RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542322.5

GRAMD2B-218, Transcript of GRAM domain containing 2B, humanhuman

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Gene GRAMD2B, Length 2,977 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD2B-218ENST00000542322 MCM2P49736 904 aa21.59■■□□□ 1.05
GRAMD2B-218ENST00000542322 ERC1Q8IUD2 1116 aa21.59■■□□□ 1.05
GRAMD2B-218ENST00000542322 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
GRAMD2B-218ENST00000542322 PDRG1Q9NUG6 133 aa21.59■■□□□ 1.05
GRAMD2B-218ENST00000542322 CNPY2Q9Y2B0 182 aa21.59■■□□□ 1.05
GRAMD2B-218ENST00000542322 ERBB4Q15303 1308 aa21.59■■□□□ 1.05
GRAMD2B-218ENST00000542322 PTMSP20962 102 aa21.58■■□□□ 1.05
GRAMD2B-218ENST00000542322 LMBR1LQ6UX01 489 aa21.58■■□□□ 1.05
GRAMD2B-218ENST00000542322 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
GRAMD2B-218ENST00000542322 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
GRAMD2B-218ENST00000542322 EVA1CP58658 441 aa21.57■■□□□ 1.04
GRAMD2B-218ENST00000542322 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
GRAMD2B-218ENST00000542322 CADPS2Q86UW7 1296 aa21.57■■□□□ 1.04
GRAMD2B-218ENST00000542322 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
GRAMD2B-218ENST00000542322 AOX1Q06278 1338 aa21.57■■□□□ 1.04
GRAMD2B-218ENST00000542322 TTC41PQ6P2S7 1318 aa21.57■■□□□ 1.04
GRAMD2B-218ENST00000542322 BRD1O95696 1058 aa21.57■■□□□ 1.04
GRAMD2B-218ENST00000542322 DCAF5Q96JK2 942 aa21.57■■□□□ 1.04
GRAMD2B-218ENST00000542322 DBNDD2Q9BQY9 259 aa21.57■■□□□ 1.04
GRAMD2B-218ENST00000542322 LRRC2Q9BYS8 371 aa21.57■■□□□ 1.04
GRAMD2B-218ENST00000542322 EVI5LQ96CN4 794 aa21.56■■□□□ 1.04
GRAMD2B-218ENST00000542322 FAM173BQ6P4H8 233 aa21.56■■□□□ 1.04
GRAMD2B-218ENST00000542322 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
GRAMD2B-218ENST00000542322 KDM3BQ7LBC6 1761 aa21.55■■□□□ 1.04
GRAMD2B-218ENST00000542322 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
GRAMD2B-218ENST00000542322 PLCB2Q00722 1185 aa21.55■■□□□ 1.04
GRAMD2B-218ENST00000542322 CUL4AQ13619 759 aa21.55■■□□□ 1.04
GRAMD2B-218ENST00000542322 USP48Q86UV5 1035 aa21.55■■□□□ 1.04
GRAMD2B-218ENST00000542322 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa21.55■■□□□ 1.04
GRAMD2B-218ENST00000542322 TIMM10P62072 90 aa21.54■■□□□ 1.04
GRAMD2B-218ENST00000542322 MTX1Q13505 466 aa21.54■■□□□ 1.04
GRAMD2B-218ENST00000542322 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
GRAMD2B-218ENST00000542322 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa21.54■■□□□ 1.04
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GRAMD2B-218ENST00000542322 CCDC171Q6TFL3 1326 aa21.54■■□□□ 1.04
GRAMD2B-218ENST00000542322 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
GRAMD2B-218ENST00000542322 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.53■■□□□ 1.04
GRAMD2B-218ENST00000542322 SYT1P21579 422 aa21.53■■□□□ 1.04
GRAMD2B-218ENST00000542322 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.53■■□□□ 1.04
GRAMD2B-218ENST00000542322 MST1RQ04912 1400 aa21.52■■□□□ 1.04
GRAMD2B-218ENST00000542322 ESPNB1AK53 854 aa21.52■■□□□ 1.04
GRAMD2B-218ENST00000542322 NBPF26B4DH59 902 aa21.52■■□□□ 1.04
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GRAMD2B-218ENST00000542322 NBPF15Q8N660 670 aa21.52■■□□□ 1.04
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GRAMD2B-218ENST00000542322 NCAPD2Q15021 1401 aa21.52■■□□□ 1.03
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GRAMD2B-218ENST00000542322 LMO7Q8WWI1 1683 aa21.51■■□□□ 1.03
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GRAMD2B-218ENST00000542322 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
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GRAMD2B-218ENST00000542322 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa21.49■■□□□ 1.03
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GRAMD2B-218ENST00000542322 SLC27A2O14975 620 aa21.48■■□□□ 1.03
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GRAMD2B-218ENST00000542322 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
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GRAMD2B-218ENST00000542322 LRRC24Q50LG9 513 aa21.48■■□□□ 1.03
GRAMD2B-218ENST00000542322 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
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GRAMD2B-218ENST00000542322 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa21.47■■□□□ 1.03
GRAMD2B-218ENST00000542322 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
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GRAMD2B-218ENST00000542322 SYNE4Q8N205 404 aa21.46■■□□□ 1.03
GRAMD2B-218ENST00000542322 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
GRAMD2B-218ENST00000542322 CHST3Q7LGC8 479 aa21.46■■□□□ 1.03
GRAMD2B-218ENST00000542322 NECTIN1Q15223 517 aa21.45■■□□□ 1.03
GRAMD2B-218ENST00000542322 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
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GRAMD2B-218ENST00000542322 ZNF445P59923 1031 aa21.44■■□□□ 1.02
GRAMD2B-218ENST00000542322 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
GRAMD2B-218ENST00000542322 USP54Q70EL1 1684 aa21.44■■□□□ 1.02
GRAMD2B-218ENST00000542322 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
GRAMD2B-218ENST00000542322 GORABQ5T7V8 394 aa21.43■■□□□ 1.02
GRAMD2B-218ENST00000542322 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.43■■□□□ 1.02
GRAMD2B-218ENST00000542322 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.43■■□□□ 1.02
GRAMD2B-218ENST00000542322 C5P01031 1676 aa21.43■■□□□ 1.02
GRAMD2B-218ENST00000542322 MBD3O95983 291 aa21.42■■□□□ 1.02
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