RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568561.5

NME3-211, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NME3, Length 813 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-211ENST00000568561 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.48■□□□□ 0.87
NME3-211ENST00000568561 HACL1Q9UJ83 578 aa20.48■□□□□ 0.87
NME3-211ENST00000568561 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa20.48■□□□□ 0.87
NME3-211ENST00000568561 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
NME3-211ENST00000568561 LTBP1Q14766 1721 aa20.47■□□□□ 0.87
NME3-211ENST00000568561 LAMB2P55268 1798 aa20.47■□□□□ 0.87
NME3-211ENST00000568561 ANXA1P04083 346 aa20.47■□□□□ 0.87
NME3-211ENST00000568561 CLEC11AQ9Y240 323 aa20.47■□□□□ 0.87
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NME3-211ENST00000568561 NTSR2O95665 410 aa20.46■□□□□ 0.87
NME3-211ENST00000568561 EPHX2P34913 555 aa20.46■□□□□ 0.87
NME3-211ENST00000568561 PROSER3Q2NL68 480 aa20.46■□□□□ 0.87
NME3-211ENST00000568561 ZNF34Q8IZ26 560 aa20.46■□□□□ 0.87
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NME3-211ENST00000568561 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
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NME3-211ENST00000568561 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
NME3-211ENST00000568561 RIPK4P57078 832 aa20.44■□□□□ 0.86
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NME3-211ENST00000568561 JDP2Q8WYK2 163 aa20.44■□□□□ 0.86
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NME3-211ENST00000568561 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
NME3-211ENST00000568561 PDIA6Q15084 440 aa20.43■□□□□ 0.86
NME3-211ENST00000568561 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.43■□□□□ 0.86
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NME3-211ENST00000568561 NECTIN2Q92692 538 aa20.43■□□□□ 0.86
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NME3-211ENST00000568561 TAF1P21675 1872 aa20.41■□□□□ 0.86
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NME3-211ENST00000568561 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa20.4■□□□□ 0.86
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NME3-211ENST00000568561 KRT24Q2M2I5 525 aa20.39■□□□□ 0.85
NME3-211ENST00000568561 PARP10Q53GL7 1025 aa20.39■□□□□ 0.85
NME3-211ENST00000568561 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
NME3-211ENST00000568561 ZNF428Q96B54 188 aa20.39■□□□□ 0.85
NME3-211ENST00000568561 ABCC4O15439 1325 aa20.38■□□□□ 0.85
NME3-211ENST00000568561 FOXN1O15353 648 aa20.38■□□□□ 0.85
NME3-211ENST00000568561 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
NME3-211ENST00000568561 NEUROD2Q15784 382 aa20.38■□□□□ 0.85
NME3-211ENST00000568561 CNTROBQ8N137 903 aa20.38■□□□□ 0.85
NME3-211ENST00000568561 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
NME3-211ENST00000568561 EPS15P42566 896 aa20.37■□□□□ 0.85
NME3-211ENST00000568561 SCNN1DP51172 638 aa20.37■□□□□ 0.85
NME3-211ENST00000568561 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.37■□□□□ 0.85
NME3-211ENST00000568561 NLRP3Q96P20 1036 aa20.37■□□□□ 0.85
NME3-211ENST00000568561 PPIP5K2O43314 1243 aa20.36■□□□□ 0.85
NME3-211ENST00000568561 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
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NME3-211ENST00000568561 COPS6Q7L5N1 327 aa20.36■□□□□ 0.85
NME3-211ENST00000568561 NIM1KQ8IY84 436 aa20.36■□□□□ 0.85
NME3-211ENST00000568561 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
NME3-211ENST00000568561 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.35■□□□□ 0.85
NME3-211ENST00000568561 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa20.35■□□□□ 0.85
NME3-211ENST00000568561 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
NME3-211ENST00000568561 TRPM7Q96QT4 1865 aa20.35■□□□□ 0.85
NME3-211ENST00000568561 GRIPAP1Q4V328 841 aa20.34■□□□□ 0.85
NME3-211ENST00000568561 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.34■□□□□ 0.85
NME3-211ENST00000568561 NLRP10Q86W26 655 aa20.34■□□□□ 0.85
NME3-211ENST00000568561 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
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NME3-211ENST00000568561 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
NME3-211ENST00000568561 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
NME3-211ENST00000568561 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
NME3-211ENST00000568561 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
NME3-211ENST00000568561 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.32■□□□□ 0.84
NME3-211ENST00000568561 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
NME3-211ENST00000568561 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
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NME3-211ENST00000568561 RASSF10A6NK89 507 aa20.31■□□□□ 0.84
NME3-211ENST00000568561 TRAF5O00463 557 aa20.31■□□□□ 0.84
NME3-211ENST00000568561 DEFB115Q30KQ5 88 aa20.31■□□□□ 0.84
NME3-211ENST00000568561 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.31■□□□□ 0.84
NME3-211ENST00000568561 AIDAQ96BJ3 306 aa20.31■□□□□ 0.84
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NME3-211ENST00000568561 THSD7BQ9C0I4 1608 aa20.3■□□□□ 0.84
NME3-211ENST00000568561 SH3TC1Q8TE82 1336 aa20.29■□□□□ 0.84
NME3-211ENST00000568561 CHL1O00533 1208 aa20.29■□□□□ 0.84
NME3-211ENST00000568561 CXCL9Q07325 125 aa20.29■□□□□ 0.84
NME3-211ENST00000568561 WBP1LQ9NX94 342 aa20.29■□□□□ 0.84
NME3-211ENST00000568561 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
NME3-211ENST00000568561 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
NME3-211ENST00000568561 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
NME3-211ENST00000568561 GRM1Q13255 1194 aa20.28■□□□□ 0.84
NME3-211ENST00000568561 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.28■□□□□ 0.84
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