RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		18.51	■□□□□ 0.55
CS-231	ENST00000552222	JDP2	Q8WYK2	163 aa		18.51	■□□□□ 0.55
CS-231	ENST00000552222	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
CS-231	ENST00000552222	TEF	Q10587	303 aa		18.5	■□□□□ 0.55
CS-231	ENST00000552222	ABCC12	Q96J65	1359 aa		18.5	■□□□□ 0.55
CS-231	ENST00000552222	SHTN1	A0MZ66	631 aa		18.49	■□□□□ 0.55
CS-231	ENST00000552222	NBPF26	B4DH59	902 aa		18.49	■□□□□ 0.55
CS-231	ENST00000552222	MAP2K2	P36507	400 aa		18.49	■□□□□ 0.55
CS-231	ENST00000552222	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	18.49	■□□□□ 0.55
CS-231	ENST00000552222	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	18.49	■□□□□ 0.55
CS-231	ENST00000552222	NBPF15	Q8N660	670 aa		18.49	■□□□□ 0.55
CS-231	ENST00000552222	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		18.49	■□□□□ 0.55
CS-231	ENST00000552222	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
CS-231	ENST00000552222	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
CS-231	ENST00000552222	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		18.48	■□□□□ 0.55
CS-231	ENST00000552222	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
CS-231	ENST00000552222	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		18.47	■□□□□ 0.55
CS-231	ENST00000552222	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		18.47	■□□□□ 0.55
CS-231	ENST00000552222	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		18.47	■□□□□ 0.55
CS-231	ENST00000552222	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.55
CS-231	ENST00000552222	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.55
CS-231	ENST00000552222	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.55
CS-231	ENST00000552222	PSMD1	Q99460	953 aa		18.46	■□□□□ 0.55
CS-231	ENST00000552222	BTBD11	A6QL63	1104 aa		18.45	■□□□□ 0.54
CS-231	ENST00000552222	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		18.45	■□□□□ 0.54
CS-231	ENST00000552222	AOC3	Q16853	763 aa		18.45	■□□□□ 0.54
CS-231	ENST00000552222	NGEF	Q8N5V2	710 aa		18.45	■□□□□ 0.54
CS-231	ENST00000552222	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
CS-231	ENST00000552222	ALDH1B1	P30837	517 aa		18.44	■□□□□ 0.54
CS-231	ENST00000552222	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
CS-231	ENST00000552222	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		18.44	■□□□□ 0.54
CS-231	ENST00000552222	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		18.44	■□□□□ 0.54
CS-231	ENST00000552222	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
CS-231	ENST00000552222	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
CS-231	ENST00000552222	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
CS-231	ENST00000552222	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		18.43	■□□□□ 0.54
CS-231	ENST00000552222	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		18.43	■□□□□ 0.54
CS-231	ENST00000552222	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		18.43	■□□□□ 0.54
CS-231	ENST00000552222	CXCL9	Q07325	125 aa		18.42	■□□□□ 0.54
CS-231	ENST00000552222	PPIP5K2	O43314	1243 aa		18.41	■□□□□ 0.54
CS-231	ENST00000552222	CRY2	Q49AN0	593 aa		18.41	■□□□□ 0.54
CS-231	ENST00000552222	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
CS-231	ENST00000552222	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		18.41	■□□□□ 0.54
CS-231	ENST00000552222	GPT	P24298	496 aa		18.4	■□□□□ 0.54
CS-231	ENST00000552222	DCTN1	Q14203	1278 aa		18.4	■□□□□ 0.54
CS-231	ENST00000552222	USP48	Q86UV5	1035 aa		18.4	■□□□□ 0.54
CS-231	ENST00000552222	NIM1K	Q8IY84	436 aa		18.4	■□□□□ 0.54
CS-231	ENST00000552222	CA12	O43570	354 aa		18.39	■□□□□ 0.53
CS-231	ENST00000552222	MCM10	Q7L590	875 aa		18.39	■□□□□ 0.53
CS-231	ENST00000552222	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		18.39	■□□□□ 0.53
CS-231	ENST00000552222	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	18.38	■□□□□ 0.53
CS-231	ENST00000552222	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	18.38	■□□□□ 0.53
CS-231	ENST00000552222	RAD17	O75943	681 aa		18.38	■□□□□ 0.53
CS-231	ENST00000552222	HUNK	P57058	714 aa		18.38	■□□□□ 0.53
CS-231	ENST00000552222	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
CS-231	ENST00000552222	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		18.38	■□□□□ 0.53
CS-231	ENST00000552222	TRPA1	O75762	1119 aa		18.37	■□□□□ 0.53
CS-231	ENST00000552222	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	18.37	■□□□□ 0.53
CS-231	ENST00000552222	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		18.37	■□□□□ 0.53
CS-231	ENST00000552222	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		18.37	■□□□□ 0.53
CS-231	ENST00000552222	EGFR	P00533	1210 aa		18.36	■□□□□ 0.53
CS-231	ENST00000552222	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	18.36	■□□□□ 0.53
CS-231	ENST00000552222	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	18.36	■□□□□ 0.53
CS-231	ENST00000552222	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	18.36	■□□□□ 0.53
CS-231	ENST00000552222	SUSD4	Q5VX71	490 aa		18.36	■□□□□ 0.53
CS-231	ENST00000552222	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		18.36	■□□□□ 0.53
CS-231	ENST00000552222	RNF186	Q9NXI6	227 aa		18.36	■□□□□ 0.53
CS-231	ENST00000552222	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		18.36	■□□□□ 0.53
CS-231	ENST00000552222	ZNF428	Q96B54	188 aa		18.35	■□□□□ 0.53
CS-231	ENST00000552222	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		18.35	■□□□□ 0.53
CS-231	ENST00000552222	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	18.35	■□□□□ 0.53
CS-231	ENST00000552222	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
CS-231	ENST00000552222	NOG	Q13253	232 aa		18.34	■□□□□ 0.53
CS-231	ENST00000552222	RALBP1	Q15311	655 aa		18.34	■□□□□ 0.53
CS-231	ENST00000552222	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		18.34	■□□□□ 0.53
CS-231	ENST00000552222	YDJC	A8MPS7	323 aa		18.33	■□□□□ 0.52
CS-231	ENST00000552222	ADM5	C9JUS6	153 aa		18.33	■□□□□ 0.52
CS-231	ENST00000552222	PPP2R1A	P30153	589 aa		18.33	■□□□□ 0.52
CS-231	ENST00000552222	PRKAR2B	P31323	418 aa		18.33	■□□□□ 0.52
CS-231	ENST00000552222	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		18.33	■□□□□ 0.52
CS-231	ENST00000552222	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		18.33	■□□□□ 0.52
CS-231	ENST00000552222	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		18.33	■□□□□ 0.52
CS-231	ENST00000552222	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		18.33	■□□□□ 0.52
CS-231	ENST00000552222	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		18.32	■□□□□ 0.52
CS-231	ENST00000552222	RGMB	Q6NW40	437 aa		18.31	■□□□□ 0.52
CS-231	ENST00000552222	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	18.31	■□□□□ 0.52
CS-231	ENST00000552222	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	18.31	■□□□□ 0.52
CS-231	ENST00000552222	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	18.31	■□□□□ 0.52
CS-231	ENST00000552222	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	18.31	■□□□□ 0.52
CS-231	ENST00000552222	MYL6B	P14649	208 aa		18.3	■□□□□ 0.52
CS-231	ENST00000552222	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	18.3	■□□□□ 0.52
CS-231	ENST00000552222	MICALL2	Q8IY33	904 aa		18.3	■□□□□ 0.52
CS-231	ENST00000552222	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		18.3	■□□□□ 0.52
CS-231	ENST00000552222	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		18.3	■□□□□ 0.52
CS-231	ENST00000552222	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		18.3	■□□□□ 0.52
CS-231	ENST00000552222	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	18.29	■□□□□ 0.52
CS-231	ENST00000552222	NTSR2	O95665	410 aa		18.29	■□□□□ 0.52
CS-231	ENST00000552222	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	18.29	■□□□□ 0.52
CS-231	ENST00000552222	CSRNP1	Q96S65	589 aa		18.29	■□□□□ 0.52
CS-231	ENST00000552222	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		18.29	■□□□□ 0.52

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms