RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636077.1

FBXO31-208, Transcript of F-box protein 31, human

TSL 5

Gene FBXO31, Length 660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO31-208	ENST00000636077	SYNE4	Q8N205	404 aa		28.33	■■■□□ 2.13
FBXO31-208	ENST00000636077	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	28.32	■■■□□ 2.12
FBXO31-208	ENST00000636077	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		28.32	■■■□□ 2.12
FBXO31-208	ENST00000636077	SRGN	P10124	158 aa		28.31	■■■□□ 2.12
FBXO31-208	ENST00000636077	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	28.31	■■■□□ 2.12
FBXO31-208	ENST00000636077	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		28.31	■■■□□ 2.12
FBXO31-208	ENST00000636077	ADCY9	O60503	1353 aa		28.3	■■■□□ 2.12
FBXO31-208	ENST00000636077	YY1	P25490	414 aa		28.3	■■■□□ 2.12
FBXO31-208	ENST00000636077	KSR2	Q6VAB6	950 aa		28.3	■■■□□ 2.12
FBXO31-208	ENST00000636077	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	28.3	■■■□□ 2.12
FBXO31-208	ENST00000636077	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		28.29	■■■□□ 2.12
FBXO31-208	ENST00000636077	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	28.29	■■■□□ 2.12
FBXO31-208	ENST00000636077	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	28.29	■■■□□ 2.12
FBXO31-208	ENST00000636077	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		28.29	■■■□□ 2.12
FBXO31-208	ENST00000636077	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		28.29	■■■□□ 2.12
FBXO31-208	ENST00000636077	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		28.29	■■■□□ 2.12
FBXO31-208	ENST00000636077	MYD88	Q99836	296 aa		28.29	■■■□□ 2.12
FBXO31-208	ENST00000636077	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		28.29	■■■□□ 2.12
FBXO31-208	ENST00000636077	CACNA1S	Q13698	1873 aa		28.29	■■■□□ 2.12
FBXO31-208	ENST00000636077	SLX4	Q8IY92	1834 aa		28.28	■■■□□ 2.12
FBXO31-208	ENST00000636077	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	28.28	■■■□□ 2.12
FBXO31-208	ENST00000636077	FLII	Q13045	1269 aa		28.28	■■■□□ 2.12
FBXO31-208	ENST00000636077	TTLL6	Q8N841	843 aa		28.28	■■■□□ 2.12
FBXO31-208	ENST00000636077	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	28.28	■■■□□ 2.12
FBXO31-208	ENST00000636077	STYK1	Q6J9G0	422 aa		28.27	■■■□□ 2.12
FBXO31-208	ENST00000636077	MASTL	Q96GX5	879 aa		28.27	■■■□□ 2.12
FBXO31-208	ENST00000636077	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	28.26	■■■□□ 2.11
FBXO31-208	ENST00000636077	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		28.26	■■■□□ 2.11
FBXO31-208	ENST00000636077	CRY2	Q49AN0	593 aa		28.25	■■■□□ 2.11
FBXO31-208	ENST00000636077	LAMB2	P55268	1798 aa		28.24	■■■□□ 2.11
FBXO31-208	ENST00000636077	IGKV5-2	P06315	115 aa		28.24	■■■□□ 2.11
FBXO31-208	ENST00000636077	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	28.23	■■■□□ 2.11
FBXO31-208	ENST00000636077	NPR1	P16066	1061 aa		28.23	■■■□□ 2.11
FBXO31-208	ENST00000636077	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		28.23	■■■□□ 2.11
FBXO31-208	ENST00000636077	FAM89A	Q96GI7	184 aa		28.23	■■■□□ 2.11
FBXO31-208	ENST00000636077	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	28.23	■■■□□ 2.11
FBXO31-208	ENST00000636077	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		28.22	■■■□□ 2.11
FBXO31-208	ENST00000636077	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		28.22	■■■□□ 2.11
FBXO31-208	ENST00000636077	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	28.22	■■■□□ 2.11
FBXO31-208	ENST00000636077	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	28.21	■■■□□ 2.11
FBXO31-208	ENST00000636077	CNKSR1	Q969H4	720 aa		28.21	■■■□□ 2.11
FBXO31-208	ENST00000636077	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	28.2	■■■□□ 2.1
FBXO31-208	ENST00000636077	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		28.2	■■■□□ 2.1
FBXO31-208	ENST00000636077	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		28.2	■■■□□ 2.1
FBXO31-208	ENST00000636077	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	28.2	■■■□□ 2.1
FBXO31-208	ENST00000636077	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	28.2	■■■□□ 2.1
FBXO31-208	ENST00000636077	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	28.19	■■■□□ 2.1
FBXO31-208	ENST00000636077	NLRP3	Q96P20	1036 aa		28.19	■■■□□ 2.1
FBXO31-208	ENST00000636077		F6X3S4	739 aa		28.18	■■■□□ 2.1
