RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638448.1

GYPB-216, Transcript of glycophorin B (MNS blood group), human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GYPB, Length 363 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GYPB-216	ENST00000638448	BTBD6	Q96KE9	485 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GYPB-216	ENST00000638448	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
GYPB-216	ENST00000638448	SERTM1	A2A2V5	107 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448		M0R2N6	131 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	CHSY3	Q70JA7	882 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	GNB5	O14775	395 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	ATP2B4	P23634	1241 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	SEC13	P55735	322 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	DPYD	Q12882	1025 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	LAMC2	Q13753	1193 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	MARK1	Q9P0L2	795 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	SLAIN2	Q9P270	581 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	SFI1	A8K8P3	1242 aa		5	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	POTEA	Q6S8J7	498 aa		5	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		5	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448		E9PSI1	815 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	C21orf2	O43822	256 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	OCLN	Q16625	522 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	SYT9	Q86SS6	491 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	COL26A1	Q96A83	441 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	SLC30A3	Q99726	388 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	PIK3R2	O00459	728 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	TRIM11	Q96F44	468 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	MDFI	Q99750	246 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	ADAM23	O75077	832 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	CHRNA4	P43681	627 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	BAG6	P46379	1132 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	TYRO3	Q06418	890 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	SPEM2	Q0P670	501 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	ELOA3	Q8NG57	546 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	CEP63	Q96MT8	703 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	BRD7	Q9NPI1	651 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GYPB-216	ENST00000638448	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	SIN3B	O75182	1162 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	LGR5	O75473	907 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	WEE1	P30291	646 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	CD163	Q86VB7	1156 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	SUSD3	Q96L08	255 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	COL19A1	Q14993	1142 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	TNFRSF25	Q93038	417 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	NGLY1	Q96IV0	654 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	FOXO3	O43524	673 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	ICMT	O60725	284 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	ALB	P02768	609 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	FURIN	P09958	794 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	ALAS2	P22557	587 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	ADH7	P40394	386 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	SERPINB4	P48594	390 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	KCNQ4	P56696	695 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	PLVAP	Q9BX97	442 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448		M0R082	166 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	IGFBP4	P22692	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62

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