RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555574.1

TMX1-202, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene TMX1, Length 943 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX1-202ENST00000555574 ANXA1P04083 346 aa22.32■■□□□ 1.16
TMX1-202ENST00000555574 SLC51AQ86UW1 340 aa22.32■■□□□ 1.16
TMX1-202ENST00000555574 LDHDQ86WU2 507 aa22.32■■□□□ 1.16
TMX1-202ENST00000555574 PSMD1Q99460 953 aa22.32■■□□□ 1.16
TMX1-202ENST00000555574 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.32■■□□□ 1.16
TMX1-202ENST00000555574 LAMB2P55268 1798 aa22.31■■□□□ 1.16
TMX1-202ENST00000555574 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TMX1-202ENST00000555574 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.31■■□□□ 1.16
TMX1-202ENST00000555574 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TMX1-202ENST00000555574 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.31■■□□□ 1.16
TMX1-202ENST00000555574 CREBZFQ9NS37 354 aa22.31■■□□□ 1.16
TMX1-202ENST00000555574 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TMX1-202ENST00000555574 FZD9O00144 591 aa22.3■■□□□ 1.16
TMX1-202ENST00000555574 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.3■■□□□ 1.16
TMX1-202ENST00000555574 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.3■■□□□ 1.16
TMX1-202ENST00000555574 HACL1Q9UJ83 578 aa22.3■■□□□ 1.16
TMX1-202ENST00000555574 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.3■■□□□ 1.16
TMX1-202ENST00000555574 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
TMX1-202ENST00000555574 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
TMX1-202ENST00000555574 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
TMX1-202ENST00000555574 PARP10Q53GL7 1025 aa22.29■■□□□ 1.16
TMX1-202ENST00000555574 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
TMX1-202ENST00000555574 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.29■■□□□ 1.16
TMX1-202ENST00000555574 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.29■■□□□ 1.16
TMX1-202ENST00000555574 NECTIN2Q92692 538 aa22.29■■□□□ 1.16
TMX1-202ENST00000555574 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
TMX1-202ENST00000555574 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
TMX1-202ENST00000555574 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.28■■□□□ 1.16
TMX1-202ENST00000555574 PASKQ96RG2 1323 aa22.28■■□□□ 1.16
TMX1-202ENST00000555574 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
TMX1-202ENST00000555574 EPHX2P34913 555 aa22.27■■□□□ 1.16
TMX1-202ENST00000555574 NEUROD2Q15784 382 aa22.27■■□□□ 1.16
TMX1-202ENST00000555574 JDP2Q8WYK2 163 aa22.27■■□□□ 1.16
TMX1-202ENST00000555574 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
TMX1-202ENST00000555574 LTBP1Q14766 1721 aa22.26■■□□□ 1.15
TMX1-202ENST00000555574 GPC2Q8N158 579 aa22.26■■□□□ 1.15
TMX1-202ENST00000555574 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TMX1-202ENST00000555574 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TMX1-202ENST00000555574 KRT24Q2M2I5 525 aa22.25■■□□□ 1.15
TMX1-202ENST00000555574 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.25■■□□□ 1.15
TMX1-202ENST00000555574 NLRP3Q96P20 1036 aa22.25■■□□□ 1.15
TMX1-202ENST00000555574 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.24■■□□□ 1.15
TMX1-202ENST00000555574 COPS6Q7L5N1 327 aa22.24■■□□□ 1.15
TMX1-202ENST00000555574 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.24■■□□□ 1.15
TMX1-202ENST00000555574 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TMX1-202ENST00000555574 EIF6P56537 245 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TMX1-202ENST00000555574 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
TMX1-202ENST00000555574 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TMX1-202ENST00000555574 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.23■■□□□ 1.15
TMX1-202ENST00000555574 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TMX1-202ENST00000555574 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.23■■□□□ 1.15
TMX1-202ENST00000555574 CNTNAP1P78357 1384 aa22.23■■□□□ 1.15
TMX1-202ENST00000555574 CHL1O00533 1208 aa22.22■■□□□ 1.15
TMX1-202ENST00000555574 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.22■■□□□ 1.15
TMX1-202ENST00000555574 RUNDC1Q96C34 613 aa22.22■■□□□ 1.15
TMX1-202ENST00000555574 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.22■■□□□ 1.15
TMX1-202ENST00000555574 ABCC4O15439 1325 aa22.22■■□□□ 1.15
TMX1-202ENST00000555574 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.21■■□□□ 1.15
TMX1-202ENST00000555574 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TMX1-202ENST00000555574 NLRP10Q86W26 655 aa22.21■■□□□ 1.15
TMX1-202ENST00000555574 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
TMX1-202ENST00000555574 TAF1P21675 1872 aa22.21■■□□□ 1.15
TMX1-202ENST00000555574 TNS4Q8IZW8 715 aa22.2■■□□□ 1.14
TMX1-202ENST00000555574 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.2■■□□□ 1.14
TMX1-202ENST00000555574 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.2■■□□□ 1.14
TMX1-202ENST00000555574 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TMX1-202ENST00000555574 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.19■■□□□ 1.14
TMX1-202ENST00000555574 PPIP5K2O43314 1243 aa22.19■■□□□ 1.14
TMX1-202ENST00000555574 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
TMX1-202ENST00000555574 AOC3Q16853 763 aa22.19■■□□□ 1.14
TMX1-202ENST00000555574 NIM1KQ8IY84 436 aa22.19■■□□□ 1.14
TMX1-202ENST00000555574 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
TMX1-202ENST00000555574 SCNN1DP51172 638 aa22.18■■□□□ 1.14
TMX1-202ENST00000555574 TCIRG1Q13488 830 aa22.18■■□□□ 1.14
TMX1-202ENST00000555574 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.18■■□□□ 1.14
TMX1-202ENST00000555574 CNTROBQ8N137 903 aa22.18■■□□□ 1.14
TMX1-202ENST00000555574 ZNF428Q96B54 188 aa22.18■■□□□ 1.14
TMX1-202ENST00000555574 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
TMX1-202ENST00000555574 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TMX1-202ENST00000555574 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.18■■□□□ 1.14
TMX1-202ENST00000555574 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.17■■□□□ 1.14
TMX1-202ENST00000555574 EPS15P42566 896 aa22.16■■□□□ 1.14
TMX1-202ENST00000555574 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.16■■□□□ 1.14
TMX1-202ENST00000555574 HOXB7P09629 217 aa22.15■■□□□ 1.14
TMX1-202ENST00000555574 CAPN15O75808 1086 aa22.14■■□□□ 1.13
TMX1-202ENST00000555574 BBOX1O75936 387 aa22.14■■□□□ 1.13
TMX1-202ENST00000555574 VEGFBP49765 207 aa22.14■■□□□ 1.13
TMX1-202ENST00000555574 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
TMX1-202ENST00000555574 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.14■■□□□ 1.13
TMX1-202ENST00000555574 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
TMX1-202ENST00000555574 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.13■■□□□ 1.13
TMX1-202ENST00000555574 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TMX1-202ENST00000555574 SP8Q8IXZ3 490 aa22.13■■□□□ 1.13
TMX1-202ENST00000555574 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.13■■□□□ 1.13
TMX1-202ENST00000555574 VPS33BQ9H267 617 aa22.13■■□□□ 1.13
TMX1-202ENST00000555574 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.13■■□□□ 1.13
TMX1-202ENST00000555574 GRAPQ13588 217 aa22.12■■□□□ 1.13
TMX1-202ENST00000555574 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TMX1-202ENST00000555574 CFAP44Q96MT7 982 aa22.12■■□□□ 1.13
TMX1-202ENST00000555574 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106.6 ms