RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 H0YIN7 160 aa27.13■■□□□ 1.93
SGMS1-210ENST00000619438 KCNA3P22001 575 aa27.13■■□□□ 1.93
SGMS1-210ENST00000619438 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
SGMS1-210ENST00000619438 SSH1Q8WYL5 1049 aa27.13■■□□□ 1.93
SGMS1-210ENST00000619438 BRIP1Q9BX63 1249 aa27.13■■□□□ 1.93
SGMS1-210ENST00000619438 PDE6BP35913 854 aa27.12■■□□□ 1.93
SGMS1-210ENST00000619438 MVPQ14764 893 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
SGMS1-210ENST00000619438 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
SGMS1-210ENST00000619438 HYPKQ9NX55 129 aa27.12■■□□□ 1.93
SGMS1-210ENST00000619438 IGHDP01880 384 aa27.11■■□□□ 1.93
SGMS1-210ENST00000619438 GPTP24298 496 aa27.11■■□□□ 1.93
SGMS1-210ENST00000619438 C2CD5Q86YS7 1000 aa27.11■■□□□ 1.93
SGMS1-210ENST00000619438 KIF16BQ96L93 1317 aa27.11■■□□□ 1.93
SGMS1-210ENST00000619438 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC30Q5VVM6 783 aa27.1■■□□□ 1.93
SGMS1-210ENST00000619438 TSPYL6Q8N831 410 aa27.1■■□□□ 1.93
SGMS1-210ENST00000619438 TNNQ9UQP3 1299 aa27.09■■□□□ 1.93
SGMS1-210ENST00000619438 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa27.08■■□□□ 1.93
SGMS1-210ENST00000619438 NYXQ9GZU5 481 aa27.08■■□□□ 1.93
SGMS1-210ENST00000619438 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa27.08■■□□□ 1.93
SGMS1-210ENST00000619438 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.92
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP27.08■■□□□ 1.928e-8■■■■□ 21.4
SGMS1-210ENST00000619438 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.92
SGMS1-210ENST00000619438 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
SGMS1-210ENST00000619438 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa27.07■■□□□ 1.92
SGMS1-210ENST00000619438 SKAP1Q86WV1 359 aa27.07■■□□□ 1.92
SGMS1-210ENST00000619438 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
SGMS1-210ENST00000619438 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa27.06■■□□□ 1.92
SGMS1-210ENST00000619438 TRIM27P14373 513 aa27.06■■□□□ 1.92
SGMS1-210ENST00000619438 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa27.06■■□□□ 1.92
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF34Q8IZ26 560 aa27.06■■□□□ 1.92
SGMS1-210ENST00000619438 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa27.05■■□□□ 1.92
SGMS1-210ENST00000619438 NUP98P52948 1817 aa27.05■■□□□ 1.92
SGMS1-210ENST00000619438 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa27.05■■□□□ 1.92
SGMS1-210ENST00000619438 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa27.05■■□□□ 1.92
SGMS1-210ENST00000619438 TTLL6Q8N841 843 aa27.05■■□□□ 1.92
SGMS1-210ENST00000619438 STK31Q9BXU1 1019 aa27.05■■□□□ 1.92
SGMS1-210ENST00000619438 ATP10DQ9P241 1426 aa27.04■■□□□ 1.92
SGMS1-210ENST00000619438 PARP10Q53GL7 1025 aa27.04■■□□□ 1.92
SGMS1-210ENST00000619438 SUSD4Q5VX71 490 aa27.04■■□□□ 1.92
SGMS1-210ENST00000619438 PLBD2Q8NHP8 589 aa27.04■■□□□ 1.92
SGMS1-210ENST00000619438 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa27.04■■□□□ 1.92
SGMS1-210ENST00000619438 FAM161AQ3B820 660 aa27.03■■□□□ 1.92
SGMS1-210ENST00000619438 NUTM1Q86Y26 1132 aa27.03■■□□□ 1.92
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
SGMS1-210ENST00000619438 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
SGMS1-210ENST00000619438 DDX19BQ9UMR2 479 aa27.03■■□□□ 1.92
SGMS1-210ENST00000619438 DLEC1Q9Y238 1755 aa27.03■■□□□ 1.92
SGMS1-210ENST00000619438 TCIRG1Q13488 830 aa27.02■■□□□ 1.92
SGMS1-210ENST00000619438 RIC3Q7Z5B4 369 aa27.02■■□□□ 1.92
