RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534197.5

GNPTG-209, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunit gamma, human

TSL 3

Gene GNPTG, Length 420 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNPTG-209	ENST00000534197	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.22
GNPTG-209	ENST00000534197	NEUROD2	Q15784	382 aa		28.95	■■■□□ 2.22
GNPTG-209	ENST00000534197	CHADL	Q6NUI6	762 aa		28.95	■■■□□ 2.22
GNPTG-209	ENST00000534197	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	28.94	■■■□□ 2.22
GNPTG-209	ENST00000534197	KRT24	Q2M2I5	525 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GNPTG-209	ENST00000534197	NECTIN2	Q92692	538 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GNPTG-209	ENST00000534197	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GNPTG-209	ENST00000534197	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		28.93	■■■□□ 2.22
GNPTG-209	ENST00000534197	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	28.93	■■■□□ 2.22
GNPTG-209	ENST00000534197	FZD9	O00144	591 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GNPTG-209	ENST00000534197	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
GNPTG-209	ENST00000534197	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GNPTG-209	ENST00000534197	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		28.91	■■■□□ 2.22
GNPTG-209	ENST00000534197	PSMD1	Q99460	953 aa		28.91	■■■□□ 2.22
GNPTG-209	ENST00000534197	LAMB2	P55268	1798 aa		28.9	■■■□□ 2.22
GNPTG-209	ENST00000534197	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		28.9	■■■□□ 2.22
GNPTG-209	ENST00000534197	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		28.89	■■■□□ 2.22
GNPTG-209	ENST00000534197	CHL1	O00533	1208 aa		28.89	■■■□□ 2.22
GNPTG-209	ENST00000534197	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
GNPTG-209	ENST00000534197	PARP10	Q53GL7	1025 aa		28.88	■■■□□ 2.21
GNPTG-209	ENST00000534197	COPS6	Q7L5N1	327 aa		28.88	■■■□□ 2.21
GNPTG-209	ENST00000534197	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		28.88	■■■□□ 2.21
GNPTG-209	ENST00000534197	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		28.88	■■■□□ 2.21
GNPTG-209	ENST00000534197	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
GNPTG-209	ENST00000534197	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
GNPTG-209	ENST00000534197	LDHD	Q86WU2	507 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GNPTG-209	ENST00000534197	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GNPTG-209	ENST00000534197	RUNDC1	Q96C34	613 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GNPTG-209	ENST00000534197	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
GNPTG-209	ENST00000534197	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GNPTG-209	ENST00000534197	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GNPTG-209	ENST00000534197	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		28.86	■■■□□ 2.21
GNPTG-209	ENST00000534197	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		28.86	■■■□□ 2.21
GNPTG-209	ENST00000534197	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
GNPTG-209	ENST00000534197	TAF1	P21675	1872 aa		28.86	■■■□□ 2.21
GNPTG-209	ENST00000534197	PASK	Q96RG2	1323 aa		28.86	■■■□□ 2.21
GNPTG-209	ENST00000534197	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
GNPTG-209	ENST00000534197	HACL1	Q9UJ83	578 aa		28.85	■■■□□ 2.21
GNPTG-209	ENST00000534197	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
GNPTG-209	ENST00000534197	LTBP1	Q14766	1721 aa		28.85	■■■□□ 2.21
GNPTG-209	ENST00000534197	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
GNPTG-209	ENST00000534197	NLRP3	Q96P20	1036 aa		28.84	■■■□□ 2.21
GNPTG-209	ENST00000534197	CREBZF	Q9NS37	354 aa		28.84	■■■□□ 2.21
GNPTG-209	ENST00000534197	EPHX2	P34913	555 aa		28.83	■■■□□ 2.21
GNPTG-209	ENST00000534197	ZNF428	Q96B54	188 aa		28.83	■■■□□ 2.21
GNPTG-209	ENST00000534197	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2
GNPTG-209	ENST00000534197	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	28.82	■■■□□ 2.2	7e-6	■■■■■ 27.3
GNPTG-209	ENST00000534197	NLRP10	Q86W26	655 aa		28.82	■■■□□ 2.2
GNPTG-209	ENST00000534197	GPC2	Q8N158	579 aa		28.82	■■■□□ 2.2
