RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP30.69■■■□□ 2.5
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF521Q96K83 1311 aa30.69■■■□□ 2.5
CAPNS1-214ENST00000592483 FZD9O00144 591 aa30.68■■■□□ 2.5
CAPNS1-214ENST00000592483 GPC2Q8N158 579 aa30.68■■■□□ 2.5
CAPNS1-214ENST00000592483 IL16Q14005 1332 aa30.68■■■□□ 2.5
CAPNS1-214ENST00000592483 MCM10Q7L590 875 aa30.67■■■□□ 2.5
CAPNS1-214ENST00000592483 RTKN2Q8IZC4 609 aa30.67■■■□□ 2.5
CAPNS1-214ENST00000592483 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
CAPNS1-214ENST00000592483 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
CAPNS1-214ENST00000592483 CAMTA2O94983 1202 aa30.65■■■□□ 2.5
CAPNS1-214ENST00000592483 NPR1P16066 1061 aa30.65■■■□□ 2.5
CAPNS1-214ENST00000592483 TEFQ10587 303 aa30.65■■■□□ 2.5
CAPNS1-214ENST00000592483 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa30.64■■■□□ 2.5
CAPNS1-214ENST00000592483 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
CAPNS1-214ENST00000592483 CFAP44Q96MT7 982 aa30.64■■■□□ 2.5
CAPNS1-214ENST00000592483 DCTN1Q14203 1278 aa30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-214ENST00000592483 CYP4F22Q6NT55 531 aa30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-214ENST00000592483 BABAM1Q9NWV8 329 aa30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-214ENST00000592483 MAP2K2P36507 400 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-214ENST00000592483 IARSP41252 1262 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-214ENST00000592483 GRM1Q13255 1194 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-214ENST00000592483 MCOLN1Q9GZU1 580 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-214ENST00000592483 HEG1Q9ULI3 1381 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-214ENST00000592483 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-214ENST00000592483 TSKSQ9UJT2 592 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-214ENST00000592483 CA12O43570 354 aa30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-214ENST00000592483 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-214ENST00000592483 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-214ENST00000592483 IFT57Q9NWB7 429 aa30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-214ENST00000592483 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-214ENST00000592483 GOLGA2Q08379 1002 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-214ENST00000592483 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF790Q6PG37 636 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-214ENST00000592483 OLFM4Q6UX06 510 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-214ENST00000592483 SYNE4Q8N205 404 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-214ENST00000592483 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-214ENST00000592483 A1BGP04217 495 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-214ENST00000592483 GNAI1P63096 354 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-214ENST00000592483 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP30.58■■■□□ 2.495e-6■■■■□ 22.9
CAPNS1-214ENST00000592483 CST9Q5W186 159 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-214ENST00000592483 JDP2Q8WYK2 163 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-214ENST00000592483 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-214ENST00000592483 TLL2Q9Y6L7 1015 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-214ENST00000592483 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
CAPNS1-214ENST00000592483 CLEC4GQ6UXB4 293 aa30.56■■■□□ 2.48
CAPNS1-214ENST00000592483 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
CAPNS1-214ENST00000592483 E9PSI1 815 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF853P0CG23 659 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-214ENST00000592483 LTBP1Q14766 1721 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-214ENST00000592483 AOC2O75106 756 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-214ENST00000592483 ALDH1B1P30837 517 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-214ENST00000592483 EIF6P56537 245 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-214ENST00000592483 PSMD1Q99460 953 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-214ENST00000592483 MYH16Q9H6N6 1097 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-214ENST00000592483 GJA3Q9Y6H8 435 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-214ENST00000592483 TRPM7Q96QT4 1865 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-214ENST00000592483 BCORQ6W2J9 1755 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-214ENST00000592483 CHL1O00533 1208 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-214ENST00000592483 TPTE2Q6XPS3 522 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-214ENST00000592483 FMNL2Q96PY5 1086 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-214ENST00000592483 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-214ENST00000592483 BTBD11A6QL63 1104 aa30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-214ENST00000592483 TRAF5O00463 557 aa30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-214ENST00000592483 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-214ENST00000592483 EPS15P42566 896 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF652Q9Y2D9 606 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-214ENST00000592483 KDM3BQ7LBC6 1761 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-214ENST00000592483 SCNN1DP51172 638 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-214ENST00000592483 SLFN5Q08AF3 891 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-214ENST00000592483 DGKZQ13574 1117 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-214ENST00000592483 TSPYL4Q9UJ04 414 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-214ENST00000592483 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-214ENST00000592483 SAPCD2Q86UD0 394 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-214ENST00000592483 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-214ENST00000592483 SNED1Q8TER0 1413 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-214ENST00000592483 HHIPL1Q96JK4 782 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-214ENST00000592483 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-214ENST00000592483 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
CAPNS1-214ENST00000592483 MBIPQ9NS73 344 aa30.44■■■□□ 2.46
CAPNS1-214ENST00000592483 RGL2O15211 777 aa30.43■■■□□ 2.46
CAPNS1-214ENST00000592483 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP30.43■■■□□ 2.46
CAPNS1-214ENST00000592483 FANCIQ9NVI1 1328 aa30.43■■■□□ 2.46
CAPNS1-214ENST00000592483 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
CAPNS1-214ENST00000592483 COL4A5P29400 1685 aa30.42■■■□□ 2.46
CAPNS1-214ENST00000592483 CDCA7LQ96GN5 454 aa30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-214ENST00000592483 USP16Q9Y5T5 823 aa30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-214ENST00000592483 CELF2O95319 508 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-214ENST00000592483 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-214ENST00000592483 GRIPAP1Q4V328 841 aa30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-214ENST00000592483 DUSP27Q5VZP5 1158 aa30.39■■■□□ 2.46
CAPNS1-214ENST00000592483 LARGE2Q8N3Y3 721 aa30.39■■■□□ 2.46
CAPNS1-214ENST00000592483 MIS18AQ9NYP9 233 aa30.39■■■□□ 2.46
CAPNS1-214ENST00000592483 CRY2Q49AN0 593 aa30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-214ENST00000592483 CIAPIN1Q6FI81 312 aa30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-214ENST00000592483 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM177BA6PVY3 158 aa30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-214ENST00000592483 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-214ENST00000592483 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-214ENST00000592483 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
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