q9Y4K3 522 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM233B4DJY2 109 aa23.53■■□□□ 1.36
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALOX5P09917 674 aa23.53■■□□□ 1.36
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALDH3A1P30838 453 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP4R4Q6NUP7 873 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COX18Q8N8Q8 333 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BANPQ8N9N5 519 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF610Q8N9Z0 462 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GATSQ8NAP1 163 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WFDC11Q8NEX6 87 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C16orf58Q96GQ5 468 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POM121Q96HA1 1249 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRRG4Q9BZD6 226 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM114B3SHH9 223 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C16orf97H3BN30 126 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIP5K1BO14986 540 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AQP8O94778 261 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HPGDP15428 266 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LCN1P31025 176 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HOXC12P31275 282 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HPCAL1P37235 193 aa23.52■■□□□ 1.36
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UGT3A2Q3SY77 523 aa23.52■■□□□ 1.36
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRIG3Q6UXM1 1119 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM214BQ7L5A3 538 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZAR1Q86SH2 424 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR2W6PQ8NHA6 318 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 JADE3Q92613 823 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBQLN4Q9NRR5 601 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DEFB108AA8MXU0 73 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CRYGSP22914 178 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAPK1P28482 360 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCKARP32238 428 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SERPINB4P48594 390 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRIM2P49643 509 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MLC1Q15049 377 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRABD2AQ86V40 505 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACTRT2Q8TDY3 377 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBTB8AQ96BR9 441 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIK3IP1Q96FE7 263 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP3R2Q96LZ3 170 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MECRQ9BV79 373 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBXO34Q9NWN3 711 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP6V1HQ9UI12 483 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UQCRHLA0A096LP55 91 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1W2PRB8 838 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCDO00767 359 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SIAH2O43255 324 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPL3P39023 403 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF550Q7Z398 422 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MISPQ8IVT2 679 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AGR3Q8TD06 166 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 L2HGDHQ9H9P8 463 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MED17Q9NVC6 651 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC17A7Q9P2U7 560 aa23.5■■□□□ 1.35
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