FBXO31-208	ENST00000636077	C21orf2	O43822	256 aa		28.18	■■■□□ 2.1
FBXO31-208	ENST00000636077	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	28.18	■■■□□ 2.1
FBXO31-208	ENST00000636077	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	28.18	■■■□□ 2.1
FBXO31-208	ENST00000636077	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		28.18	■■■□□ 2.1
FBXO31-208	ENST00000636077	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		28.18	■■■□□ 2.1
FBXO31-208	ENST00000636077	SBF1	O95248	1867 aa		28.17	■■■□□ 2.1
FBXO31-208	ENST00000636077	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	28.17	■■■□□ 2.1
FBXO31-208	ENST00000636077	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	28.17	■■■□□ 2.1
FBXO31-208	ENST00000636077	TAF1	P21675	1872 aa		28.17	■■■□□ 2.1
FBXO31-208	ENST00000636077	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		28.16	■■■□□ 2.1
FBXO31-208	ENST00000636077	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		28.15	■■■□□ 2.1
FBXO31-208	ENST00000636077	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		28.15	■■■□□ 2.1
FBXO31-208	ENST00000636077	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	28.14	■■■□□ 2.1
FBXO31-208	ENST00000636077	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	28.14	■■■□□ 2.1
FBXO31-208	ENST00000636077	PRELP	P51888	382 aa		28.14	■■■□□ 2.1
FBXO31-208	ENST00000636077	OLFM4	Q6UX06	510 aa		28.14	■■■□□ 2.1
FBXO31-208	ENST00000636077	SLC51A	Q86UW1	340 aa		28.14	■■■□□ 2.1
FBXO31-208	ENST00000636077	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	28.14	■■■□□ 2.1
FBXO31-208	ENST00000636077	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		28.13	■■■□□ 2.09
FBXO31-208	ENST00000636077	NFKBIE	O00221	500 aa		28.13	■■■□□ 2.09
FBXO31-208	ENST00000636077	ALDH1B1	P30837	517 aa		28.13	■■■□□ 2.09
FBXO31-208	ENST00000636077	RASSF7	Q02833	373 aa		28.13	■■■□□ 2.09
FBXO31-208	ENST00000636077	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		28.13	■■■□□ 2.09
FBXO31-208	ENST00000636077	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		28.13	■■■□□ 2.09
FBXO31-208	ENST00000636077	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		28.13	■■■□□ 2.09
FBXO31-208	ENST00000636077	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		28.12	■■■□□ 2.09
FBXO31-208	ENST00000636077	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	28.12	■■■□□ 2.09
FBXO31-208	ENST00000636077	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	28.11	■■■□□ 2.09
FBXO31-208	ENST00000636077	BEND3	Q5T5X7	828 aa		28.11	■■■□□ 2.09
FBXO31-208	ENST00000636077	LINS1	Q8NG48	757 aa		28.11	■■■□□ 2.09
FBXO31-208	ENST00000636077	GCKR	Q14397	625 aa		28.1	■■■□□ 2.09
FBXO31-208	ENST00000636077	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	28.1	■■■□□ 2.09
FBXO31-208	ENST00000636077	COL4A1	P02462	1669 aa		28.1	■■■□□ 2.09
FBXO31-208	ENST00000636077		H7C1W4	665 aa		28.09	■■■□□ 2.09
FBXO31-208	ENST00000636077	ABCC4	O15439	1325 aa		28.09	■■■□□ 2.09
FBXO31-208	ENST00000636077	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	28.07	■■■□□ 2.08
FBXO31-208	ENST00000636077	CASP7	P55210	303 aa		28.07	■■■□□ 2.08
FBXO31-208	ENST00000636077	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		28.07	■■■□□ 2.08
FBXO31-208	ENST00000636077	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		28.07	■■■□□ 2.08
FBXO31-208	ENST00000636077	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		28.07	■■■□□ 2.08
FBXO31-208	ENST00000636077	SNED1	Q8TER0	1413 aa		28.06	■■■□□ 2.08
FBXO31-208	ENST00000636077	PTPRC	P08575	1304 aa		28.04	■■■□□ 2.08
FBXO31-208	ENST00000636077	PDE8A	O60658	829 aa		28.04	■■■□□ 2.08
FBXO31-208	ENST00000636077	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		28.04	■■■□□ 2.08
FBXO31-208	ENST00000636077	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	28.04	■■■□□ 2.08
FBXO31-208	ENST00000636077	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		28.04	■■■□□ 2.08
FBXO31-208	ENST00000636077	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	28.04	■■■□□ 2.08
FBXO31-208	ENST00000636077	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	28.03	■■■□□ 2.08
FBXO31-208	ENST00000636077	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	28.03	■■■□□ 2.08
FBXO31-208	ENST00000636077	CCDC93	Q567U6	631 aa		28.03	■■■□□ 2.08
FBXO31-208	ENST00000636077	MYH3	P11055	1940 aa		28.02	■■■□□ 2.08

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.8 ms