RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 NTSR2O95665 410 aa20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-205ENST00000558534 YY1P25490 414 aa20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-205ENST00000558534 SLFN5Q08AF3 891 aa20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-205ENST00000558534 SUSD4Q5VX71 490 aa20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-205ENST00000558534 KSR2Q6VAB6 950 aa20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-205ENST00000558534 NLRP10Q86W26 655 aa20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-205ENST00000558534 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-205ENST00000558534 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-205ENST00000558534 UTRNP46939 3433 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-205ENST00000558534 SRGNP10124 158 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-205ENST00000558534 NLRP3Q96P20 1036 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-205ENST00000558534 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-205ENST00000558534 SH3TC1Q8TE82 1336 aa20.18■□□□□ 0.82
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RABGGTA-205ENST00000558534 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-205ENST00000558534 ISCA1Q9BUE6 129 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-205ENST00000558534 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-205ENST00000558534 CACNA1SQ13698 1873 aa20.17■□□□□ 0.82
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RABGGTA-205ENST00000558534 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-205ENST00000558534 NUTM1Q86Y26 1132 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-205ENST00000558534 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-205ENST00000558534 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-205ENST00000558534 CCDC24Q8N4L8 307 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-205ENST00000558534 WWC3Q9ULE0 1092 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-205ENST00000558534 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-205ENST00000558534 LAMB2P55268 1798 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-205ENST00000558534 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-205ENST00000558534 CRY2Q49AN0 593 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-205ENST00000558534 GRIPAP1Q4V328 841 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-205ENST00000558534 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-205ENST00000558534 MYD88Q99836 296 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-205ENST00000558534 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-205ENST00000558534 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-205ENST00000558534 ABCC12Q96J65 1359 aa20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-205ENST00000558534 PI4KAP2A4QPH2 592 aa20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-205ENST00000558534 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-205ENST00000558534 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-205ENST00000558534 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.12■□□□□ 0.81
RABGGTA-205ENST00000558534 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
RABGGTA-205ENST00000558534 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.11■□□□□ 0.81
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RABGGTA-205ENST00000558534 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-205ENST00000558534 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa20.11■□□□□ 0.81
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RABGGTA-205ENST00000558534 SLX4Q8IY92 1834 aa20.1■□□□□ 0.81
RABGGTA-205ENST00000558534 ADCY9O60503 1353 aa20.09■□□□□ 0.81
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RABGGTA-205ENST00000558534 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
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RABGGTA-205ENST00000558534 CCDC93Q567U6 631 aa20.08■□□□□ 0.81
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RABGGTA-205ENST00000558534 RTKN2Q8IZC4 609 aa20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-205ENST00000558534 LINS1Q8NG48 757 aa20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-205ENST00000558534 SBF1O95248 1867 aa20.07■□□□□ 0.8
RABGGTA-205ENST00000558534 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
RABGGTA-205ENST00000558534 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
RABGGTA-205ENST00000558534 C21orf2O43822 256 aa20.07■□□□□ 0.8
RABGGTA-205ENST00000558534 G2E3Q7L622 706 aa20.07■□□□□ 0.8
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM89AQ96GI7 184 aa20.07■□□□□ 0.8
RABGGTA-205ENST00000558534 CDCA7LQ96GN5 454 aa20.07■□□□□ 0.8
RABGGTA-205ENST00000558534 CDHR2Q9BYE9 1310 aa20.06■□□□□ 0.8
RABGGTA-205ENST00000558534 LTBP3Q9NS15 1303 aa20.06■□□□□ 0.8
RABGGTA-205ENST00000558534 LMNB1P20700 586 aa20.06■□□□□ 0.8
RABGGTA-205ENST00000558534 NEURL1BA8MQ27 555 aa20.05■□□□□ 0.8
RABGGTA-205ENST00000558534 BBOX1O75936 387 aa20.05■□□□□ 0.8
RABGGTA-205ENST00000558534 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
RABGGTA-205ENST00000558534 TAOK3Q9H2K8 898 aa20.05■□□□□ 0.8
RABGGTA-205ENST00000558534 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
RABGGTA-205ENST00000558534 PDE8AO60658 829 aa20.04■□□□□ 0.8
RABGGTA-205ENST00000558534 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
RABGGTA-205ENST00000558534 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.04■□□□□ 0.8
RABGGTA-205ENST00000558534 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa20.04■□□□□ 0.8
RABGGTA-205ENST00000558534 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
RABGGTA-205ENST00000558534 CCDC152Q4G0S7 254 aa20.03■□□□□ 0.8
RABGGTA-205ENST00000558534 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
RABGGTA-205ENST00000558534 ALDH1L1O75891 902 aa20.02■□□□□ 0.8
RABGGTA-205ENST00000558534 IGKV5-2P06315 115 aa20.02■□□□□ 0.8
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RABGGTA-205ENST00000558534 RNF181Q9P0P0 153 aa20.02■□□□□ 0.8
RABGGTA-205ENST00000558534 KIF16BQ96L93 1317 aa20.02■□□□□ 0.79
RABGGTA-205ENST00000558534 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
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RABGGTA-205ENST00000558534 C9orf131Q5VYM1 1079 aa20.01■□□□□ 0.79
RABGGTA-205ENST00000558534 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
RABGGTA-205ENST00000558534 ABCC4O15439 1325 aa20.01■□□□□ 0.79
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RABGGTA-205ENST00000558534 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
RABGGTA-205ENST00000558534 C7orf43Q8WVR3 580 aa20■□□□□ 0.79
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