RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542921.5

JMJD1C-210, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-210ENST00000542921 SERPINB6P35237 376 aa3.59□□□□□ -1.83
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JMJD1C-210ENST00000542921 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
JMJD1C-210ENST00000542921 AFAP1L1Q8TED9 768 aa3.59□□□□□ -1.83
JMJD1C-210ENST00000542921 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
JMJD1C-210ENST00000542921 LZTFL1Q9NQ48 299 aa3.59□□□□□ -1.83
JMJD1C-210ENST00000542921 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
JMJD1C-210ENST00000542921 FAN1Q9Y2M0 1017 aa3.59□□□□□ -1.83
JMJD1C-210ENST00000542921 CCDC171Q6TFL3 1326 aa3.59□□□□□ -1.83
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JMJD1C-210ENST00000542921 GOLGA6DP0CG33 693 aa3.59□□□□□ -1.83
JMJD1C-210ENST00000542921 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
JMJD1C-210ENST00000542921 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa3.59□□□□□ -1.83
JMJD1C-210ENST00000542921 CCDC183Q5T5S1 534 aa3.59□□□□□ -1.83
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JMJD1C-210ENST00000542921 ATPIF1Q9UII2 106 aa3.59□□□□□ -1.83
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JMJD1C-210ENST00000542921 PIP4K2BP78356 416 aa3.59□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 MXRA7P84157 204 aa3.59□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 ZMYND11Q15326 602 aa3.59□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 CCDC150Q8NCX0 1101 aa3.59□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF653Q96CK0 615 aa3.59□□□□□ -1.84
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JMJD1C-210ENST00000542921 SPATA32Q96LK8 384 aa3.59□□□□□ -1.84
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JMJD1C-210ENST00000542921 MIS12Q9H081 205 aa3.59□□□□□ -1.84
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JMJD1C-210ENST00000542921 TOMM22Q9NS69 142 aa3.59□□□□□ -1.84
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JMJD1C-210ENST00000542921 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
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JMJD1C-210ENST00000542921 CEP104O60308 925 aa3.58□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 ZEB2O60315 1214 aa3.58□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 PSMD7P51665 324 aa3.58□□□□□ -1.84
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JMJD1C-210ENST00000542921 VPS16Q9H269 839 aa3.58□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 HAUS2Q9NVX0 235 aa3.58□□□□□ -1.84
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JMJD1C-210ENST00000542921 AAMPQ13685 434 aa3.58□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 POTEEQ6S8J3 1075 aa3.58□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 CATSPER3Q86XQ3 398 aa3.58□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 CCDC125Q86Z20 511 aa3.58□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 BRF1Q92994 677 aa3.58□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 DRC1Q96MC2 740 aa3.58□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 TRIM7Q9C029 511 aa3.58□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa3.58□□□□□ -1.84
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