SGMS1-210ENST00000619438 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
SGMS1-210ENST00000619438 UBN2Q6ZU65 1347 aa27.02■■□□□ 1.92
SGMS1-210ENST00000619438 VAMP4O75379 141 aa27.01■■□□□ 1.91
SGMS1-210ENST00000619438 ERICH6Q7L0X2 663 aa27.01■■□□□ 1.91
SGMS1-210ENST00000619438 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
SGMS1-210ENST00000619438 ERFEQ4G0M1 354 aa27■■□□□ 1.91
SGMS1-210ENST00000619438 ARHGAP45Q92619 1136 aa27■■□□□ 1.91
SGMS1-210ENST00000619438 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
SGMS1-210ENST00000619438 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
SGMS1-210ENST00000619438 MASTLQ96GX5 879 aa26.99■■□□□ 1.91
SGMS1-210ENST00000619438 DDX58O95786 925 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
SGMS1-210ENST00000619438 SRGNP10124 158 aa26.98■■□□□ 1.91
SGMS1-210ENST00000619438 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
SGMS1-210ENST00000619438 SLC4A2P04920 1241 aa26.98■■□□□ 1.91
SGMS1-210ENST00000619438 CNKSR1Q969H4 720 aa26.98■■□□□ 1.91
SGMS1-210ENST00000619438 C8orf34Q49A92 452 aa26.97■■□□□ 1.91
SGMS1-210ENST00000619438 NLRP10Q86W26 655 aa26.97■■□□□ 1.91
SGMS1-210ENST00000619438 NTSR2O95665 410 aa26.96■■□□□ 1.91
SGMS1-210ENST00000619438 STYK1Q6J9G0 422 aa26.96■■□□□ 1.91
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
SGMS1-210ENST00000619438 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
SGMS1-210ENST00000619438 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa26.95■■□□□ 1.91
SGMS1-210ENST00000619438 NPR1P16066 1061 aa26.95■■□□□ 1.9
SGMS1-210ENST00000619438 RGS3P49796 1198 aa26.95■■□□□ 1.9
SGMS1-210ENST00000619438 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
SGMS1-210ENST00000619438 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
SGMS1-210ENST00000619438 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
SGMS1-210ENST00000619438 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
SGMS1-210ENST00000619438 CACNA1SQ13698 1873 aa26.93■■□□□ 1.9
SGMS1-210ENST00000619438 NLRP3Q96P20 1036 aa26.92■■□□□ 1.9
SGMS1-210ENST00000619438 C21orf2O43822 256 aa26.92■■□□□ 1.9
SGMS1-210ENST00000619438 ITPRIPQ8IWB1 547 aa26.92■■□□□ 1.9
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM57Q8N5G2 664 aa26.92■■□□□ 1.9
SGMS1-210ENST00000619438 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
SGMS1-210ENST00000619438 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa26.92■■□□□ 1.9
SGMS1-210ENST00000619438 ABCC12Q96J65 1359 aa26.91■■□□□ 1.9
SGMS1-210ENST00000619438 ALDH1B1P30837 517 aa26.91■■□□□ 1.9
SGMS1-210ENST00000619438 MYD88Q99836 296 aa26.91■■□□□ 1.9
SGMS1-210ENST00000619438 ISCA1Q9BUE6 129 aa26.91■■□□□ 1.9
SGMS1-210ENST00000619438 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
SGMS1-210ENST00000619438 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
SGMS1-210ENST00000619438 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
SGMS1-210ENST00000619438 SH3TC1Q8TE82 1336 aa26.9■■□□□ 1.9
SGMS1-210ENST00000619438 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.89■■□□□ 1.9
SGMS1-210ENST00000619438 KSR2Q6VAB6 950 aa26.89■■□□□ 1.9
SGMS1-210ENST00000619438 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.89■■□□□ 1.9
SGMS1-210ENST00000619438 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.89■■□□□ 1.9
SGMS1-210ENST00000619438 SLC10A5Q5PT55 438 aa26.89■■□□□ 1.89
SGMS1-210ENST00000619438 G2E3Q7L622 706 aa26.89■■□□□ 1.89
SGMS1-210ENST00000619438 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
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