RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568388.5

SPNS1-210, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 759 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-210ENST00000568388 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.59■■□□□ 1.37
SPNS1-210ENST00000568388 UTYO14607 1347 aa23.59■■□□□ 1.37
SPNS1-210ENST00000568388 GNAI3P08754 354 aa23.58■■□□□ 1.37
SPNS1-210ENST00000568388 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SPNS1-210ENST00000568388 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SPNS1-210ENST00000568388 PARP10Q53GL7 1025 aa23.57■■□□□ 1.36
SPNS1-210ENST00000568388 GRM8O00222 908 aa23.56■■□□□ 1.36
SPNS1-210ENST00000568388 GYS1P13807 737 aa23.56■■□□□ 1.36
SPNS1-210ENST00000568388 NLRP10Q86W26 655 aa23.56■■□□□ 1.36
SPNS1-210ENST00000568388 MEIS3Q99687 375 aa23.56■■□□□ 1.36
SPNS1-210ENST00000568388 PTGER2P43116 358 aa23.55■■□□□ 1.36
SPNS1-210ENST00000568388 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SPNS1-210ENST00000568388 HDAC5Q9UQL6 1122 aa23.55■■□□□ 1.36
SPNS1-210ENST00000568388 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SPNS1-210ENST00000568388 COL24A1Q17RW2 1714 aa23.54■■□□□ 1.36
SPNS1-210ENST00000568388 H7C1W4 665 aa23.54■■□□□ 1.36
SPNS1-210ENST00000568388 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.54■■□□□ 1.36
SPNS1-210ENST00000568388 UBN2Q6ZU65 1347 aa23.54■■□□□ 1.36
SPNS1-210ENST00000568388 GPTP24298 496 aa23.53■■□□□ 1.36
SPNS1-210ENST00000568388 TBC1D9BQ66K14 1250 aa23.53■■□□□ 1.36
SPNS1-210ENST00000568388 MTFR1LQ9H019 292 aa23.53■■□□□ 1.36
SPNS1-210ENST00000568388 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SPNS1-210ENST00000568388 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SPNS1-210ENST00000568388 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SPNS1-210ENST00000568388 NLGN1Q8N2Q7 840 aa23.52■■□□□ 1.36
SPNS1-210ENST00000568388 CASP7P55210 303 aa23.51■■□□□ 1.35
SPNS1-210ENST00000568388 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa23.51■■□□□ 1.35
SPNS1-210ENST00000568388 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SPNS1-210ENST00000568388 SETDB2Q96T68 719 aa23.51■■□□□ 1.35
SPNS1-210ENST00000568388 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.51■■□□□ 1.35
SPNS1-210ENST00000568388 MSH5O43196 834 aa23.5■■□□□ 1.35
SPNS1-210ENST00000568388 GNAI2P04899 355 aa23.5■■□□□ 1.35
SPNS1-210ENST00000568388 TM4SF1P30408 202 aa23.5■■□□□ 1.35
SPNS1-210ENST00000568388 SUSD4Q5VX71 490 aa23.5■■□□□ 1.35
SPNS1-210ENST00000568388 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.5■■□□□ 1.35
SPNS1-210ENST00000568388 NFIXQ14938 502 aa23.49■■□□□ 1.35
SPNS1-210ENST00000568388 SLC16A10Q8TF71 515 aa23.49■■□□□ 1.35
SPNS1-210ENST00000568388 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SPNS1-210ENST00000568388 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SPNS1-210ENST00000568388 CDHR2Q9BYE9 1310 aa23.48■■□□□ 1.35
SPNS1-210ENST00000568388 NTSR2O95665 410 aa23.47■■□□□ 1.35
SPNS1-210ENST00000568388 BICDL1Q6ZP65 573 aa23.47■■□□□ 1.35
SPNS1-210ENST00000568388 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa23.47■■□□□ 1.35
SPNS1-210ENST00000568388 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.47■■□□□ 1.35
SPNS1-210ENST00000568388 CARMIL3Q8ND23 1372 aa23.47■■□□□ 1.35
SPNS1-210ENST00000568388 MYH3P11055 1940 aa23.47■■□□□ 1.35
SPNS1-210ENST00000568388 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SPNS1-210ENST00000568388 PLA2G12BQ9BX93 195 aa23.46■■□□□ 1.35
SPNS1-210ENST00000568388 NYXQ9GZU5 481 aa23.46■■□□□ 1.35
SPNS1-210ENST00000568388 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.46■■□□□ 1.35
SPNS1-210ENST00000568388 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SPNS1-210ENST00000568388 LAMB2P55268 1798 aa23.45■■□□□ 1.34
SPNS1-210ENST00000568388 SH3TC1Q8TE82 1336 aa23.45■■□□□ 1.34
SPNS1-210ENST00000568388 FAM89AQ96GI7 184 aa23.45■■□□□ 1.34
SPNS1-210ENST00000568388 KAZALD1Q96I82 304 aa23.45■■□□□ 1.34
SPNS1-210ENST00000568388 SUCLG2Q96I99 432 aa23.45■■□□□ 1.34
SPNS1-210ENST00000568388 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-210ENST00000568388 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-210ENST00000568388 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-210ENST00000568388 NRXN2Q9P2S2 1712 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-210ENST00000568388 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-210ENST00000568388 SLC10A5Q5PT55 438 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-210ENST00000568388 ANKRD44Q8N8A2 993 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-210ENST00000568388 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-210ENST00000568388 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SPNS1-210ENST00000568388 ATP8B2P98198 1209 aa23.42■■□□□ 1.34
SPNS1-210ENST00000568388 MTX1Q13505 466 aa23.42■■□□□ 1.34
SPNS1-210ENST00000568388 CEP85Q6P2H3 762 aa23.42■■□□□ 1.34
SPNS1-210ENST00000568388 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SPNS1-210ENST00000568388 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SPNS1-210ENST00000568388 SERPINB2P05120 415 aa23.41■■□□□ 1.34
SPNS1-210ENST00000568388 FOXO4P98177 505 aa23.41■■□□□ 1.34
SPNS1-210ENST00000568388 DDR1Q08345 913 aa23.41■■□□□ 1.34
SPNS1-210ENST00000568388 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SPNS1-210ENST00000568388 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SPNS1-210ENST00000568388 FAM177BA6PVY3 158 aa23.4■■□□□ 1.34
SPNS1-210ENST00000568388 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SPNS1-210ENST00000568388 SYNE4Q8N205 404 aa23.4■■□□□ 1.34
SPNS1-210ENST00000568388 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SPNS1-210ENST00000568388 PDE8AO60658 829 aa23.39■■□□□ 1.33
SPNS1-210ENST00000568388 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
SPNS1-210ENST00000568388 ERFEQ4G0M1 354 aa23.39■■□□□ 1.33
SPNS1-210ENST00000568388 EPHA10Q5JZY3 1008 aa23.39■■□□□ 1.33
SPNS1-210ENST00000568388 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.39■■□□□ 1.33
SPNS1-210ENST00000568388 RIC1Q4ADV7 1423 aa23.39■■□□□ 1.33
SPNS1-210ENST00000568388 CSF1RP07333 972 aa23.38■■□□□ 1.33
SPNS1-210ENST00000568388 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SPNS1-210ENST00000568388 NUTM1Q86Y26 1132 aa23.38■■□□□ 1.33
SPNS1-210ENST00000568388 SYT17Q9BSW7 474 aa23.38■■□□□ 1.33
SPNS1-210ENST00000568388 MMP10P09238 476 aa23.37■■□□□ 1.33
SPNS1-210ENST00000568388 PRR5LQ6MZQ0 368 aa23.37■■□□□ 1.33
SPNS1-210ENST00000568388 CNBD1Q8NA66 436 aa23.37■■□□□ 1.33
SPNS1-210ENST00000568388 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SPNS1-210ENST00000568388 PARP3Q9Y6F1 533 aa23.37■■□□□ 1.33
SPNS1-210ENST00000568388 HMMRO75330 724 aa23.36■■□□□ 1.33
SPNS1-210ENST00000568388 POLA2Q14181 598 aa23.36■■□□□ 1.33
SPNS1-210ENST00000568388 MSL1Q68DK7 614 aa23.36■■□□□ 1.33
SPNS1-210ENST00000568388 SSH3Q8TE77 659 aa23.36■■□□□ 1.33
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.36■■□□□ 1.33
SPNS1-210ENST00000568388 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
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