RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 NCOA7Q8NI08 942 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 ORAI2Q96SN7 254 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 IARSP41252 1262 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 DDB1Q16531 1140 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 NECAB1Q8N987 351 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 DEF6Q9H4E7 631 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 ANO10Q9NW15 660 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 PTPRTO14522 1441 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 NBPF6Q5VWK0 638 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 NBPF4Q96M43 638 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 RFC4P35249 363 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 CATIPQ7Z7H3 387 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC112Q8NEF3 446 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 ANAPC15P60006 121 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 MFSD6Q6ZSS7 791 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 LRRC2Q9BYS8 371 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 ZSCAN30Q86W11 494 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 FSIP1Q8NA03 581 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 SYCP1Q15431 976 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 SBNO1A3KN83 1393 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 TOM1O60784 492 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 LDHCP07864 332 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 KLHL10Q6JEL2 608 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 MCM5P33992 734 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 SLF2Q8IX21 1173 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 CHL1O00533 1208 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 NLRP5P59047 1200 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 SIRT1Q96EB6 747 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 TSPY2A6NKD2 308 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 MAP7D2Q96T17 732 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 MBD5Q9P267 1494 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC96Q2M329 555 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 USP25Q9UHP3 1055 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 TTC41PQ6P2S7 1318 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 CTAGE5O15320 804 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 BAG3O95817 575 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 SEC24BO95487 1268 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 EIF5P55010 431 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 RBM10P98175 930 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 KLHL40Q2TBA0 621 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 SETDB2Q96T68 719 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 CNNM3Q8NE01 707 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 PDE4BQ07343 736 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 NLRP3Q96P20 1036 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP24.02■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF790Q6PG37 636 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 SNX21Q969T3 373 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 PDCL3Q9H2J4 239 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
PTPRJ-208ENST00000615445 CDR1P51861 262 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 UBE2HP62256 183 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 C8orf37Q96NL8 207 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC26A6Q9BXS9 759 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 LGR6Q9HBX8 967 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 PAG1Q9NWQ8 432 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 CYP7A1P22680 504 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 BIN1O00499 593 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 PANK2Q9BZ23 570 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 PLEKHG3A1L390 1219 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 KIF5BP33176 963 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 TFCP2Q12800 502 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 LTKP29376 864 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.9 ms