RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577500.5

LLGL2-207, Transcript of LLGL2, scribble cell polarity complex component, humanhuman

TSL 2

Gene LLGL2, Length 2,971 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2-207ENST00000577500 KSR2Q6VAB6 950 aa16.03■□□□□ 0.16
LLGL2-207ENST00000577500 GPATCH3Q96I76 525 aa16.03■□□□□ 0.16
LLGL2-207ENST00000577500 RNMTO43148 476 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
LLGL2-207ENST00000577500 UVSSAQ2YD98 709 aa16.02■□□□□ 0.16
LLGL2-207ENST00000577500 AKAP4Q5JQC9 854 aa16.02■□□□□ 0.16
LLGL2-207ENST00000577500 C1orf141Q5JVX7 400 aa16.02■□□□□ 0.16
LLGL2-207ENST00000577500 TTC6Q86TZ1 520 aa16.02■□□□□ 0.16
LLGL2-207ENST00000577500 EVI5LQ96CN4 794 aa16.02■□□□□ 0.16
LLGL2-207ENST00000577500 CACNA1FO60840 1977 aa16.02■□□□□ 0.16
LLGL2-207ENST00000577500 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
LLGL2-207ENST00000577500 MYL6BP14649 208 aa16.02■□□□□ 0.16
LLGL2-207ENST00000577500 SLC39A6Q13433 755 aa16.02■□□□□ 0.16
LLGL2-207ENST00000577500 FSD1Q9BTV5 496 aa16.02■□□□□ 0.16
LLGL2-207ENST00000577500 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
LLGL2-207ENST00000577500 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 CKAP2LQ8IYA6 745 aa16.02■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 FUCA2Q9BTY2 467 aa16.02■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 SLC27A2O14975 620 aa16.01■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 LIG1P18858 919 aa16.01■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 MTX1Q13505 466 aa16.01■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 PIBF1Q8WXW3 757 aa16.01■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 GRM8O00222 908 aa16.01■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 HOXB7P09629 217 aa16.01■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 PXDNQ92626 1479 aa16■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 DYNC1I1O14576 645 aa16■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 MAP4K1Q92918 833 aa15.99■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 PYCARDQ9ULZ3 195 aa15.99■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 ALDH1L1O75891 902 aa15.99■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 EPHA10Q5JZY3 1008 aa15.98■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa15.98■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 RIC3Q7Z5B4 369 aa15.98■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 LUZP1Q86V48 1076 aa15.98■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 ERC1Q8IUD2 1116 aa15.98■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 TM6SF1Q9BZW5 370 aa15.98■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 PPFIA3O75145 1194 aa15.98■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 IGKV5-2P06315 115 aa15.98■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 DDX11Q96FC9 970 aa15.98■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 ORAI2Q96SN7 254 aa15.98■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 KCNF1Q9H3M0 494 aa15.98■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 AXIN2Q9Y2T1 843 aa15.98■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 FOSBP53539 338 aa15.97■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 LINS1Q8NG48 757 aa15.97■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 ANKARQ7Z5J8 1434 aa15.97■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 GCP02774 474 aa15.97■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 KRT85P78386 507 aa15.97■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa15.97■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 LRRC2Q9BYS8 371 aa15.97■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 DACT1Q9NYF0 836 aa15.97■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 JAK2O60674 1132 aa15.96■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 ANKRD24Q8TF21 1146 aa15.96■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 CCDC192P0DO97 292 aa15.96■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 KCNB2Q92953 911 aa15.96■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 ARHGAP23Q9P227 1491 aa15.96■□□□□ 0.15
LLGL2-207ENST00000577500 RGPD2P0DJD1 1756 aa15.96■□□□□ 0.14
LLGL2-207ENST00000577500 MYRIPQ8NFW9 859 aa15.96■□□□□ 0.14
LLGL2-207ENST00000577500 SLIT1O75093 1534 aa15.95■□□□□ 0.14
LLGL2-207ENST00000577500 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
LLGL2-207ENST00000577500 NUP62CLQ9H1M0 184 aa15.95■□□□□ 0.14
LLGL2-207ENST00000577500 LTN1O94822 1766 aa15.95■□□□□ 0.14
LLGL2-207ENST00000577500 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
LLGL2-207ENST00000577500 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa15.95■□□□□ 0.14
LLGL2-207ENST00000577500 PDIA6Q15084 440 aa15.95■□□□□ 0.14
LLGL2-207ENST00000577500 SLFNL1Q499Z3 407 aa15.95■□□□□ 0.14
LLGL2-207ENST00000577500 MYD88Q99836 296 aa15.95■□□□□ 0.14
LLGL2-207ENST00000577500 KIF13AQ9H1H9 1805 aa15.95■□□□□ 0.14
LLGL2-207ENST00000577500 RPS6KB1P23443 525 aa15.94■□□□□ 0.14
LLGL2-207ENST00000577500 PSMA5P28066 241 aa15.94■□□□□ 0.14
LLGL2-207ENST00000577500 SPATA32Q96LK8 384 aa15.94■□□□□ 0.14
LLGL2-207ENST00000577500 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
LLGL2-207ENST00000577500 MRVI1Q9Y6F6 885 aa15.94■□□□□ 0.14
LLGL2-207ENST00000577500 PTGS1P23219 599 aa15.94■□□□□ 0.14
LLGL2-207ENST00000577500 TYRO3Q06418 890 aa15.94■□□□□ 0.14
LLGL2-207ENST00000577500 MAP3K11Q16584 847 aa15.94■□□□□ 0.14
LLGL2-207ENST00000577500 AMOTQ4VCS5 1084 aa15.94■□□□□ 0.14
LLGL2-207ENST00000577500 PRDM10Q9NQV6 1147 aa15.94■□□□□ 0.14
LLGL2-207ENST00000577500 COPS6Q7L5N1 327 aa15.93■□□□□ 0.14
LLGL2-207ENST00000577500 KCNH5Q8NCM2 988 aa15.93■□□□□ 0.14
LLGL2-207ENST00000577500 XAGE3Q8WTP9 111 aa15.93■□□□□ 0.14
LLGL2-207ENST00000577500 CHMP4AQ9BY43 222 aa15.93■□□□□ 0.14
LLGL2-207ENST00000577500 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LLGL2-207ENST00000577500 ANO6Q4KMQ2 910 aa15.93■□□□□ 0.14
LLGL2-207ENST00000577500 TNMDQ9H2S6 317 aa15.93■□□□□ 0.14
LLGL2-207ENST00000577500 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
LLGL2-207ENST00000577500 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LLGL2-207ENST00000577500 DDX58O95786 925 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LLGL2-207ENST00000577500 RNF20Q5VTR2 975 aa15.93■□□□□ 0.14
LLGL2-207ENST00000577500 ZNF710Q8N1W2 664 aa15.93■□□□□ 0.14
LLGL2-207ENST00000577500 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LLGL2-207ENST00000577500 NR1I2O75469 434 aa15.92■□□□□ 0.14
LLGL2-207ENST00000577500 ARHGEF25Q86VW2 580 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms