RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550159.5

CS-218, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-218ENST00000550159 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 IQCA1LA6NCM1 817 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 RASSF10A6NK89 507 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 NEFLP07196 543 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 TM4SF1P30408 202 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 RIC3Q7Z5B4 369 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 CHPF2Q9P2E5 772 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 HDAC5Q9UQL6 1122 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 USP16Q9Y5T5 823 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-218ENST00000550159 ZNF831Q5JPB2 1677 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 A1BGP04217 495 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 C2CD5Q86YS7 1000 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 TSPYL6Q8N831 410 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 CLEC11AQ9Y240 323 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 UBR2Q8IWV8 1755 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 H0YIN7 160 aa12.19□□□□□ -0.46
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CS-218ENST00000550159 KRT24Q2M2I5 525 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 MCOLN1Q9GZU1 580 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 TSKSQ9UJT2 592 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 FLIIQ13045 1269 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 GRM1Q13255 1194 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
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CS-218ENST00000550159 LAMB4A4D0S4 1761 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 TIAM2Q8IVF5 1701 aa12.17□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 RGL2O15211 777 aa12.17□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 C21orf2O43822 256 aa12.17□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 USPL1Q5W0Q7 1092 aa12.17□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 COPS6Q7L5N1 327 aa12.17□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 SSH1Q8WYL5 1049 aa12.17□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 ARHGAP45Q92619 1136 aa12.17□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa12.17□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 COL15A1P39059 1388 aa12.17□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 ERVV-1B6SEH8 477 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 NFIXQ14938 502 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 CLEC4GQ6UXB4 293 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 CNTROBQ8N137 903 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 PLBD2Q8NHP8 589 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 XAGE3Q8WTP9 111 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP12.16□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 CAPNS2Q96L46 248 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 BCL2L13Q9BXK5 485 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 TAOK3Q9H2K8 898 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 SERPINB2P05120 415 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 ECE1P42892 770 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 CCT4P50991 539 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 EIF5P55010 431 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 DGKZQ13574 1117 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
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CS-218ENST00000550159 SLC4A10Q6U841 1118 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 KSR2Q6VAB6 950 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
CS-218ENST00000550159 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 SETDB2Q96T68 719 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 NYXQ9GZU5 481 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 NARFQ9UHQ1 456 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 PARP10Q53GL7 1025 aa12.13□□□□□ -0.47
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CS-218ENST00000550159 ZBTB3Q9H5J0 574 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 HACL1Q9UJ83 578 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 TJP1Q07157 1748 aa12.12□□□□□ -0.47
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CS-218ENST00000550159 NBPF26B4DH59 902 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 BCAR3O75815 825 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 ANXA1P04083 346 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 EPHX2P34913 555 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 NBPF15Q8N660 670 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa12.12□□□□□ -0.47
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