RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DXOO77932 396 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NEFMP07197 916 aa7.41□□□□□ -1.22
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KCTD17Q8N5Z5 321 aa7.41□□□□□ -1.22
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IRF7Q92985 503 aa7.41□□□□□ -1.22
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PIK3C2AO00443 1686 aa7.4□□□□□ -1.22
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USP31Q70CQ4 1352 aa7.4□□□□□ -1.22
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LTBP4Q8N2S1 1624 aa7.4□□□□□ -1.22
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGSF3O75054 1194 aa7.4□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 JUNDP17535 347 aa7.4□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCDC184Q52MB2 194 aa7.4□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NUTM2GQ5VZR2 741 aa7.4□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USP54Q70EL1 1684 aa7.4□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LTN1O94822 1766 aa7.4□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AATKQ6ZMQ8 1374 aa7.4□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SSH2Q76I76 1423 aa7.39□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZBTB7CA1YPR0 619 aa7.39□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RPIAP49247 311 aa7.39□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AMPHP49418 695 aa7.39□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 QPCTQ16769 361 aa7.39□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BRINP3Q76B58 766 aa7.39□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRR7Q8TB68 274 aa7.39□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CABLES1Q8TDN4 633 aa7.39□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SBNO1A3KN83 1393 aa7.39□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KCNMA1Q12791 1236 aa7.38□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PLA2G2CQ5R387 149 aa7.38□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARHGEF10O15013 1369 aa7.38□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa7.38□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OVOS2Q6IE36 1432 aa7.38□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NPAS3Q8IXF0 933 aa7.38□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 POLKQ9UBT6 870 aa7.38□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ALS2Q96Q42 1657 aa7.38□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NHSL1Q5SYE7 1610 aa7.37□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa7.37□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CFAP99D6REC4 459 aa7.37□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LILRB3O75022 631 aa7.37□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 INSRP06213 1382 aa7.37□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TNS3Q68CZ2 1445 aa7.37□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IQSEC2Q5JU85 1478 aa7.37□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UBAP1LF5GYI3 381 aa7.36□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRAK2O60296 914 aa7.36□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DESI1Q6ICB0 168 aa7.36□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GOPCQ9HD26 462 aa7.36□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ADAMTS8Q9UP79 889 aa7.36□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa7.36□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa7.36□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KIF24Q5T7B8 1368 aa7.36□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PHLPP1O60346 1717 aa7.36□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PIP4K2BP78356 416 aa7.35□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NGEFQ8N5V2 710 aa7.35□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RGS22Q8NE09 1264 aa7.35□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NUDT12Q9BQG2 462 aa7.35□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa7.35□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SHPRHQ149N8 1683 aa7.35□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PXDNQ92626 1479 aa7.35□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FLT4P35916 1363 aa7.35□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GCP02774 474 aa7.35□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FBLN1P23142 703 aa7.35□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PTPRNQ16849 979 aa7.35□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCDC24Q8N4L8 307 aa7.35□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ANP32EQ9BTT0 268 aa7.35□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RTL1A6NKG5 1358 aa7.34□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PNPLA6Q8IY17 1366 aa7.34□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAP3K19Q56UN5 1328 aa7.34□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TSC1Q92574 1164 aa7.34□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RUNDC1Q96C34 613 aa7.34□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RGPD5Q99666 1765 aa7.34□□□□□ -1.23
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZBED9Q6R2W3 1325 aa7.33□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCNYL3P0C7X3 344 aa7.33□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IP6K1Q92551 441 aa7.33□□□□□ -1.24
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