RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557444.5

AFG3L1P-217, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

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Gene AFG3L1P, Length 2,447 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-217ENST00000557444 SMC3Q9UQE7 1217 aa24.02■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 STX6O43752 255 aa24.02■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 TATP17735 454 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 A0A0D9SFI3 127 aa24.01■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa24.01■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZSCAN30Q86W11 494 aa24.01■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 NEXNQ0ZGT2 675 aa24.01■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 PDLIM2Q96JY6 352 aa24.01■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 KCNJ4P48050 445 aa24■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 ST3GAL1Q11201 340 aa24■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa24■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 TAF6LQ9Y6J9 622 aa24■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 SCN11AQ9UI33 1791 aa24■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 CREB3L3Q68CJ9 461 aa24■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 NECAB1Q8N987 351 aa24■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 GJB2P29033 226 aa23.99■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 FSD1Q9BTV5 496 aa23.99■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa23.99■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 CYP27B1O15528 508 aa23.99■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 VPS53Q5VIR6 699 aa23.99■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 TCEANC2Q96MN5 208 aa23.99■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa23.99■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 ALS2Q96Q42 1657 aa23.98■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 ME3Q16798 604 aa23.98■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.98■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 KCNB2Q92953 911 aa23.98■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23.98■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa23.97■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 F13A1P00488 732 aa23.97■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.97■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 MAP4K1Q92918 833 aa23.97■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 FIBPO43427 364 aa23.96■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 CHGBP05060 677 aa23.96■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 TSPY26PQ9H489 355 aa23.96■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 KIF1AQ12756 1690 aa23.96■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLC27A2O14975 620 aa23.95■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa23.95■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 TTC5Q8N0Z6 440 aa23.95■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 TM6SF1Q9BZW5 370 aa23.95■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 TPCN1Q9ULQ1 816 aa23.95■■□□□ 1.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 MSNP26038 577 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
AFG3L1P-217ENST00000557444 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
AFG3L1P-217ENST00000557444 ATF3P18847 181 aa23.94■■□□□ 1.42
AFG3L1P-217ENST00000557444 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
AFG3L1P-217ENST00000557444 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMEM87AQ8NBN3 555 aa23.94■■□□□ 1.42
AFG3L1P-217ENST00000557444 MTMR6Q9Y217 621 aa23.94■■□□□ 1.42
AFG3L1P-217ENST00000557444 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.94■■□□□ 1.42
AFG3L1P-217ENST00000557444 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
AFG3L1P-217ENST00000557444 TFCP2Q12800 502 aa23.93■■□□□ 1.42
AFG3L1P-217ENST00000557444 MST1RQ04912 1400 aa23.93■■□□□ 1.42
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AFG3L1P-217ENST00000557444 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
AFG3L1P-217ENST00000557444 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMEM94Q12767 1356 aa23.92■■□□□ 1.42
AFG3L1P-217ENST00000557444 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
AFG3L1P-217ENST00000557444 HIP1O00291 1037 aa23.92■■□□□ 1.42
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
AFG3L1P-217ENST00000557444 DCAF5Q96JK2 942 aa23.91■■□□□ 1.42
AFG3L1P-217ENST00000557444 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
AFG3L1P-217ENST00000557444 MED23Q9ULK4 1368 aa23.9■■□□□ 1.42
AFG3L1P-217ENST00000557444 COL18A1P39060 1754 aa23.9■■□□□ 1.42
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
AFG3L1P-217ENST00000557444 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
AFG3L1P-217ENST00000557444 FMNL2Q96PY5 1086 aa23.9■■□□□ 1.42
AFG3L1P-217ENST00000557444 COPRSQ9NQ92 184 aa23.9■■□□□ 1.42
AFG3L1P-217ENST00000557444 SNRKQ9NRH2 765 aa23.9■■□□□ 1.42
AFG3L1P-217ENST00000557444 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.9■■□□□ 1.42
AFG3L1P-217ENST00000557444 A0A087WZG4 1122 aa23.89■■□□□ 1.42
AFG3L1P-217ENST00000557444 TNNI3KQ59H18 835 aa23.89■■□□□ 1.42
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AFG3L1P-217ENST00000557444 COL15A1P39059 1388 aa23.89■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 CABP4P57796 275 aa23.89■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 UBE2HP62256 183 aa23.88■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 HS1BP3Q53T59 392 aa23.88■■□□□ 1.41
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AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC183Q5T5S1 534 aa23.88■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa23.88■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 DBNDD2Q9BQY9 259 aa23.88■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 MRC1P22897 1456 aa23.87■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 PHF14O94880 888 aa23.87■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM173BQ6P4H8 233 aa23.87■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa23.87■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 FERMT3Q86UX7 667 aa23.87■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 TAF5LO75529 589 aa23.86■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 STK3Q13188 491 aa23.86■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 MPNDQ8N594 471 aa23.86■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 PSMA5P28066 241 aa23.85■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 CDC37L1Q7L3B6 337 aa23.85■■□□□ 1.41
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