GNPTG-209	ENST00000534197	JDP2	Q8WYK2	163 aa		28.82	■■■□□ 2.2
GNPTG-209	ENST00000534197	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	28.82	■■■□□ 2.2
GNPTG-209	ENST00000534197	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
GNPTG-209	ENST00000534197	ABCC4	O15439	1325 aa		28.81	■■■□□ 2.2
GNPTG-209	ENST00000534197	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		28.81	■■■□□ 2.2
GNPTG-209	ENST00000534197	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
GNPTG-209	ENST00000534197	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
GNPTG-209	ENST00000534197	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
GNPTG-209	ENST00000534197	TCIRG1	Q13488	830 aa		28.8	■■■□□ 2.2
GNPTG-209	ENST00000534197	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		28.79	■■■□□ 2.2
GNPTG-209	ENST00000534197	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
GNPTG-209	ENST00000534197	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		28.78	■■■□□ 2.2
GNPTG-209	ENST00000534197	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		28.78	■■■□□ 2.2
GNPTG-209	ENST00000534197	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		28.78	■■■□□ 2.2
GNPTG-209	ENST00000534197	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
GNPTG-209	ENST00000534197	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		28.77	■■■□□ 2.2
GNPTG-209	ENST00000534197	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		28.77	■■■□□ 2.2
GNPTG-209	ENST00000534197	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	28.77	■■■□□ 2.2
GNPTG-209	ENST00000534197	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
GNPTG-209	ENST00000534197	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		28.76	■■■□□ 2.19
GNPTG-209	ENST00000534197	SCNN1D	P51172	638 aa		28.75	■■■□□ 2.19
GNPTG-209	ENST00000534197	AOC3	Q16853	763 aa		28.75	■■■□□ 2.19
GNPTG-209	ENST00000534197	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
GNPTG-209	ENST00000534197	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
GNPTG-209	ENST00000534197	CNTNAP1	P78357	1384 aa		28.74	■■■□□ 2.19
GNPTG-209	ENST00000534197	PPIP5K2	O43314	1243 aa		28.73	■■■□□ 2.19
GNPTG-209	ENST00000534197	EPS15	P42566	896 aa		28.73	■■■□□ 2.19
GNPTG-209	ENST00000534197	CNTROB	Q8N137	903 aa		28.73	■■■□□ 2.19
GNPTG-209	ENST00000534197	CFAP44	Q96MT7	982 aa		28.73	■■■□□ 2.19
GNPTG-209	ENST00000534197	MBIP	Q9NS73	344 aa		28.73	■■■□□ 2.19
GNPTG-209	ENST00000534197	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		28.72	■■■□□ 2.19
GNPTG-209	ENST00000534197	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		28.72	■■■□□ 2.19
GNPTG-209	ENST00000534197	COL4A1	P02462	1669 aa		28.71	■■■□□ 2.19
GNPTG-209	ENST00000534197	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		28.71	■■■□□ 2.19
GNPTG-209	ENST00000534197	HOXB7	P09629	217 aa		28.71	■■■□□ 2.19
GNPTG-209	ENST00000534197	NIM1K	Q8IY84	436 aa		28.71	■■■□□ 2.19
GNPTG-209	ENST00000534197	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		28.71	■■■□□ 2.19
GNPTG-209	ENST00000534197	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	28.71	■■■□□ 2.19
GNPTG-209	ENST00000534197	BBOX1	O75936	387 aa		28.7	■■■□□ 2.18
GNPTG-209	ENST00000534197	ZNF853	P0CG23	659 aa		28.7	■■■□□ 2.18
GNPTG-209	ENST00000534197	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		28.7	■■■□□ 2.18
GNPTG-209	ENST00000534197	SP8	Q8IXZ3	490 aa		28.7	■■■□□ 2.18
GNPTG-209	ENST00000534197	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		28.7	■■■□□ 2.18
GNPTG-209	ENST00000534197	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		28.69	■■■□□ 2.18
GNPTG-209	ENST00000534197	APAF1	O14727	1248 aa		28.69	■■■□□ 2.18
GNPTG-209	ENST00000534197	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	28.69	■■■□□ 2.18
GNPTG-209	ENST00000534197	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	28.68	■■■□□ 2.18
GNPTG-209	ENST00000534197	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GNPTG-209	ENST00000534197	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GNPTG-209	ENST00000534197	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
GNPTG-209	ENST00000534197	VEGFB	P49765	207 aa		28.67	■■■□□ 2.18

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms