RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529893.5

GMDS-AS1-205, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 900 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-205ENST00000529893 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
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GMDS-AS1-205ENST00000529893 COL4A5P29400 1685 aa21.95■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-205ENST00000529893 SYNE4Q8N205 404 aa21.95■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-205ENST00000529893 ZNF541Q9H0D2 1346 aa21.95■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-205ENST00000529893 CHADLQ6NUI6 762 aa21.94■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-205ENST00000529893 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.94■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-205ENST00000529893 PSMD1Q99460 953 aa21.94■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-205ENST00000529893 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.94■■□□□ 1.1
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GMDS-AS1-205ENST00000529893 PARP10Q53GL7 1025 aa21.93■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-205ENST00000529893 SLC51AQ86UW1 340 aa21.93■■□□□ 1.1
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GMDS-AS1-205ENST00000529893 FZD9O00144 591 aa21.92■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-205ENST00000529893 KRT24Q2M2I5 525 aa21.92■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-205ENST00000529893 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa21.92■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-205ENST00000529893 RUNDC1Q96C34 613 aa21.92■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-205ENST00000529893 CRAMP1Q96RY5 1269 aa21.92■■□□□ 1.1
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GMDS-AS1-205ENST00000529893 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa21.91■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-205ENST00000529893 NECTIN2Q92692 538 aa21.91■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-205ENST00000529893 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
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GMDS-AS1-205ENST00000529893 COPS6Q7L5N1 327 aa21.9■■□□□ 1.1
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GMDS-AS1-205ENST00000529893 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.89■■□□□ 1.09
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GMDS-AS1-205ENST00000529893 NLRP3Q96P20 1036 aa21.88■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-205ENST00000529893 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
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GMDS-AS1-205ENST00000529893 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-205ENST00000529893 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-205ENST00000529893 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-205ENST00000529893 GRIPAP1Q4V328 841 aa21.87■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-205ENST00000529893 NLRP10Q86W26 655 aa21.87■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-205ENST00000529893 HACL1Q9UJ83 578 aa21.87■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-205ENST00000529893 GPC2Q8N158 579 aa21.86■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-205ENST00000529893 JDP2Q8WYK2 163 aa21.86■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-205ENST00000529893 CREBZFQ9NS37 354 aa21.86■■□□□ 1.09
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GMDS-AS1-205ENST00000529893 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.85■■□□□ 1.09
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GMDS-AS1-205ENST00000529893 TCIRG1Q13488 830 aa21.85■■□□□ 1.09
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GMDS-AS1-205ENST00000529893 CHPF2Q9P2E5 772 aa21.85■■□□□ 1.09
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GMDS-AS1-205ENST00000529893 CCDC184Q52MB2 194 aa21.82■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-205ENST00000529893 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-205ENST00000529893 CFAP44Q96MT7 982 aa21.82■■□□□ 1.08
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GMDS-AS1-205ENST00000529893 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.81■■□□□ 1.08
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GMDS-AS1-205ENST00000529893 SH3TC1Q8TE82 1336 aa21.8■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-205ENST00000529893 ZNF853P0CG23 659 aa21.79■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-205ENST00000529893 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.79■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-205ENST00000529893 MBIPQ9NS73 344 aa21.79■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-205ENST00000529893 CLEC11AQ9Y240 323 aa21.79■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-205ENST00000529893 GJA3Q9Y6H8 435 aa21.79■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-205ENST00000529893 BBOX1O75936 387 aa21.78■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-205ENST00000529893 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-205ENST00000529893 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-205ENST00000529893 SCNN1DP51172 638 aa21.78■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-205ENST00000529893 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.78■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-205ENST00000529893 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.78■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-205ENST00000529893 SP8Q8IXZ3 490 aa21.78■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-205ENST00000529893 ZNF428Q96B54 188 aa21.78■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-205ENST00000529893 ISCA1Q9BUE6 129 aa21.78■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-205ENST00000529893 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-205ENST00000529893 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-205ENST00000529893 COL4A1P02462 1669 aa21.78■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-205ENST00000529893 DUOX1Q9NRD9 1551 aa21.78■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-205ENST00000529893 CNTNAP1P78357 1384 aa21.77■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-205ENST00000529893 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-205ENST00000529893 PPIP5K2O43314 1243 aa21.77■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-205ENST00000529893 AOC3Q16853 763 aa21.77■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-205ENST00000529893 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-205ENST00000529893 VPS33BQ9H267 617 aa21.77■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-205ENST00000529893 APAF1O14727 1248 aa21.76■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-205ENST00000529893 NIM1KQ8IY84 436 aa21.76■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-205ENST00000529893 CNTROBQ8N137 903 aa21.76■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-205ENST00000529893 TMEM88BA6NKF7 163 aa21.75■■□□□ 1.07
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